O projeto do segundo jato argentino acabou se misturando à crise econômica e política que foi instaurada no país nos anos seguintes. Houve cortes no orçamento, demissões de especialistas e um dos golpes mais duros foi a conversão de parte das instalações da FMA em fábrica de automóveis, caminhões e motocicletas. Desta forma, o Pulqui II acabou abandonado em 1960.
Os dois protótipos do Pulqui II que sobreviveram estão expostos nos museus aeronáuticos de Buenos Aires, junto ao Pulqui I, e Moron. Com o fim das “flechas” argentinas, um novo e avião a jato seria desenvolvido na América do Sul apenas nos anos 1980 e pela Embraer, com o AMX.
O projeto terminou devido a implantação da ditadura militar aliada aos E.U.A, que com certeza, ordenou o encerramento do projeto do avião a jato argentino.