Embora seja mais comum realizar um transplante de células de sangue periférico em doentes cujas células são adequadas para transplante de medula óssea, a equipa médica pode recomendar o transplante autólogo de medula óssea.
Depois de ter sido colhida, a medula óssea é congelada (crioconservação) até que a medula óssea remanescente do doente tenha sido destruída e esteja pronta para receber o transplante.
Uma vez que a medula óssea provém do próprio doente, a probabilidade de reacção entre o sistema imunitário e as células transplantadas diminui drasticamente. Seja como for, como o risco de infecção durante a recuperação da medula óssea é elevado, é importante que o doente fale com a equipa médica sobre a redução da probabilidade de infecção.