Os prejuízos diretos causados pela CAE são: diminuição da vida produtiva e da produção leiteira dos animais; redução na duração do período de lactação; predisposição para a ocorrência de infecções bacterianas, especialmente na glândula mamária; crescimento deficiente ou aumento da mortalidade das crias e diminuição da eficiência reprodutiva. Pode promover também a redução dos níveis de gordura e de proteína do leite de cabras infectadas e predisposição à verminose gastrintestinal por Haemonchus spp. As perdas indiretas referem-se à desvalorização dos rebanhos, reposição precoce dos animais que desenvolvem sinais clínicos, despesas com o controle e barreiras comerciais para matrizes, reprodutores, sêmen e embriões.