Bolsa 10/03410-7 - Xanthomonas axonopodis, Eletroforese em gel bidimensional - BV FAPESP
Identificação de proteínas potencialmente relacionadas a patogenicidade do fitopat...
Análise proteômica diferencial da fração proteica periplasmática das estirpes a e b de Xanthomonas axonopodis
Processo: 10/03410-7
Assunto(s): Xanthomonas axonopodis Eletroforese em gel bidimensional Cancro (doença de planta) Proteômica
Este trabalho tem como objetivo realizar a análise proteômica diferencial da fração periplasmática de Xanthomonas axonopodis pv. aurantifolii estirpe B (Xaa-B), bactéria fitopatogênica causadora da cancrose B, comparativamente à estirpe A (Xac-A), de maior virulência e espectro de hospedeiros. O sequenciamento (total ou parcial) do genoma de ambas as estirpes já foi realizado por projetos financiados pela Fapesp e pelo Fundecitrus. A estirpe Xaa-B será cultivada em meio XAM-1, conhecido como sendo um meio indutor de patogenicidade para Xac-A, e em meio não indutor de patogenicidade (Caldo Nutriente, CN). Após a extração de proteínas de Xaa-B em triplicata, as mesmas serão separadas por eletroforese bidimensional (2D-PAGE) e os géis serão corados com Coomassie Brilliant Blue R-250. Uma análise comparativa dos perfis protéicos será realizada após documentação dos mesmos pelo software Image Master Platinum (GE Healthcare), para cada uma das condições de crescimento de Xaa-B (meio CN/ meio XAM-1) e/ou para as duas estirpes Xaa-B e Xac-A (no mesmo meio de cultura). Para tal comparação, serão utilizados os géis bidimensionais de proteínas periplasmáticas de Xac-A obtidos anteriormente (Artier, dissertação de Mestrado). Em seguida, será realizada uma análise estatística para as condições de interesse, por meio da qual serão determinadas quais proteínas apresentam uma expressão diferencial significativa (p<0,05). Tais proteínas serão isoladas a partir dos géis, para serem futuramente analisadas por espectrometria de massas.