A tensa situação foi agravada pela economia, que entrou em colapso ainda mais esse ano, como quase todos os subsídios de longa data sobre os alimentos foram eliminados. As esperanças muitos colocados na figura aparentemente imaculada de Boudiaf logo foram frustradas quando ele caiu de uma bala de um de seus próprios guardas de segurança no final de junho. Logo em seguida, Abbassi Madani e Ali Belhadj foram condenados a 12 anos de prisão.
Até 26 de Agosto tornou-se evidente que alguns guerrilheiros estavam começando a atacar civis, bem como os números do governo: o bombardeio da Ao aeroporto de Argel alegou 9 vidas e feriu 128 pessoas. A FIS condenou o atentado junto com os outros grandes partidos, mas a influência do FIS sobre a guerrilha acabou por ser limitada.
A luta inicial parece ter sido conduzido por um pequeno grupo extremista Takfir wal Hijra e ex-combatentes afegãos associados. No entanto, o primeiro movimento armado principal a surgir, a partir quase imediatamente após o golpe, foi o Movimento Islâmico Armado (MIA). Foi liderada pelo ex-soldado Abdelkader Chebouti, um islamista de longa data que manteve sua distância do FIS durante o processo eleitoral. Em fevereiro de 1992, o ex-soldado, lutador ex-afegã, e ex-chefe de segurança FIS Disse Mekhloufi fundou a Movimento por um Estado Islâmico (MEI). Os vários grupos organizados vários encontros para tentar unir suas forças, aceitando a liderança global da Chebouti na teoria. No último destes, em Tamesguida em 1 de setembro, Chebouti expressou sua preocupação sobre a falta do movimento de disciplina, em particular preocupante que o ataque ao aeroporto de Argel, que ele não tinha aprovado, poderia alienar apoiantes. Takfir wal Hijra e os afegãos (liderados por Noureddine Seddiki) responderam ao concordar em se juntar ao MIA. No entanto, a reunião foi interrompida por um assalto das forças de segurança, provocando suspeitas que impediam quaisquer outras reuniões.
O próprio FIS estabelecida uma rede subterrânea, com jornais clandestinos e até mesmo uma estação de rádio MIA-ligados, e começou a emitir declarações oficiais do exterior a partir do final de 1992. No entanto, nesta fase, os pareceres dos movimentos de guerrilha no FIS foram misturados; enquanto muitos suportado FIS, uma facção significativa, liderada pelos "afegãos", a atividade política do partido consideradas como inerentemente anti-islâmica e, portanto, rejeitou declarações FIS.