Você só esqueceu de um detalhe, Sasuke não apenas perdeu o olho e ficou cego, ou teve uma infecção, ele perdeu suas habilidades!
Tobirama ou qualquer Senju teriam problemas em acertar um golpe bem no meio de qualquer Uchiha exatamente por causas das habilidades deles, agora me diga, se uma guerra real você não consegue matar seu inimigo por causa de um recurso X, você vai:
Não, a minha "lógica" não tem nada a ver com a resistência do olho, não estamos falando de Biologia aqui, você nem precisa trazer essas analogias para isso, já foi explicitamente dito no mangá que os olhos podem ser destruídos, Danzou destruiu o olho do Shisui, a minha lógica é: "É narrativamente tosco você considerar que um personagem vai ter seu olho mágico furado e vai perder suas habilidades por isso", não é um furo "biológico" um olho ser destruído, assim como não é um furo o Batman morre por levar um tiro, mas continua sendo tosco.
Sua defesa é como se amanhã lançassem um comic onde o Batman é assassinado baleado e você falasse "Ah! Mas nunca disseram que o Batman é aprova de balas!", e eu faria a mesma pergunta, "Deixa de ser estupido por isso?"
E eu não preciso provar isso usando de analogia com outras obras, isso vale para o cânone da Naruto, eu te perguntei, acrescento mais, o Madara Jin era praticamente imortal, seu olho não, porque o Sasuke não usou o Ameno para tentar cegar ele? Eu mesmo respondo, porque isso seria estupido. O vilão final foi derrotado porque furaram seu olho e ele ficou sem poderes, que grande roteiro.