Várias associações regionais e grupos ambientalistas posicionaram-se contra o projeto, arguindo que este trabalho representa um impacto irreparável em paisagens ecologicamente importantes que são o lar de espécies-bandeira, aves rupícolas anfíbios, invertebrados de água doce, etc.
O projeto foi relatado para a Comissão Europeia por contradizer várias disposições da legislação ambiental europeia, incluindo as directivas sobre as Aves e os habitats pois a região afetada pela barragem faz parte da Rede Natura 2000, nas áreas específicas "Sabor e Maçãs Rios 'SPA e SIC e "Morais" SIC lar de 19 tipos de habitats, 9 espécies e 5 espécies vegetais de interesse comunitário.
Entre elas, três tipos de habitats e de espécies animais Canis lupus, classificados como prioritários.
Quanto à ZPE, foi nomeada pela presença de 34 espécies de aves selvagens, incluindo várias espécies de aves de rapina, muitas das quais nidificam nas margens do rio que ficarão submersas pela barragem.
O trabalho foi paralisado por um longo tempo e, finalmente, arquivou-se a queixa com uma resolução que confirma as acusações, mas afirma que
apesar das conclusões negativas da avaliação do impacto para o site e as soluções alternativas deve ser um plano ou projecto por razões imperiosas de interesse público de primeira ordem
não existe alternativa para alcançar os objetivos do projeto, que são a criação de uma reserva estratégica hidroelétrica necessárias para atingir a meta de aumentar as taxas de energia eólica, que depende variações naturais são difíceis de prever, em particular, e, geralmente, as reduções nas emissões de gases com efeito de estufa em Portugal.

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