Capão Bonito possui uma unidade da FATEC, com os cursos de: Agronomia, Técnico Agrícola, Técnico de Roça, Técnico de plantar monocultura (soja), Técnico de fazendeirismo, Técnico em escravizar o trabalhador rural; todos, devidamente reconhecidos pelo Ministério da Educação e pelo Ministério do Rei do Gado. A cidade conta também com uma unidade da UNISA EaD, com cursos de qualquer coisa que você quiser, por que eles procuram TODAS as vídeo aulas no YouTube.
A cidade tem diversas escolas espalhadas pelos seus matagais (nenhuma de qualidade) dentre elas se destacam:
E.E.Avelina Contieri: O prédio da escola ficava em um barranco que deslisou em 2009, quando um ninho de pompa gira se instalou em uma rachadura na parede da Sexta Série A.
E.M. André Franco Montoro: Fica no meio de um milharal no distrito Turvo Dos Almeidas, e frequentemente aviões de pulverização acabam pulverizando as crianças, que crescem com alguns efeitos colaterais. O milho produzido ali e vendido para o Colégio Wardorf.
Colégio Wardorf (antiga Vale Encantado): É uma escola primaria, onde as crianças aprendem na base de chicotada e ajoelhando no milho. E quando são burras de mais eles são jogadas para os crocodilos em um laguinho que tem lá... Heather Mason estudava lá antes de ir morar em Silent Hill.