Em 624, Abu Ubaidá participou na primeiro grande confronto militar entre os muçulmanos e os coraixitas de Meca, a batalha de Badr. Durante os combates, Abu Ubaidá foi atacado pelo seu pai Ubaidá ibne Aljarrá, que combatia ao lado dos coraixitas. O filho tentou evitar lutar com o pai, mas este acabou por conseguir encurralá-lo. Abu Ubaidá atacou então o pai e matou-o.
“ Não encontrarás uma pessoa que acredite em Alá e no último dia fazem amizade com aqueles que se opõem a Alá e ao Seu Mensageiro, apesar deles serem os seus (próprios) pais, ou os seus filhos ou os seus irmãos ou da sua família; estes são aqueles em cujos corações Ele impregnou a fé, e a quem Ele fortaleceu com uma inspiração Dele; e Ele fará com que eles entrem em jardins debaixo dos quais correm rios, habitando nele; Alá fica muito satisfeito com eles e eles ficam muito satisfeitos com Ele estes são o grupo de Alá; agora seguramente o grupo de Alá são os que têm êxito. ”
O episódio do parricídio de Abu Ubaidá é contado numa "biografia", mas não é referido por Tabari na sua crónica nem por William Muir em The Life of Mahomet (A Vida de Maomé).
“ Uma das maiores provas a que foi sujeito desenrolou-se aquando da batalha de Badr. Ela foi tão crucial que ultrapassa a compreensão humana. Hazrat[nt 2] Ubaidá ibne Aljarrá avançava no meio do campo de batalha abrindo o seu caminho. As gentes corriam de um lado para o outro ao acaso. Certa vez ele dirigia-se a um homem a cavalo, as suas gentes abriam passagem, mas era apenas um homem que ele queria afrontar e tentar atacar... Quando Hazrat Abu Ubaidá ibne Aljarrá se deu conta que esse personagem era o seu pai, ficou aturdido e chocado. Hazrat Ubaidá ibne Aljarrá foi obrigado a atacá-lo e ele foi retirado da face da terra. Nada era impossível para tais personagens do Islão, ninguém podia impedir de crer na unidade de Deus e no seu bem amado Mensageiro Maomé.[5] ”