Considerado como o mais longo da Europa, este canhão disseca a margem continental Ibérica segundo a direcção este-oeste, desde a plataforma continental, a profundidades de 50 metros, até à planície abissal Ibérica onde atinge profundidades na ordem dos 5000 metros.
Dependendo das regiões da margem continental que ele atravessa, é possível distinguir 3 secções do Canhão da Nazaré.