A Congregação do Índice (a Congregação Romana encarregada de vigiar os livros perigosos) publicou um decreto sobre a ordem do Papa Paulo V, que proibia a circulação das obras heliocéntricas pela razão de serem contrárias à Sagrada Escritura. Após a condenação do heliocentrismo em 1616 e o decreto que proibiu as obras a favor, Galileu submeteu-se à decisão. Galileu também foi pessoalmente ordenado a não escrever nada sobre isso no futuro.
Cerca de uma década depois, no entanto, Galileu começou a trabalhar num artigo chamado: Diálogo de Galileu Galilei Sobre os Dois Grandes Sistemas do Universo, o Ptolemaico e o Copernicano. Este artigo não só tratava do heliocentrismo, mas era favorável a ele. A Inquisição descobriu isso e convocou Galileu a Roma para um julgamento. O julgamento começou na Primavera de 1633:
«12 e 30 de Abril e 10 de Maio de 1633: Galileu é examinado e afirma ter pretendido discutir o assunto hipoteticamente, colocando os argumentos para e contra cada sistema. Ele afirma ter esquecido que em 1616 ele tinha-lhe sido proibido escrever sobre o tema do heliocentrismo, alegando [correctamente] que isso não havia sido declarado no depoimento de Belarmino de 26 de Maio de 1616. Galileu admite que algumas partes do Diálogo parecem excessivamente favoráveis ao heliocentrismo, mas afirma que isso não foi mais que um acto de tola vaidade, pela qual ele entreteu-se a encontrar argumentos credíveis a favor de um sistema tão difícil de defender. Ele declara que ele mesmo não acreditou no heliocentrismo e não acreditava que este fosse verdadeiro desde 1616 quando ele foi informado de que foi condenado pela Igreja.» (John Daly, The Theological Status of Heliocentrism)
Em 22 de Junho de 1633, Galileu foi condenado pelo Santo Ofício da Inquisição (a Congregação Romana que lida com ofensas contra a fé) como veementemente suspeito de heresia por ter ensinado aparentemente em favor do heliocentrismo.
«22 de Junho de 1633: Galileu é condenado como veementemente suspeito de heresia e a quem é exigido abjurar o heliocentrismo e ser absolvido das censuras e penalidades nas quais considerou-se ter ele incorrido. Galileu fez a abjuração em questão e foi, portanto, absolvido. Ele foi condenado à prisão perpétua da Inquisição, uma sentença comutada no mesmo dia, de modo que ele de modo que lhe foi permitido residir como um indivíduo particular pelo resto da sua vida, embora limitado em seus movimentos e comunicações. O texto da condenação e abjuração de Galileu é extenso, mas a sua leitura cuidadosa é necessária para entender os problemas envolvidos em entender a mente da Santa Sé em 1633 sobre a posição teológica do heliocentrismo e solicita-se ao leitor neste ponto que refira-se ao texto completo incluído no Apêndice I.» (John Daly, The Theological Status of Heliocentrism)