Ainda existem deficiências na cobertura e a qualidade do pré-natal, o que está contribuindo para o nascimento de crianças com o HIV. No pré-natal, por exemplo, o diagnóstico do HIV ainda está sendo feito tardiamente nas maternidades, apesar do teste rápido está sendo disponível na rede pública.
Novos comportamentos sexuais da população dificultam a prevenção. Pesquisas mostram que 50% da população jovem não usa o preservativo nas relações sexuais ocasionais. Ainda existem movimentos estimulando as práticas de risco, como o barebacking (movimento que fazem apologia ao não uso do preservativo durante o sexo anal ou vaginal). Decididamente, existem pessoas que não querem usar o preservativo e se envolvem em situações de risco afirmando que ?sexo arriscado é mais gostoso?.
A via judicial tem sido utilizada por pacientes para conseguir o acesso a alguns exames e procedimentos, cuja deficiência de oferta é sentida na rede pública de saúde.
Os serviços tidos como sociais (saúde, educação, habitação, assistência social) precisam está integrados no enfrentamento à epidemia do HIV.
O Ministério da Saúde repassou, para vários municípios brasileiros, verbas para ações em relação a AIDS e outras infecções sexualmente transmissíveis. Em muitos casos, os recursos financeiros estão parados nas contas das prefeituras.