A Inteligência, também conhecida como a "intel", "bandeira/flag", ou "pasta/briefcase", é a bandeira e objetivo do modo de jogo Capture a Bandeira. Ela aparece como uma pasta da cor do time, que possui um teclado numérico para o cadeado na frente e papeis saindo de suas juntas. Ao ser pega por um inimigo, a pasta perde parcialmente sua cor e irá soltar partículas de papéis e uma trilha colorida da cor do time a que ela pertence.
Durante um round de Capture a Bandeira, cada time recebe sua própria inteligência, localizada dentro da seção deles do mapa. Ela deve ser tomada desse local pelo time oposto e retornada para um ponto definido, geralmente a "zona de captura" é onde a inteligência deles está.
A Inteligência pode ser tomada por um jogador inimigo que andar sobre ela. E então ela irá para suas costas e a Administrator irá anunciar para ambos os times que a Inteligência foi tomada. O indicador de Inteligência localizado na HUD irá então apontar na direção do carregador que deve tirá-la da base inimiga e levá-la para a sua própria.
Enquanto carrega a inteligência, acontecem muitas desvantagens. Primeiro, um jogador não pode usar Teleporters. A ÜberCarga de um Medic não pode ser usada no carregador da Inteligência, e um jogador também não pode pegá-la enquanto está sob seus efeitos. Scouts não pódem beber Bonk! Atomic Punch enquanto estão com a Inteligência, e também não podem pegá-la após usar. Spies não podem pegar a Inteligência enquanto estão invisíveis, mas podem pegá-la enquanto estão disfarçados, ainda que ele desapareça automaticamente. Além disso, o Spy não pode se disfarçar ou ficar invisível enquanto carrega a Inteligência, e fazer isso irá derrubar a Inteligência automaticamente. Finalmente, a Inteligência é derrubada automaticamente se o carregador morrer ou entrar em uma Área de Reabastecimento.
Quando o a Inteligência for retornada ao ponto de captura, o time vencedor irá ganhar um ponto mostrad no Indicador de Inteligência, e irá receber dez segundos de impulso Crítico.
A Inteligência pode ser derrubata manualmente se o jogador a carregando apertar o botão de derrubar (por padrão "L"). Quando derrubada, um timer do tipo relógio irá aparecer sobre a Inteligência. Quando os 60 segundos (por padrão) tiverem passados sem um inimigo pegá-la novamente, ela é automaticamente retornada a sua posição original na base do time. Se um inimigo pegá-la, mas logo depois derrubá-la, o timer irá resetar. Os times devem defendê-la durante esse periodo, ou arriscar perde-la novamente. Caso o carregador da Inteligência for morto por um perigo ambiental que previna a Inteligência derrubada de ser tocada, como o abismo sem fundo em Double Cross, ela será automaticamente retornada para sua posição original. Essa função está presente no código do próprio mapa, e não da Inteligência, e então deve ser adicionada manualmente por seu criados. Por tanto, enquanto todos os mapas oficiais feitos pela Valve têm essa característica, nem todos os mapas personalizados podem utilizar essa função.
A Inteligência Neutra é uma versão branca da pasta padrão que aparece em arquivos do jogo. Ela ainda não foi usada pela Valve em mapas oficiais, no entanto, foi incluida por eles para uso da comunidade em modos de jogo personalizados (como "Uma Bandeira CTF/Single Flag CTF", FortWars, e "Server de conquista").
Como um substituto para estágios antigos, Valve usou versões modificadas das bandeiras do Team Fortress Classic, que ainda podem ser encontradas nos arquivos do jogo, contendo rostos do time de desenvolvedores de TF. O rosto da bandeira vermelha é o de Robin Walker, co-criador da série Team Fortress'.
Com a Atualização Classless, o visual da Inteligência quando carregada foram melhoradas para facilitar a detecção do carregador.
Há uma opção que permite a servidores escolherem a duração do Crit-boost em uma captura, ou desativala completamente (tf_ctf_bonus_time).