No que respeita a custos, a consola custa à Nintendo cerca de 33% mais em materiais do que a parente mais velha, a Nintendo DSi. Os custos totais, em dólares, ascendem aos 103,25. Estes custos apenas compreendem os custos de materiais e mão-de-obra (montagem), estando excluídos os gastos com transportes, I&D, marketing, etc. A consola é vendida em Portugal a cerca de 250 € (363.55 dólares – mas é comercializada nos US por 249,99 dólares | 587.77 reais). Apesar do preço final poder transparecer um preço superior em mais do dobro do preço de custo aqui transmitido, é de voltar a relembrar que os custos de transporte, I&D, marketing etc, não estão contabilizados e ainda, o preço final comercializado também engloba os impostos cobrados para a sua comercialização.
Outras conclusões do Teardown da iSuppli é que a maior parte dos componentes da consola nipónica é de origem japonesa, o que pode provocar algum efeito negativo no fornecimento da consola dados os recentes acontecimentos na terra atormentada pelo Godzilla.
Os cerca de 33 dólares de custo conjunto dos dois ecrãs da consola fazem com que estes componentes sejam os componentes mais caros do total, tomando conta de mais de 30% dos custos totais em componentes da N3DS.
Foi possível denotar que a nova consola aufere de uma capacidade de memória 8 vezes superior à Nintendo DSi, possibilitando assim a reprodução de jogos em 3D.