Nos anos 2000 é registrada uma queda no número de produções em relação a década anterior. Alguns temas são resgatados em produções que os atualizam, como Círio (2000) e Marujada: Festa em Bragança (2005). Outras biografias são realizadas, a exemplo de O Homem do Balão Extravagante (2005) e Haroldo Maranhão: o homem Infinito da Escrita (2002).
Na documentação arquivística, entretanto, percebemos lacunas cronológicas, sobretudo no tocante a produção do período correspondente a gestão de Regina Lima, durante o governo Ana Júlia Carepa. Por outro lado, a própria documentação existente apresenta dados imprecisos, como a presença de documentários produzidos por realizadores independentes, mas exibidos na emissora, como Lugares do Afeto: a fotografia de Luis Braga (2005), realizado pela cineasta Jorane Castro, e A Barca: Turista Aprendiz (2005) e Eretz Amazônia (2004).