Bolsa 10/00180-0 - Ressonância magnética, Processamento de imagens - BV FAPESP
Processo: 10/00180-0
Beneficiário: Maryana de Carvalho Alegro
Assunto(s): Ressonância magnética Processamento de imagens Morfometria
A aplicação das técnicas de análise de textura serão realizadas em paralelo com a aquisição de novos volumes de dados, uma vez que esta atividade é dependente da realização dos exames. O objetivo desta atividade é gerar dados sobre o sinal captado nos exames, à medida que estes são realizados, conforme o cronograma original do projeto, e compará-los com os achados dos exames de patologia. Nesse processo é bem provável que haja a necessidade de se utilizar técnicas estatísticas e/ou de aprendizado de máquina para a obtenção de um resultado mais detalhado. O produto final desta etapa será uma base com os dados processados, e uma lista com as descobertas sobre as relações existentes entre as alterações biológicas encontradas na patologia, e suas implicações nos sinais de ressonância captados.Assim como a etapa de análise de texturas, a análise via Freesurfer será realizada ao longo do projeto, à medida que os exame forem realizados. Apenas são utilizados os exames in vivo nesta análise, pois este software foi projeto para trabalhar com um volume do cérebro completo. Ao final desta etapa haverá um banco de dados com a variação de espessura cortical e volume das regiões do cérebro dos pacientes doente e controles saudáveis. Também serão disponibilizados os resultados dos estudos realizados com estes dados.A criação de uma ferramenta pronta para o uso diário, aproveitando o protótipo já existente em (ALEGRO,2009). Esta ferramenta será capaz de calcular texturas de naturezas diversas, e será implementada em uma linguagem otimizada, como C++, permitindo que seja usada dentro do Matlab ou pelo shell do Linux. Esta também será capaz de ler e salvar arquivos nos formatos mais comuns da prática médica, como DICOM e Analyze. A ferramenta será desenvolvida e testada, aproveitando as imagens geradas pelo projeto para sua validação. Ao final desta atividade, a ferramenta pronta e sua documentação estarão disponíveis ao público via Internet.Serão realizados dois treinamentos. O primeiro sendo de Freesurfer, o que dará autonomia aos pesquisadores para utilizarem a ferramenta e interpretarem os dados gerados. O segundo será de analise de texturas, onde os participantes se familiarizarão com os conceitos básicos de análise de texturas e as técnicas existente, e aprenderão a utilizar o software criado para este projeto.
ALEGRO, MARYANA DE CARVALHO; SILVA, ALEXANDRE VALOTTA; BANDO, SILVIA YUMI; LOPES, ROSELI DE DEUS; MARTINS DE CASTRO, LUIZ HENRIQUE; HUNGTSU, WEN; MOREIRA-FILHO, CARLOS ALBERTO; AMARO, JR., EDSON. Texture analysis of high resolution MRI allows discrimination between febrile and afebrile initial precipitating injury in mesial temporal sclerosis. MAGNETIC RESONANCE IN MEDICINE, v. 68, n. 5, p. 1647-1653, NOV 2012. Citações Web of Science: 10.