Em reestruturação organizacional concluída em 1987, a Fucapi incorporou a palavra inovação ao seu nome.
A percepção da importância do tema para o desenvolvimento regional consolidou-se com o passar dos anos, fortalecendo a cultura organizacional e contribuindo para a definição de prioridades na formação de recursos humanos.
Em 2005, três colaboradores concluíram o doutorado em Engenharia de Produção no programa da Coppe/UFRJ e criaram, em seguida, o Núcleo de Estudos e Pesquisas em Inovação (Nepi).
Além da abordagem multidisciplinar, o Nepi é também interinstitucional, pois conta com a participação de pesquisadores associados da área Gestão e Inovação do Programa de Engenharia de Produção da Coppe/UFRJ e do Núcleo de Estudos em Inovação, Conhecimento e Trabalho da Universidade Federal Fluminense (UFF). Posteriormente, pesquisadores com outras formações incorporaram-se à equipe, ampliando assim a capacidade de trabalho.
Em 2009 o Nepi inaugurou instalações próprias, em prédio construído com apoio financeiro do Fundo de Pesquisa e Desenvolvimento da Amazônia (CT-Amazônia), implementado pela Financiadora de Estudos e Projetos (Finep).
Contribuir para o fortalecimento da cultura da inovação como instrumento para a prosperidade do estado do Amazonas, gerando e disseminando conhecimentos por meio de pesquisa, ensino e consultoria.
* Fortalecer a capacidade endógena de investigação e tratamento de questões relacionadas à realidade do desenvolvimento local;
* Contribuir com a dinâmica do desenvolvimento local;
* Difundir o conceito de inovação e ampliar seu uso na formulação de políticas públicas.
Esses objetivos são perseguidos por meio da realização de pesquisas acadêmicas, estudos técnicos, organização de publicações, atividade docente, orientação de estudantes, incubação de empresas e organização de eventos técnicos.