ReP USP - Detalhe do registro: Influência da hiperglicemia sobre os perfis de expressão transcricional de mRNAs e microRNAs em linfócitos de pacientes com Diabetes Mellitus tipo 2
Influência da hiperglicemia sobre os perfis de expressão transcricional de mRNAs e microRNAs em linfócitos de pacientes com Diabetes Mellitus tipo 2 (2013)
USP affiliated author: XAVIER, DANILO JORDÃO - FMRP
Subjects: DIABETES MELLITUS; HIPERGLICEMIA; EXPRESSÃO GÊNICA
Abstract: O Diabetes Mellitus é uma das maiores causas de morte no mundo. O desenvolvimento do Diabetes Mellitus tipo 2 (DM2) está relacionado com uma série de fatores genéticos e ambientais, culminando com o desenvolvimento do DM2. Já a hiperglicemia, característica marcante da doença, está associada a uma série de complicações metabólicas e comorbidades. No entanto, não se sabe a influência de um controle apropriado da doença, com menores níveis glicêmicos. No presente trabalho, foi utilizada a técnica de microarrays para comparar os perfis transcricionais (mRNA e microRNA) de células mononucleares de sangue periférico (PBMCs) em três grupos distintos: um grupo de pacientes DM2 descompensados (DM2-D, n=13); um grupo de pacientes DM2 compensados (DM2-C, n=14), e um grupo controle (n=10). Os dados foram analisados por meio de duas linguagens de programação: R e PERL. Após a extração dos dados utilizando-se o software Feature Extraction, versão 10.7 (Agilent Techonologies), foram realizadas correção do background, exclusão dos outliers, normalização dos dados pelo método quantile e, por fim, o ajuste de variações não-biológicas. Os dados foram então submetidos a análise estatística rank products, sendo identificados 415 mRNAs diferencialmente expressos no grupo DM2-C relativamente aos controles, 285 no grupo DM2-D em comparação aos controles e 478 em pacientes DM2-D comparados aos DM2-C. Posteriormente, os genes diferencialmente expressos foram submetidos à analise de enriquecimento funcional (DAVID). Foram encontrados 22 e 56 termos biológicos enriquecidos (p-corrigido Benjamini-Hochberg < 0,05) para as comparações DM2-C versus controle e pacientes DM2-D versus DM2-C, respectivamente. Em ambas as comparações, um processo biológico foi considerado de interesse para o presente trabalho: resposta inflamatória. Na análise por GSEA e GSA, foram identificados 110 grupos gênicosdiferencialmente expressos na comparação DM2-C versus controle. Já para a comparação DM2-D versus controles foram encontrados 297 grupos gênicos diferencialmente expressos, enquanto que na comparação DM2-D versus DM2-C, 161 grupos gênicos diferencialmente expressos. Dentre os grupos gênicos diferencialmente expressos, três merecem destaque: regulação do reparo do DNA (GO: 0006282), resposta ao superóxido (GO: 0000303) e resposta ao estresse do reticulo endoplasmático (GO: 0034976). Ainda, 97 microRNAs foram diferencialmente expressos na comparação DM2-C versas controles, 54 na comparação DM2-D versus controles e 101 na comparação DM2-D versas DM2-C. Assim, diferentes grupos gênicos provavelmente foram modulados pela hiperglicemia, além de terem sido descobertos novos microRNAs relacionados a altos níveis de glicose
XAVIER, Danilo Jordão. Influência da hiperglicemia sobre os perfis de expressão transcricional de mRNAs e microRNAs em linfócitos de pacientes com Diabetes Mellitus tipo 2. 2013. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto, 2013. . Acesso em: 07 jul. 2022.
Xavier, D. J. (2013). Influência da hiperglicemia sobre os perfis de expressão transcricional de mRNAs e microRNAs em linfócitos de pacientes com Diabetes Mellitus tipo 2 (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, Ribeirão Preto.
Xavier DJ. Influência da hiperglicemia sobre os perfis de expressão transcricional de mRNAs e microRNAs em linfócitos de pacientes com Diabetes Mellitus tipo 2. 2013 ;[citado 2022 jul. 07 ]
Influência da hiperglicemia nos níveis de dano no DNA e na expressão de genes de defesa ao dano oxidativo em pacientes com diabetes mellitus tipo 2