A história se passa em um mundo pós-apocalíptico, onde o jovem personagem Thomas com a memória apagada é abandonado em uma comunidade formada por garotos. É através dos olhos de Thomas que nós o público enxergamos esse mundo formado pela clareira e o labirinto. Desde o começo o personagem se sente atraído pelo labirinto assim como o publico que quer entender porque nem todos podem entrar e quais perigos tem dentro do labirinto.