Shikadai e o resto do grupo estão preocupados se Boruto vai conseguir lidar com a dor da traição de Mitsuki. Chegando a uma conclusão drástica, Garaga decide ir atrás de Mitsuki e levá-lo à força de volta para a Vila da Folha, como uma vez Naruto fez com Sasuke.
O episódio 96 foca em Namida, do Time 15. Ela é capaz de usar uma técnica especial com a qual paralisa a audição das pessoas com seu choro, podendo até fazer o oponente desmaiar. Contudo, qualquer erro no uso dessa técnica pode atrapalhar a missão, o que a faz desistir de usá-la. Ela decide, então, treinar para ficar mais forte e conseguir proteger suas colegas de time.
No capítulo 97, Shikadai decide entrar para o mundo da politica, mas precisa encontrar uma forma de contar isso para sua família e amigos.
O episódio 104 acompanha a missão do time 7 de ajudar policiais a encontrar um ladrão de joias chamado Nezumi. Na fuga, Nezumi escondeu as joias e se misturou a homens bêbados na rua, sendo preso apenas como suspeito.
Após a busca, Boruto, Sarada e Mitsuki encontram um gatinho na rua e Mitsuki acaba ficando com ele. Quando o animal fica doente e o ladrão Nezumi tenta roubá-lo, o grupo descobre que o criminoso tinha feito o bichano engolir a joia roubada.
O capítulo seguinte aborda as memórias de Mitsuki, desde o conhecimento de Ōnoki até o último incidente da Vila da Pedra. Orochimaru, que assistia a essas memórias junto a Log, preocupa-se e afirma que talvez seja necessário apagar as memórias do jovem.
Os três primeiros episódios desta série de fillers abordam respectivamente os problemas que Boruto, Shikadai, lwabe e Wasabi tiveram com a missão de encontrar uma flor rara, devido a conflitos infantis; a batalha que se desenrola para decidir quem vai ocupar a última "vaga" estampando um famoso jogo de cartas com tema de ninjas famosos, Shino ou Rock Lee; e um pouco das história do Time 25, um grupo esquecido de guerreiros.
Nos capítulos seguintes, acompanhamos Boruto e Konohamaru tentando salvar a jovem Yoimura Remon de um monstro chamado Sōma e de um estranho ritual que aprisiona a moça. Mas há mais segredos nesta cidade do que os guerreiros poderiam imaginar.
No episódio 137, Sumire decide se afastar do Time 15 para se juntar ao Time Científico de Armas Ninja e se dedicar a suas pesquisas. Enquanto seus amigos preparam uma festa de despedida, uma samurai do País de Ferro aparece para ocupar a vaga que Sumire deixou no time.