Bolsa 20/05492-2 - Biologia computacional, Metilação de DNA - BV FAPESP
Identificação de regiões regulatórias associadas com mutação nos genes IDH1/2 em diferentes tipos tumorais
Processo: 20/05492-2
Beneficiário: Anna Beatriz Machado Vercesi
Assunto(s): Biologia computacional Metilação de DNA Isocitrato desidrogenase Neoplasias Expressão gênica
No câncer ocorrem tanto mutações genômicas quanto alterações epigenéticas, que incluem metilação de DNA e modificações pós-traducionais de histonas. As mutações nos genes IDH1/2 são frequentes em glioma de baixo grau, leucemia mielóide aguda, colangiocarcinoma e outros tipos tumorais; e são muitas vezes associadas com um fenótipo de hipermetilação de DNA. A proposta do presente trabalho é definir as regiões regulatórias associadas com o fenótipo hipermetilador de tumores com mutações nos genes IDH1/2. Serão utilizados dados públicos e ferramentas computacionais de código aberto do R/bioconductor para mapear as mudanças epigenéticas compartilhadas e/ou tecido-específicas associadas com mutações nos genes IDH1/2 através de 9 tipos tumorais, que incluem glioma de baixo grau, colangiocarcinoma, melanoma cutâneo, glioblastoma multiforme, carcinoma endometrial, leucemia mielóide aguda, carcinoma urotelial, carcinoma hepatocelular e adenocarcinoma de cólon. A identificação de mudanças epigenéticas compartilhadas ou tecido-específicas associadas com mutações nos genes IDH1/2 irá contribuir para descobrir os mecanismos que levam a desregulação da metilação global do DNA e suas implicações clínicas. (AU)