ReP USP - Detalhe do registro: Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano
Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano (2012)
Meyer, Diogo (Orientador)
Souza, Sandro José de (Orientador)
USP affiliated author: RAMALHO, RODRIGO FERNANDES - IB
Subjects: SELEÇÃO NATURAL; EVOLUÇÃO MOLECULAR; GENÉTICA
Keywords: Evolução; Evolution; Natural selection; Reguladores de splicing; Splicing regulators
Abstract: O splicing é o processo que resulta na remoção dos íntrons e união dos éxons nos genes eucarióticos. Nesse processo diversos elementos em cis e trans estão envolvidos. Além das sequências em cis canônicas (sítios de splicing, sítio de ramificação e trato de polipirimidina), os reguladores de splicing -- sequências curtas localizadas em éxons e íntrons - são considerados de grande importância, pois auxiliam na correta determinação das fronteiras éxons/introns. Através do splicing alternativo pode-se gerar grande diversidade de transcritos e atualmente sabe-se que no mínimo, 80% dos genes humanos apresentam variantes de splicing. A evolução dos Reguladores de Splicing Exônicos (ESRs) foi principalmente analisada através de abordagens filogenéticas. Embora esses estudos tenham revelado resultados consistentes (por exemplo, evidências de seleção negativa contra mudanças sinônimas que afetam ESRs) outros ainda parecem contraditórios, como a maior conservação filogenética e a maior taxa de evolução não-sinônima dos éxons alternativos em relação aos constitutivos. Nesta tese abordamos questões sobre o regime e a intensidade de seleção que atuam sobre os éxons e seus reguladores através da comparação da variação genética intra e inter-específica. Os resultados da tese demonstram que: 1. Há uma diferença na densidade e na intensidade de seleção negativa que atua sobre os ESRs de éxons constitutivos e alternativos. 2. Os inibidores de splicing tem papel principal na origem dos éxonsalternativos a partir de éxons constitutivos e também nos casos de uso alternativo de sítios de splicing. 3. O nível de inclusão dos éxons está diretamente relacionado com a intensidade de seleção negativa sobre mudanças não-sinônimas
RAMALHO, Rodrigo Fernandes. Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano. 2012. Tese (Doutorado) – Universidade de São Paulo, São Paulo, 2012. Disponível em: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-15102012-105825/. Acesso em: 29 jun. 2022.
Ramalho, R. F. (2012). Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano (Tese (Doutorado). Universidade de São Paulo, São Paulo. Recuperado de http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-15102012-105825/
Ramalho RF. Análise dos sinais de seleção natural em reguladores de splicing exônicos do genoma humano [Internet]. 2012 ;[citado 2022 jun. 29 ] Available from: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41131/tde-15102012-105825/