BDTA USP - Detalhe do registro: Banco não-relacional para armazenamento de dados genéticos
Weigert, Rodrigo de Andrade Santos
USP affiliated author: WEIGERT, RODRIGO DE ANDRADE SANTOS - ICMC
Subjects: BANCO DE DADOS; MINERAÇÃO DE DADOS
Abstract: Este trabalho explora a utilização de um sistema de banco de dados não-relacional para gerenciar dados oriundos de processos de sequenciamento e genotipagens comerciais, particularmente os chamados SNPs (pronunciado "snips", do inglês single-nucleotide polymorphisms – polimorfismos de nucleotídeo único). Foi proposta uma solução de armazenamento orientado a documentos capaz de lidar com o grande volume de dados e flexível o bastante para aceitar a importação e exportação de arquivos em diferentes formatos, além de oferecer suporte eficiente a consultas relevantes na área de aplicação. Foi utilizado o MongoDB para um backend no topo do qual foi implementada uma aplicação em Python com interface por linha de comando. Testes foram realizados para avaliação do desempenho do sistema em consultas, exportações e importações, estas avaliadas tanto com relação a tempo quanto a espaço ocupado em comparação com os arquivos originais. Os resultados indicaram que a solução proposta é viável, sobretudo quando versatilidade e poder de consulta forem mais prioritários do que eficiência, a qual sofre algum impacto.
monografia-rodrigo-final.... Direct link
WEIGERT, Rodrigo de Andrade Santos. Banco não-relacional para armazenamento de dados genéticos. 2019. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação) – Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação, Universidade de São Paulo, São Carlos, 2019. Disponível em: https://repositorio.usp.br/directbitstream/2d84980a-2fda-4d4a-b5ab-52639308994c/monografia-rodrigo-final.pdf. Acesso em: 24 maio 2022.
Weigert R de AS. Banco não-relacional para armazenamento de dados genéticos [Internet]. 2019 ;[citado 2022 maio 24 ] Available from: https://repositorio.usp.br/directbitstream/2d84980a-2fda-4d4a-b5ab-52639308994c/monografia-rodrigo-final.pdf