O Plano Escolar Anual da EAFEUSP é um documento que descreve a estrutura da Escola, bem como apresenta o Projeto Político-Pedagógico e as metas da Gestão Escolar para cada ano escolar, tendo caráter complementar em relação ao Regimento Escolar. É elaborado em meados de fevereiro/março, a partir dos planos escolares anteriores, do Regimento Escolar, do planejamento escolar, das reuniões pedagógicas entre professores, orientação pedagógico-educacional e direção. Suas proposições derivam ainda das discussões ocorridas no Conselho de Escola, nos Conselhos e Reuniões de Classe e nos Ciclos de Avaliação, envolvendo toda a Comunidade Escolar.
Este documento tem como objetivos:
a) apresentar a estrutura e organização da EAFEUSP;
b) expor os princípios pedagógicos;
c) explicitar as metas administrativo pedagógicas que norteiam a Escola de Aplicação.
Sua aprovação ocorre no Conselho de Escola. Em seguida, o documento é encaminhado para análise e deliberação da Congregação da Faculdade de Educação e, posteriormente, à Diretoria de Ensino Centro-Oeste para homologação.