O EMDR, então, age tanto sobre a ferida traumática quanto sobre o conflito que dela surge, tornando-se uma abordagem terapêutica completa e rápida. O Modelo do Processamento Acelerado de Informações foi desenvolvido para explicar a rapidez com que foram obtidos resultados clínicos com o EMDR e a consistência de muitos padrões de respostas a este.
Este modelo considera que a maioria das patologias deriva de experiências anteriores de vida que põem em movimento um padrão continuado de afetos, comportamentos, cognições e conseqüentes estruturas de identidade. Desde casos simples de Transtorno de Estresse Pós Traumático e Fobias e Hábitos indesejados, até situações mais complexas, tais como Transtornos de Pânico, algumas formas de Depressão, Dissociações, Transtornos de Personalidade, a patologia é encarada como configurada pelo impacto das experiências remotas que são mantidas no sistema nervoso numa forma estado-específica.
A natureza disfuncional das memórias traumáticas, incluindo a forma como são armazenadas, permite que afetos e crenças negativas do passado penetrem na vida presente da pessoa. O processamento de tais memórias por meio do EMDR possibilita que os afetos e as cognições presentes, mais positivos e fortalecedores, se difundam pelas memórias associadas, por toda a rede neural, levando o cliente a comportamentos espontâneos mais adequados. As patologias clínicas são, portanto, entendidas como passíveis de mudança, se o clínico focalizar de forma apropriada a informação que foi armazenada de maneira disfuncional no sistema nervoso.
Após o tratamento com EMDR as memórias são armazenadas com uma memória menos perturbadora, com uma cognição positiva e com o afeto apropriado. Os flashbacks e os pensamentos intrusivos são completamente eliminados ou decrescem muito em número, sendo que quando ocorrem, surgem sem ansiedade. Além disso, não há mais quaisquer sensações físicas perturbadoras acompanhando tais memórias. Quando as memórias específicas são reprocessadas, o senso de auto-valorizaçao e auto-eficácia do paciente sofre uma transformação automática.