allthatmattersmaddy32: Outubro 2012
Publicada por MissAtheist32 à(s) 11:49 Sem comentários:
Ainda que se assumisse que estas teorias falhavam em explicar o efeito, se a causa proposta provavelmente não existe, apenas se pode afirmar que a causa ainda é desconhecida, ou que uma das outras causas contribuiu para o efeito, mas não é suficiente para explicar esse efeito. A 2ª opção é o máximo que um proponente do design inteligente pode conseguir num debate. Portanto, podem procurar mil e uma maneiras de refutar as teorias em vigor, que isso em nada contribui para a sua própria causa.
Publicada por MissAtheist32 à(s) 09:33 Sem comentários:
Já foram produzidos nucleótidos em laboratorio através de processos passiveis de acontecer na natureza (com as condições e substancias certas).
Foram também produzidos alguns aminoácidos (experiência da Miller) e mesmo cadeias de aminoácidos com catalizadores inorganicos.
Foram ainda sintetizadas sequencias curtas de RNA sem usar 'maquinaria' celular, mas sim reacções passíveis de ocorrer naturalmente.
Existe afinidade directa de moleculas de RNA para certas cadeias laterais de aminoácidos, assim como existem enzimas de RNA que catalizam a formação de ligações peptidicas e entre nucleótidos de cadeias de RNA. Foi estudada a evolução e selecção natural das últimas (das que são capazes de auto-replicação) em laboratório, obtendo-se uma melhoria funcional bastante acentuada.
A arginina e a lisina podem ser originadas a partir do ácido aspártico (ou aspargina), produzido em pequenas quantidades numa segunda experiencia de Miller em 1958, preservada e reanalisada (em 2011). Estes podem ter sido originados posteriormente em certas condições – se não se formaram quer dizer apenas que não se conhecem as condições em que se formaram.
Relativamente á existência de oxigénio molecular (O2) na terra primitiva, este existia em quantidades muito reduzidas há 3,8 biliões de anos e sabe-se que as primeiras biomoléculas foram formadas antes disso, pelo que não me parece que a sua síntese fosse impedida por isso.
Há indícios da existencia de vida há 3,8 biliões de anos e isso é bastante importante, significando que as primeiras biomoléculas se formaram antes.
Publicada por MissAtheist32 à(s) 03:34 Sem comentários:
Neste texto é apresentada uma entrevista com a Drª Lynn Margulis sobre a sua teoria da evolução simbiogénica – é de notar que a zoóloga e geneticista é responsável pela Teoria Endossimbiótica.
Afirma que o principal mecanismo da evolução não é a mutação, mas a simbiogénese, em que novas espécies surgem através da relação simbiótica entre dois ou mais tipos de organismos. Como isso funciona?
Todos os organismos visíveis são produtos de simbiogénese, sem exceção. As bactérias são a unidade … Simbiogénese reconhece que cada forma visível de vida é uma combinação ou uma comunidade de bactérias.
(…) Os órgãos dos sentidos dos vertebrados têm cílios modificados: As hastes e células cone do olho têm cílios, e o órgão de equilíbrio no ouvido interno é forrado com cílios sensoriais. Você inclina a cabeça para um lado e carbonato de cálcio no seu ouvido interno atinge os cílios. Isto é conhecido desde pouco depois da microscopia electrónica surgir em 1963. Cílios sensoriais não vieram de mutações aleatórias. Eles vieram através da aquisição de um genoma inteiro de uma bactéria simbiótica que já podia sentir a luz ou movimento.
Esse tipo de parceria (simbiose) dirige modificações evolutivas importantes?
A Evolução ocorre em grandes transições. (…) Acredito em genomas adquiridos (remetendo-nos para a sua obre "Acquired Genomes").
Pode dar um exemplo de simbiogénese?
Observe a capa da revista "Plant Physiology". Trata-se de uma lesma. Não tem ancestrais fotossintéticos. Esta alimenta-se de algas e incorpora cloroplastos, sendo capaz de realizar fotossíntese. Ou observe uma vaca. (…) Não é capaz de digerir ervas e necessita de organismos simbióticos para a digestão.
Mas a parceria simbiótica é tão estável, como pode provocar alterações evolutivas?
A simbiose é um fenómeno ecológico em que um tipo de organismo vive em contacto físico com outro. Simbiose a longo prazo leva a novas estruturas intracelulares, novos órgãos e sistemas e nova espécie quando um ser incorpora outro que é apto em algo.
"Discover Interview: Lynn Margulis Says She's Not Controversial, She's Right", Disponível em: http://discovermagazine.com/2011/apr/16-interview-lynn-margulis-not-controversial-right/
Publicada por MissAtheist32 à(s) 16:03 Sem comentários:
EVOLUÇÃO DA ATP SINTASE
Certa vez, observei um criacionista perguntar ao seu oponente por um estudo (passado por revisão de pares) que desmentisse o facto da ATP Sintase ser irredutivelmente complexa. Este não se lembrou de perguntar ao criacionista por um estudo (passado por revisão de pares) que demonstrasse que esta é.
É de notar que segundo o próprio Michael Behe n' "A Caixa Preta de Darwin" uma estrutura irredutivelmente complexa não tem por definição um precursor funcional. Isto pode parecer muito bonito a um criacionista ("Que bom! A proteína não evoluiu logo deus existe!" Lindo…). Mas essa alegação é contrariada pelas evidências.
Muitas das estruturas (se não todas) que alegadamente eram irredutivelmente complexas foram estudadas numa perspectiva evolutiva e os estudos (alguns deles referenciados ao longo deste blog) concluíram que as estruturas evoluíram naturalmente a partir de precursores funcionais, pelo que o conceito de complexidade irredutível foi considerado inaplicável.
Kenneth Miller (com uma atitude humorística) levou um invulgar acessório de gravata para o julgamento de Dover (Pensilvânia) – uma ratoeira á qual faltava uma parte. Que falta de gosto Dr. Miller, mas bastante útil para explicar como uma estrutura pode desempenhar uma função diferente se lhe removermos uma parte.
Os organismos necessitam de ATP para imensas reacções que ocorrem na célula. Para catalisar a síntese de ATP a partir de ADP existe a ATP Sintase. No entanto o ATP pode ser sintetizado em condições abióticas (provavelmente o que teria ocorrido na Terra pré-biótica). No entanto com a necessidade de produzir energia própria, proteínas capazes dessa função teriam sofrido pressões selectivas.
Na realidade existem muitos estudos por revisão de pares que demonstram que a ATP Sintase tem um ancestral comum com outros tipos de proteínas.
O dfominio F1 apresenta semelhanças estruturais ás DNA helicases hexaméricas e o domínio F0 demonstra algumas semelhanças ao motor flagelar (que funciona a protões – H+). Tanto o domínio F1 como a DNA helicase formam um anel com a mesma simetria rotacional, com um poro central.
As DNA helicases usam a forma helicoidal do DNA para dirigir o seu movimento ao longo da molécula de DNA e para detectar superenrolamento, ao passo que o hexâmero α3β3 utiliza as alterações conformacionais através da rotação da subunidade γ para conduzir uma reacção enzimática.
As enzimas do tipo ATP Sintase foram bastante conservadas ao longo da evolução. As enzimas bacterianas são essencialmente as mesmas em estrutura e função que as das mitocôndrias. (mais uma evidência da Teoria Endossimbiótica).
Alguns dos processos através dos quais e ATP Sintase evoluiu são conhecidos. Por exemplo, estudos sugerem que a elongação da subunidade gama (globular) resultou de fenómenos de duplicação intragenética (atpC); a subunidade C da ATP Sintase pertence a uma família de genes expandida por duplicação genética.
"O que é a vida?" – Lynn Margulis e Dorion Sagan (http://books.google.pt/books?id=jwVHCGSp79wC&pg=PA83&lpg=PA83&dq=produ%C3%A7%C3%A3o+abi%C3%B3tica+de+ATP&source=bl&ots=EQ7S3ZcysI&sig=zwb7agbyUtgdi-iCspV4jD0rQ5w&hl=pt-PT&sa=X&ei=EUSEUO-fDMOphAfF_YHIDA&ved=0CC8Q6AEwAA#v=onepage&q=produ%C3%A7%C3%A3o%20abi%C3%B3tica%20de%20ATP&f=false)
Biochim Biophys Acta. 2006 May-Jun;1757(5-6):437-45. Epub 2006 May 19. - Bioenergetics of archaea: ancient energy conserving mechanisms developed in the early history of life, Lewalter K, Müller V.
Gene. 2006 Apr 26;371(2):224-33. Epub 2006 Feb 7. - Evolution of ATP synthase subunit c and cytochrome c gene families in selected Metazoan classes, De Grassi A, Lanave C, Saccone C.
Zh Evol Biokhim Fiziol. 2007 Sep-Oct;43(5):391-7. - Evolutonary modifications of molecular structure of ATP-synthase gamma-subunit, Ponomarenko SV.
Rotary DNA motors. C. Doering, B. Ermentrout and G. Oster. Center for Nonlinear Studies, Los Alamos National Laboratory, New Mexico 87545, USA.
Antony Crofts. Lecture 10:ATP synthase. Life Sciences of the University of Illinois at Urbana-Champaign
InterPro Database: ATP Synthase
Ectopic β-chain of ATP synthase is an apolipoprotein A-I receptor in hepatic HDL endocytosis. Nature 421, 75-79 (2 January 2003) | doi:10.1038/nature01250.
* Cusquice: Dorion Sagan é filho de Lynn Margulis e Carl Sagan
Um estudo publicado na revista Organic & Biomolecular Chemistry pode explicar a origem dos açúcares na forma D, a única forma encontrada nos organismos vivos.
Os investigadores utilizaram aminoácidos do tipo L (os encontrados nos seres vivos) na catálise da formação de açucares, resultando predominantemente na formação da sua forma D.
Mais um pequeno (e importante) passo na compreensão da origem da vida.
A ciência continua a evoluir e as hipóteses e teorias vão sendo aperfeiçoadas descartadas e reaproveitadas e novas descobertas são feitas quer em laboratório, quer observando a natureza.
A ciência não oferece verdades absolutas, mas sim teorias e hipóteses baseadas na experimentação e na observação, baseadas em evidências. Estas são o que mais se aproxima de uma realidade objectiva sobre eventos não presenciados, sobre os quais se pode teorizar.
"British scientists recreate the molecules that gave birth to life itself", disponível em: http://www.dailymail.co.uk/sciencetech/article-2092494/Life-sweet-New-clue-chemical-origins-sugar-molecules-DNA-recreated-scientists.html
Publicada por MissAtheist32 à(s) 09:11 Sem comentários:
Publicada por MissAtheist32 à(s) 21:55 Sem comentários:
Numa entrevista á revista Época
(http://revistaepoca.globo.com/ideias/noticia/2012/04/lawrence-krauss-deus-se-tornou-redundante.html)
Lawrence Krauss explica que em determinadas condições, as partículas virtuais não precisariam necessariamente desaparecer. Elas poderiam não só continuar a existir, como multiplicar-se, dando origem a um big bang e a um novo universo em expansão. Para Krauss, a evidência de que isso pode ter sido realmente o caso da origem de nosso Universo é um feito notável.
A formação de particulas também ocorre nas colisões em aceleradores de partículas, que podem ser utilizadas para simular o Big Bang.
A causa da existência do Universo é a formação de particulas virtuais e a sua multiplicação. Ao que parece o apelo ao argumento da ignorância, mais conhecido por deus das lacunas, já não pode ser aplicado. Sim, o universo tem uma causa: a formação espontânea de particulas virtuais e a sua multiplicação. Pode haver quem não queira aceitar este facto com uma causa, então, nesse caso terá que afirmar que o universo não teve uma causa, porque o que foi referido aqui foi o que ocorreu e ocorreu naturalmente, como ainda hoje ocorre.
Na mesma entrevista, Lawrence Krauss afirmou que a partir das particulas virtuais poderiam ter sido originados vários universos, viveriamos num multiverso (é possivel que o nosso universo não seja o único) - 10 pontos para a série 'Fringe'.
O físico afirma também que ninguém precisa de ser um especialista em cosmologia para apreciar o panorama do surgimento e da evolução do Universo, da mesma forma que não é preciso ser músico para apreciar a música de Bach. Qualquer pessoa com uma inteligencia mediana é capaz de compreender que o universo se originou a partir de particulas virtuais e aceitar esse facto, desde que tenha acesso a informação esclarecedora e que não seja religiosa.
E aqui fica uma versão legendada da palestra de Krauss (torna-se bastante mais perceptível com legendas):
Publicada por MissAtheist32 à(s) 19:57 Sem comentários:
Publicada por MissAtheist32 à(s) 13:14 Sem comentários:
O processo de endossimbiose (incorporação de bacterias e estabelecimento da relação simbiótica), que inclui a evolução de sistemas de transporte complexos, perdas e ganhos de intrões e de genes, tem-se demonstrado dificil de solucionar. No entanto alguns estudos foram bem sucedidos.
Talvez as primeiras transferencias tivessem sido semelhantes ás transferencias horizontais que actualmente se observam e que trazem bastante vantagem (Ex.: entre bactérias e entre humanos e o parasita da malária). Os mecanismos regulatórios teriam evoluido posteriormente a partir de percursores ou existriam antes condições para que tal acontecesse. Estas modificações claramente conferiram vantagem evolutiva. Já existem estudos que confirmam que as proteinas envolvidas no transporte nucleo-mitocondria evoluiram de proteínas pre-esxistentes que teriam funções diferentes (http://allthatmattersmaddy32.blogspot.com/2012/09/evolucao-de-maquinas-moleculares.html).
Passar de genomas que têm intrões a genomas que não têm, não é dificil de encaixar na Teoria Endossimbiótica. Bacterias perderem genes em fenomenos de transferencia não é assim tão estranho.
O contrário, o aparecimento de intrões é estranho mas estes poderiam vir do nucleo ou ainda de outro simbionte que teria sido incorporado. Um exemplo de transferência horizontal com ganho de intrões por uma das partes é a transferência de intrões do grupo II das mitocôndrias para a Chattonella. Quanto á perda de intrões pela mitocondria, comparando as estruturas intrónicas e exónicas de 64 genes derivados de mitocôndrias, transferidos para o nucleo, pode-se refazer a história do ganho de intrões no núcleo (e perda na mitocondria) – e isto já foi feito.
Além de tudo isto, neste raciocinio é apenas considerada a teoria dos 'intrões tarde' – as primeiras bacterias não teriam intrões, que não é a única com evidências a seu favor. Há que considerar a teoria dos 'intrões cedo' – as primeiras bactérias teriam intrões e os intrões a partir daí, teriam sido perdidos e/ou ganhos, ou não teriam sido perdidos de todo.
O cenário da origem e evolução dos intrões, mais compatível com os resultados de genómica comparativa e considerações teóricas é o seguinte: intrões capazes de auto-splicing desde os primeiros estágios da evolução da vida – intrões invadiram genes emergentes durante eukaryogenesis, perdas e ganhos de intrões. A invasão por intrões, provavelmente, provocada pela endossimbionte mitocondrial, pode ter criticamente contribuiu para o aparecimento das características da célula eucariótica.
Relativamente a certas proteínas do complexo TOM (tom70), o caso já foi estudado, comprando com cianobacterias – e em principio a sua origem estaria nas cianobacterias e conseguiram ainda relacionar a tom40 com uma proteína semelhante em bacterias.
As transportadoras IM entram na mitocôndria através da proteína porosa Tom40, auxiliadas por um receptor Tom70, chaperona periplasmica e do complexo proteico Tim22.
A proteína Tom40 evolui suficientemente devagar para os homólogos serem detectados no interior do núcleo, mas não para identificação inequívoca de um ancestral procarionte. Estudos sugerem que esta evoluiu a partir de uma proteína do tipo β-barrel (poro) de uma proteobacteria, que secreta proteínas do pilus e usa chaperonas periplásmicas.
O complexo TIM22 apresenta alguma homologia com a proteina de membrana importadora de leucina de proteobacterias, LivH, o que confirma a sua origem bacteriana.
Biochim Biophys Acta. 2010 Jun-Jul;1797(6-7):1292-9. Epub 2010 May 5. – Structure and evolution of mitochondrial outer membrane proteins of beta-barrel topology, Zeth K.
Proc Biol Sci. 2006 August 7; 273(1596): 1943–1952. – Origin of mitochondria by intracellular enslavement of a photosynthetic purple bacterium, Thomas Cavalier-Smith
Protist. 2009 Aug;160(3):364-75. Epub 2009 Apr 5. - Mitochondrial group II introns in the raphidophycean flagellate Chattonella spp. suggest a diatom-to-Chattonella lateral group II intron transfer, Kamikawa R, Masuda I, et al
BMC Evol Biol. 2010 Feb 23;10:57 – Evolution of spliceosomal introns following endosymbiotic gene transfer, Ahmadinejad N, Dagan T, et al
Biol Direct. 2006 Aug 14;1:22 - The origin of introns and their role in eukaryogenesis: a compromise solution to the introns-early versus introns-late debate?, Koonin EV.
Publicada por MissAtheist32 à(s) 12:52 Sem comentários:
Publicada por MissAtheist32 à(s) 16:29 Sem comentários:
Publicada por MissAtheist32 à(s) 06:28 Sem comentários:
Há crianças que fazem chichi na cama. Algumas é porque têm algum transtorno psicológico ou físico (ou ambos). Outras é pura e simplesmente por birra ou preguiça.
Quando era pequena conheci um rapazinho que fazia chichi na cama de propósito porque não queria levantar-se para ir á casa de banho (uma vez o chichi até saiu fora da cama). Vangloriava-se do seu próprio chichi quando o colchão tinha que ser levado para fora de casa. A mãe levou-o a um psicólogo infantil e a resposta foi: o menino não tem nenhum transtorno psicológico. A mãe levou-o ao médico e a resposta foi: o menino não tem nenhum problema físico. Então quais são as opções? Birra. Birra para não ir á casa de banho, para chatear e por preguiça total e absoluta.
No caso dos criacionistas, que não têm nenhuma patologia ou défice cognitivo, é exactamente a mesma coisa: Birra. Birra e preguiça intelectual. A parte da birra neste caso refere-se ao fundamentalismo religioso e a parte da preguiça refere-se claramente ao uso indiscriminado do argumento da ignorância. A birra já dura há mais de 150 anos, no que respeita á área da biologia. É uma birra. É tapar os ouvidos, é fazer-se de surdo e de cego. "Serginho, não podes continuar a fazer chichi na cama! É falta de higiene e não tens idade para isso." Mas a criança faz-se de surda e continua a fazer birra. Esta é talvez a melhor analogia que se pode fazer com o comportamento dos criacionistas.
Quando Charles Darwin propôs a Teoria da Evolução, 'o chichi saiu para fora da cama' – um corpo de macaco com a cara de Darwin 'saiu' para que o público pudesse ridicularizar um dos precursores da biologia moderna. Mas ainda hoje os criacionistas se vangloriam dos seus 'contributos' para a biologia moderna. No entanto, como uma criança que quer poder voltar a ver televisão no quarto, a Igreja Anglicana pediu perdão a Darwin pelo chichi que saiu fora da cama (um pouco tarde para ver televisão?).
Mas há crianças que não mudam. O serginho tinha 10 anos e ainda fazia chichi na cama. Quanto aos criacionistas, são fixistas até no entendimento que têm dos factos, que em muitos casos nada melhorou.
Publicada por MissAtheist32 à(s) 16:18 Sem comentários:
Neste texto vou abordar aquilo que não abordei em 'Um Universo que veio do Nada' (http://allthatmattersmaddy32.blogspot.com/2012/10/um-universo-que-veio-do-nada.html), por falta de tempo (trabalhos, testes, aulas práticas, cadeiras de opção extra-horário…).
Na sua obra 'A Universe From Nothing', o físico Lawrence Krauss torna publico o conhecimento sobre a origem do nosso universo. Segundo Krauss, o universo veio do 'nada'. Mas o que quer dizer a palavra nada? A palavra nada neste caso refere-se a partículas mínimas, que podem originar-se espontaneamente de outras partículas menores e voltar ao estado inicial. Estas partículas são designadas partículas virtuais e isto acontece várias vezes no nosso universo. As partículas virtuais (possíveis ancestrais do nosso universo) são detectadas por métodos indirectos, por exemplo, pelo efeito de Casimir, no qual forças entre placas metálicas no espaço vazio são modificadas pela presença de partículas virtuais e é devido a elas que o nosso universo existe. Como se depreende por esta descrição a palavra 'nada' não tem o mesmo significado que tem na filosofia ou por uma questão de senso comum.
Na realidade a ideia de escrever 'A Universe From Nothing' surgiu durante uma palestra em 2009. O conteúdo do livro é uma versão alargada da palestra, á qual podemos assistir aqui:
Uma revisão da obra pelo New York Times compara estas descobertas á teoria da evolução de Darwin e a publicação da obra de Lawrence Krauss á publicação d' 'A Origem das Espécies'. A comparação não é de todo descabida. A teoria do Big Bang, apesar de ter sido revista por um dos homens mais inteligentes da história da humanidade e dos físicos mais conceituados da história da ciência (Einstein, claro), não explicava a origem da própria ocorrência que resultou na expansão do universo. Deste modo, a causa do universo era indeterminada, deixando espaço para as fantasias criacionistas do costume (leia-se deus das lacunas).
"O Universo começou a existir, logo o universo teve uma causa, logo a causa foi deus" – este é o argumento preferido dos criacionistas. Qualquer pessoa se apercebe de que se trata de um argumento da ignorância. Ainda assim os criacionistas não se conseguem divorciar dele (ups! Esqueci-me que também eram contra o divorcio).
É claro que o Universo teve uma causa: aparecimento de partículas.
Eu pergunto: quando não existirem lacunas, onde é que os criacionistas vão encaixar o seu deus das lacunas?
Prefácio da obra 'A Universe Fom Nothing', Disponível em: http://www.amazon.com/Universe-Nothing-There-Something-Rather/dp/145162445X
Gordon Kane: "Are virtual particles really constantly popping in and out of existence? Or are they merely a mathematical bookkeeping device for quantum mechanics?" Disponível em: http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=are-virtual-particles-rea
On the Origin of Everything: 'A Universe From Nothing,' by Lawrence M. Krauss – David Albert, New York Times, Disponível em: http://www.nytimes.com/2012/03/25/books/review/a-universe-from-nothing-by-lawrence-m-krauss.html?_r=0
Pensem num teste de paternidade ou num teste para determinar se 2 indivíduos são irmãos: seriam capazes de afirmar que 2 pessoas cujo resultado desse positivo para esse grau de parentesco tinham sido criadas individualmente? Agora imaginem os mesmos princípios aplicados a indivíduos que teriam uma ancestralidade comum muito, mas muito mais antiga do que, por exemplo, irmãos e vão recuando milhões e milhões de anos. Então, tentem relacioná-los através de analises de DNA. É isso que os cientistas fazem com, por exemplo, repteis e aves. E encontraram evidências de ancestralidade comum, tal como aconteceu com as análises comparativas entre o genoma do chimpanzé e do Homem: 75% de semelhanças no total e 98% no genoma codificante.
Como seriam os nossos 'avós' de há 2 mil anos? Humanos. E os nossos avós de há 2 milhões de anos? Algo de semelhante a uma espécie do género Australopithecus (que tem algumas parecenças com um chimpanzé), talvez com algumas características semelhantes ás das espécies do género Homo. Não encontraram a 'avó', mas encontraram a 'tia'.
Com base no exame de restos fósseis dos esqueletos de dois indivíduos, um adulto e uma criança, encontrados na África do Sul e com datação estimada em 2,3 milhões de anos, um grupo de pesquisa­dores descreveu e nomeou uma nova espécie de antropoide, o Australopithecus sediba Do artigo, publicado em Abril na revista científica Science (v. 328, no 5.975, p. 195), pode-se destacar o facto dos restos fósseis indicarem que a A. Sediba tinha mais caracteres em comum com as primeiras linhagens do género Homo do que qualquer outra espécie de Australopithecus e o facto de muitas características serem comuns a 3 espécies: A. africanus, A. sediba e H. Habilis. .
A dificuldade está no facto dos criacionistas não conseguirem lidar com o facto do seu ancestral de há 2 milhões de anos não ser humano e muito menos com o facto do seu derradeiro ancestral ser semelhante a uma bactéria.
Publicada por MissAtheist32 à(s) 11:23 Sem comentários:
Num estudo intitulado "Elucidation of phenotypic adaptations: Molecular analyses of dim-light vision proteins in vertebrates," foi estudado um fenótipo, visão dim-light, mediada por rodopsinas.
Nas rodopsinas dos vertebrados, várias substituições de aminoácidos ocorreram várias vezes e, além disso, as mudanças no comprimento de onda maximo biologicamente significativas ocorreram em pelo menos 18 ocasiões separadas. As adaptações altamente específicas ambientais parecem ter ocorrido grandemente pela substituição de aminoácidos em 12 sítios.
Neste caso não foi evidenciado o papel da selecção positiva sobre muitas modificações necessárias a esta adaptação. Uma explicação proposta por Austin Hughes afirma o seguinte: Como a selecção natural, mecanismos não selectivos podem desempenhar um papel importante na origem de fenótipos adaptativos. O mais importante processo não selectivo é a flutuação na frequência genética ou deriva genética, que pode levar à fixação de mutações seletivamente neutras (com nenhum efeito de fitness). Kimuracriou o termo "efeito Dykhuizen-Hartl" para descrever uma mutação originalmente neutraque mais tarde se torna adaptativa num ambiente alterado, incluindo um ambiente bioquímico mudadoresultante de outras substituições de aminoácidos na mesma proteína. Esta explicação propõe algumas alterações no entendimento relativo á Teoria original de Darwin na medida em que nem todas as alterações adaptativamente vantajosas dependem da acção guia da selecção natural. No entanto a importância desta mantém-se. A dada altura, a sua acção revela-se.
Segundo Hughes, um processo estocástico parece provável que tenha tido um papel na origem das alterações á sensibilidade espectral de pelo menos algumas rodopsinas de vertebrados.Yokoyama et al. descobriu que alterações funcionais nas rodopsinas, por vezes, necessitam de uma combinação de substituições de aminoácidos em vários locais diferentes. Por exemplo, uma rodopsina dos japoneses congro comXmax 480 nm ≈alcança esta sensibilidade através da interacção de três diferentes substituições de aminoácidos (em locais 195, 195, e292). Não parece haver nenhuma maneira da seleção natural favorecer uma substituição de um aminoácido que seria de valor adaptativo somente se duas substituições de outros ocorressem. Pelo contrário, parece mais plausível a hipótese de que duas das três mudanças de aminoácidos foram selectivamente neutras e atreitas a selecção positiva quando combinadas.
Yokoyama, Tada, Zhang and Britt, "Elucidation of phenotypic adaptations: Molecular analyses of dim-light vision proteins in vertebrates," Proceedings of the National Academy of Sciences, published September 3, 2008, doi:10.1073/pnas.0802426105.
Department of Biological Sciences, University of South Carolina,Columbia, SC29208 - PNAS _ September 9, 2008 _ vol. 105 _ no. 36 _ 13193–13194