Tem como principal missão o suporte ao funcionamento dos cursos de pós-graduação da UFJF, sejam eles lato ou stricto sensu, sempre em busca de sua consolidação e expansão. Constitui igualmente parte de sua missão assessorar a comunidade acadêmica nos assuntos relativos à pesquisa científica e tecnológica, estimular e fomentar a atividade de pesquisa na universidade, tendo como referência a qualidade e a relevância, para bem cumprir o papel de geradora de conhecimentos e de formação de recursos humanos.
No campo da pós-graduação stricto sensu, o qual compreende os cursos de mestrado e doutorado através dos programas de pós-graduação, a Pró-reitoria desenvolve duas ações de gestão e suporte financeiro – Apoio à Pós-graduação APG e o Programa de Bolsas de Pós-graduação PBPG – a fim de garantir o aumento do conceito nas avaliações da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes); a ampliação e a permanência do corpo discente e a internacionalização, visando alcançar o nível de excelência no setor.
Pró-reitoria de Graduação
Coordena, junto às unidades acadêmicas e ao Conselho Setorial de Graduação, a formulação e implementação de políticas para o ensino da graduação. É também encarregada pelo gerenciamento acadêmico e desenvolvimento de programas e projetos voltados para os cursos de graduação, tendo como objetivo criar condições favoráveis ao fortalecimento da qualidade acadêmica da UFJF.
Pró-reitoria de Extensão
Responsável por promover a articulação entre o ensino e a pesquisa e as demandas da sociedade. A pró-reitoria coordena e apoia programas, projetos, eventos, cursos, prestações de serviço e demais atividades de extensão, considerando o compromisso social da Universidade.
Pró-reitoria de Cultura
A cultura como direito inalienável de todos é o princípio que norteia a atuação da Pró-reitoria, por meio de projetos de formação de público, universalização do acesso à produção e à fruição de bens culturais e de integração entre comunidade e universidade.
Pró-reitoria de Assistência Estudantil e Educação Inclusiva
Dedica-se à formulação, implantação, gestão e acompanhamento de políticas de apoio estudantil. Além do gerenciamento das bolsas de assistência financeira, a pró-reitoria busca compreender de forma ampla as demandas socioeconômicas e psicopedagógicas dos estudantes.
Pró-reitoria de Gestão de Pessoas
Responsável pela realização dos concursos públicos da instituição, bem como pelo gerenciamento da vida funcional dos servidores, incluindo remuneração, progressão profissional, afastamentos para capacitação e movimentação de pessoas. Também promove oportunidades de capacitação e desenvolvimento, ações de proteção, prevenção e cuidados com a saúde.
Pró-reitoria de Planejamento, Orçamento e Finanças
Cabe à pró-reitoria elaborar a proposta orçamentária e o plano de gestão da instituição, identificar as necessidades de aquisição de bens e de contratação de serviços, executar as ações orçamentárias e financeiras, elaborando e gerindo os contratos e licitações pertinentes. É também o setor responsável pela prestação de contas da Universidade, entre outras atribuições.
Pró-reitoria de Infraestrutura e Gestão
Faz a execução, o acompanhamento e a fiscalização dos projetos e das obras de engenharia que implicam em ampliação de área na Universidade. Administra as ações de sustentabilidade. Planeja, gerencia e executa a manutenção e a reforma dos espaços físicos e prédios e das redes de eletricidade, de telefonia e lógica. Administra o uso e a ocupação dos espaços físicos. Gerencia os sistemas de compras, almoxarifado e patrimônio. Gerencia e executar o sistema de segurança institucional da Universidade. Gerencia os serviços de transporte, de correspondência e de protocolo.