Seguindo esse pressuposto, provavelmente você já eliminará boa parte das aspas do seu trabalho. Mas ainda temos as palavras que queremos destacar (aqueles conceitos importantes da teoria que queremos mostrar que lemos, sabe?)
Se você utilizar aspas, o leitor do seu trabalho esperará uma citação com número de página, pois entenderá que você está citando um determinado trabalho. Para que isso não ocorra, e para não infringir a norma ABNT 10520:2002, você deve destacar as palavras usando outros recursos gráficos (negrito ou sublinhado).
Tenha em mente que sempre que tiver aspas no texto, deve existir uma referência e uma página dessa referência. Essa é a forma mais correta do uso das aspas na escrita científica.
Lembre-se, também, que a escrita científica deve ser sempre clara e direta, não use palavras com sentidos diferentes do descrito no dicionário! Evite constrangimentos no seu trabalho acadêmico.