Entre os aspectos negativos, destaca-se a redução da STCP a empresa do concelho do Porto, «apenas com algumas ligações a concelhos limítrofes», não acautelando a sobreposição de serviço privado nessas ligações, com o risco de, a prazo, haver prejuízos que serão assumidos pelos municípios.
O PCP critica também o facto de o documento ser omisso quanto às «centenas de milhares de euros que há vários anos os privados acumulam de serviços que prestam em zona exclusiva da STCP», da mesma forma que «não salvaguarda o envolvimento do Governo em futuros investimentos mais significativos para os quais os municípios não têm capacidade financeira, como será o caso da renovação de frota».