Além da flora periondontal, existem outras bactérias a viver na boca dos cães. Algumas destas incluem Klebsiella pneumonia, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Citrobacter freundii, Enterobacter cloacae, Acinetobacter calcoaceticus e várias espécies Pasteurella. Enquanto que na boca do cão estas não fazem com que fique doente, a entrada destas bactérias numa ferida aberta ou através de uma mordida pode originar uma infecção. Por isso mesmo, é importante que após uma cirurgia o seu cão não lamba as costuras, pois as bactérias podem entrar e surgir uma infecção.