Nessa nova fase, a 1ª Divisão começaria bem “enxuta” com apenas 11 agremiações, as oito que se classificaram para o Torneio dos Finalistas em 1959 (exceto o Corinthians-PP) e as quatro citadas acima. Equipes tradicionais como a Prudentina, Barretos, Jaboticabal, Paulista e Tupã, que sistematicamente vinham disputando o acesso para a divisão de elite tiveram que amargar o campeonato da nova 2ª Divisão, que a rigor era o certame do 3º escalão.
A Esportiva de Guaratinguetá, equipe já extinta, foi a grande campeã e laureou-se para fazer parte da Divisão Especial no ano seguinte. Foi um campeonato relativamente curto, durou quase cinco meses, mas foi muito disputado entre a Guaratinguetá, Catanduva (equipe também já extinta) e Batatais, o velho “Fantasma da Mogiana”. Pela primeira vez adotou-se a forma clássica e mais justa, que é a de pontos corridos, com jogos em turno e returno.