O vulcanismo na região é desencadeada pela subducção da placa de Nazca sob a placa da América do Sul; magmas formados a partir do processo de subducción desencadear a fusão da crosta. As grandes caldeiras estão localizados a leste da principal arco vulcânico da Zona Vulcânica Central, Panizos sendo 150 quilômetros (93 milhas) a leste do arco principal. Vulcanismo na região é fortemente dominada por rochas vulcânicas silícico calderic com volumes de 6.000 quilômetros cúbicos (1.400 cu mi) contrastantes para menos de 1.000 quilômetros cúbicos (240 cu mi) andesitos.
O vulcão faz parte do chamado estanho cinto , um território em Andes onde depósitos minerais grande estanho são encontrados em rochas de granito e extrusivos, formado a partir de reacções que envolvem a sulfidação os numerosos vulcões na área. Magmas no território são derivados de fraccionamento de cristal e foram fortemente modificada por interacções com a crosta que atinge uma espessura de 70 km (43 milhas) por baixo da zona central vulcânica.
Investigação por SL de Silva indica que antes de 10 actividade vulcânica mya já existia norte de 20 ° 30' em forma do Oxaya e Altos de Pica ignimbritos. As alterações na actividade mya subducción 12-10 causou um encurtamento e engrossamento da crosta em Andes centrais e a formação de zonas de fusão na crosta mais profunda, está relacionado com a fase de quíchua orogenese andina. Uma vez que 10,6 milhões de anos atrás estes subiu para a superfície, formando câmaras de magma e caldeiras. As erupções de ignimbritos Panizos coincidir com grandes pulsos em actividade APVC.
A cave por baixo Panizos é formado a partir de duas formações, açoite e Peña Colorada. O primeiro é um sedimentar camada, formado durante o desenvolvimento do arco no Paleozoico. O último é terciário de origem vulcânica, contendo brecha , material de fluxo de detritos, ignimbritos, correntes de lava e de arenito . A cave mergulha para o oeste. Baseado em neodímio rácios de isótopos, algumas das rochas do embasamento são cerca de um bilhão de anos.
O vulcão é parte de um grupo com outros vulcões do Lipez região. Nesta região, arco e vulcanismo back-arc ocorrer na mesma área e ter gerado algumas das maiores caldeiras do mundo. Estes incluem Cerro Guacha, Pastos Grandes e Vilama . A lineamento meridional de vulcões, incluindo Limitayoc e Salle se estende a partir da margem sul e oeste dos domos de lava centrais para Cerro Pululu no sul. Outra lineamento pode formar o aro oriental do complexo cúpula de lava. Outros centros no sul é a Rosa, Salle e ignimbritos Oeste Cerro Zapaleri, bem como os dacites de Cerro Bayo, tudo explodiu 8,9-5,1 mya da caldeira Vilama. Cerro Panizos está associada com uma anomalia topográfico em larga escala, semelhante a muitos outros centros vulcânicas na região.
De acordo com Turner (1978), os ignimbritos são parte da formação Lipiyoc e as estruturas de cúpula de lava da formação Vicuñahuasi. Os produtos erupção Panizos apresentar fortes variações locais, com características em diferentes profundidades e distâncias diferentes do complexo cúpula central sendo muito diferente.