O quadro São Francisco em meditação, curiosamente com um crânio nas mãos, possui uma cópia idêntica que se encontra “sob os cuidados” da Galleria Nazionale di Arte Antica. O quadro que é de 1605, foi encomendado a Caravaggio para ser colocado ali no Convento dos Capuchinhos.
Já aquele que está na Galeria Nacional de Arte Antiga faz parte de um caso que acabou em pizza: por acaso foi encontrado esse quadro, em 1968, em uma igrejinha de uma “charmosa cidadezinha de fim-do-mundo” no sul de Roma, mais ou menos a caminho de Nápoles. Com a desculpa de analisar o quadro, a obra foi trazida para Roma e nunca mais foi devolvida à igreja. A cidade de Carpineto Romano tem feito inúmeros pedidos para que o quadro seja devolvido, inclusive para atrair turistas à cidade.
Para botar ainda mais lenha na fogueira, muitos acreditam que dos dois quadros idênticos, aquele de Carpineto (e agora na Galeria Nacional de Arte Antiga) foi pintado pelo próprio Caravaggio, e que o quadro do convento dos Capuchinhos provavelmente foi um esboço, na verdade terminado por um dos aprendizes que trabalhavam com o artista.
Antes de chegar ao ossário, a última sala do museu mostra alguns frades capuchinhos famosos no mundo, e inclusive aqueles beatificados e santificados como Padre Pio, um dos frades mais venerados (quando ainda em vida) aqui do sul da Itália. O santuário de Padre Pio é um dos mais visitados aqui do país.