As camadas de significado da Epístola Esmeralda foram associadas à criação da Pedra Filosofal, à experimentação laboratorial, à transição de fase, ao Magnum Opus Alquímico, ao antigo sistema de elementos clássicos e à correspondência que interconecta todas as coisas entre o macrocosmo e o microcosmo.
Thoth encarnou como um sacerdote egípcio repetidamente durante o tempo em que as Escolas de Mistério estavam florescendo na cultura egípcia durante o Império do Meio. Isso foi para manter o controle sobre a conspiração da Atlântida realizada pela NAA desde o Dilúvio, e para manter-se ciente da missão da Aliança da Guarda em andamento, que Hatshepsut, Akhenaton e outros haviam aceitado.