Resolvi o problema resetando de fábrica do firmware do teclado, no meu caso é a combinação de teclas FN + ESC.
Faça uma tentativa para ver se resolve no seu caso. Lembrando que o atalho para resetar pode ser diferente para seu teclado, consulte o fabricante.
Tentei fazer o factory reset, o meu é um royal kludge rkg87, mas não deu certo. As teclas sem segurar Fn são considerados atalhos, mas fora do local e caso aperte Fn, nesse caso funciona os atalhos corretamente, mas nada de funcionar as teclas F1-F12.
Eu tenho de conseguir fazer algo, que quando o sistema inicie, faça a alteração do hid para 2, o equivalente que faço na mão depois que entro no Gnome.