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Inaugurado em primeiro de fevereiro de 2010 como campus avançado de Fortaleza, a sede do IFCE em Aracati iniciou sua atuação com a oferta dos cursos de Agenciamento de Viagens, Aquicultura e Informática. A primeira sede foram as instalações utilizadas até então pelo Centro Vocacional Tecnológico da cidade. E foi de lá que a unidade conseguiu passar dos 80 alunos inicialmente matriculados para mais de mil estudantes atendidos em sete anos de atividade.
Atualmente, o campus oferece uma diversidade bem maior de cursos, sendo todos gratuitos e com a qualidade que só uma instituição federal de ensino pode garantir. Entre as opções estão os técnicos em Aquicultura, Eventos, Guia de Turismo e Informática; um curso técnico Integrado em Petroquímica, para alunos que fazem o Ensino Médio e a formação técnica no próprio IFCE; e ainda quatro cursos superiores: Bacharelado em Ciência da Computação, Engenharia de Aquicultura, Licenciatura em Química e Tecnologia em Hotelaria.
Desde o final de 2017, o campus passou a funcionar em uma nova sede, localizada às margens da CE 040 e com capacidades para atender a expansão da unidade. A estrutura conta com 10 salas de aula, 10 laboratórios, bloco administrativo com 27 salas, auditório para 180 pessoas e biblioteca, numa área total de mais de 4.200m².
O campus de Aracati se consolidou como uma instituição de destaque no cenário local e regional do Vale do Jaguaribe, beneficiando estudantes e pessoas da comunidade externa e apresentando excelentes resultados na formação de profissionais altamente qualificados.
Criado oficialmente no dia 29 de dezembro de 2008, pela Lei nº 11.892, sancionada pelo então presidente Luiz Inácio Lula da Silva, o Instituto Federal do Ceará (IFCE) congrega os extintos Centros Federais de Educação Tecnológica do Ceará (Cefets/CE) e as Escolas Agrotécnicas Federais dos municípios de Crato e de Iguatu. O IFCE tem hoje 32 unidades, distribuídas em todas as regiões do Estado.