Em média, o exame é realizado em menos de 15 minutos, é indolor e não gera efeitos colaterais. É indicado estar com a bexiga vazia, ou seja, urine antes do procedimento. Em caso de suspeita de endometriose, pode ser necessário preparo intestinal.
Durante o ultrassom, a mulher permanece deitada em uma maca, com as pernas entreabertas e o quadril elevado. Então, o médico introduz uma sonda, devidamente protegida por um preservativo lubrificado, no canal vaginal. O objeto, de diâmetro pequeno, é manipulado pelo médico a fim de captar imagens de diferentes ângulos da pelve.