Os candidatos devem submeter propostas de acordo com as normas de suas respectivas agências de fomento (com os formulários próprios das agências). Pesquisadores dos Estados Unidos devem seguir orientações do DOE e pesquisadores do Estado de São Paulo, as normas de elegibilidade da FAPESP para Auxílio à Pesquisa - Regular. No caso de uma proposta incluir três agências (FAPESP, DOE e Fapeam), pesquisadores do Estado do Amazonas devem seguir as diretrizes da Fapeam.