A Comissão Eleitoral (Comeleufsc) conduz todos o processo de consulta à comunidade, realizada historicamente desde a década de 80. A Comissão é formada pelas entidades representativas: Paulo Marcos Borges Rizzo (Andes) na presidência da Comissão, Bruna Veiga de Moraes (APG), Valmir José Oleias (Apufsc), Clara Niehues Rivas (DCE), Claudio Roberto Silvano e João Batista da Silva (Sintufsc).
Consulta ou eleição?
Apesar de ser bastante utilizado o termo "eleição" e também parecer muito com uma disputa eleitoral, com voto direto e secreto em urna eletrônica, o correto é "consulta".
Todo o processo passa pela consulta informal da comunidade universitária e pelo Conselho Universitário (CUn). Uma lista tríplice é encaminhada para o Ministério da Educação para que o Presidente da República nomeie o novo reitor. Pela legislação, com a vacância do cargo em 2 de outubro de 2017, a universidade teria 60 dias para escolher o novo gestor. Mas devido a excepcionalidade da situação, o MEC concedeu um prazo maior à Universidade.
As urnas estarão disponíveis nos campi Florianópolis, bairros Trindade e Itacorubi, Joinville, Curitibanos, Araranguá e Blumenau. Os votos válidos serão ponderados na proporção de um terço (1/3) para cada categoria de forma igualitária.