Desde 2017, o Cremers, em fiscalização rotineira na Santa Casa, verificou que não estavam sendo seguidas as determinações da Resolução CFM nº 2.147/16, que estabelece normas sobre as atribuições dos diretores clínicos e chefes de serviço, acerca da necessidade de eleição do diretor clínico. A partir de então, a instituição tem sido notificada a cumprir a norma. A partir de 2018, com a edição da Resolução Cremers nº 02/2018, que trata do regimento interno padrão a ser seguido pelos corpos clínicos dos estabelecimentos de saúde, a Santa Casa passou a ferir a normativa do Conselho Regional.
No começo deste ano, o hospital ajuizou ação judicial para que o CFM e o Cremers se abstivessem de realizar sindicâncias contra o diretor técnico da instituição, por este não realizar eleição para a diretoria clínica prevista e ofertar cursos de pós-graduação a concluintes de cursos de medicina estrangeiros, contrariando a Resolução CFM 2.147/16. A ação também pleiteiava que o diretor técnico não fosse responsabilizado pelo não cumprimento do Regimento Interno Padrão do Corpo Clínico, previsto na Resolução Cremers nº 02/2018.