Pró-Reitoria de Pós-graduação e Pesquisa (PROPEP) é o órgão da Administração Central da UNIGRANRIO que coordena e supervisiona todas as atividades de pós-graduação e pesquisa da universidade através de ações desenvolvidas pelas Diretorias dos Núcleos de Pesquisa e Iniciação Científica, Lato Sensu e Sricto Sensu.
A PROPEP estabeleceu como metas prioritárias para o próximo triênio (2012-2014): I. Identificar grupos emergentes de pesquisa e estimular os já existentes, com vistas a uma maior produção intelectual qualificada, incentivo à criatividade e inovação científica; II. Estabelecer convênios de cooperação com universidades brasileiras e estrangeiras visando a implantação de programas de doutorado interinstitucional, linhas de pesquisa de interesse comum e intercambio de docentes; III. Estimular iniciativas que busquem permanentemente editais de auxílio à pesquisa das várias agencias oficiais de fomento e de empresas privadas e estatais; IV. Estabelecer uma política de Iniciação Científica que tenha como objetivo principal a conscientização de professores e alunos da Graduação para a importância da pesquisa, básica ou aplicada, na qualificação dos próprios Cursos de Graduação, no aprimoramento de seus professores, na imagem da UNIGRANRIO e, principalmente, como agente central de transformação sociocultural sustentada da Baixada Fluminense: V. Propiciar um portfólio atraente de oferta dos Cursos de Pós-graduação Lato Sensu, associado às iniciativas que promovam a qualificação permanente dos mesmos.
Todas essas ações têm por objetivo a implantação de novos Programas de Doutorado e aumentar, em número e qualidade, os Programas de Mestrado — Acadêmico e Profissional — já existentes. Igualmente importante é divulgar amplamente o grande potencial dos Cursos e Pós-graduação Lato Sensu nos vários Campi da instituição – Duque de Caxias e Lapa e nas unidades da Barra da Tijuca, Macaé e Silva Jardim.