Se me lembro bem, Zelda Skyward Sword, diferente de Twilight Princess, e muitos outros jogos de wii, não usa o pointer. Tudo é com base no giroscopico, incluindo escolher opções na hora de um diálogo, por exemplo. E ai, nesse caso, imagino que os joycons sejam melhores.
A maioria desses jogos de minigames (ou micro no caso) eu colocaria nos outros 30% dos jogos do console. Problemas costumam aparecer mesmo em jogos que um possuem um sistema tradicional de movimento, mas usam os sensores para alguma outra ação, como por exemplo controlar uma lanterna ou atacar.