Nas décadas de 60 e 70, a Monsanto tornou-se numa de 10 produtores do Agente Laranja para as operações militares dos EUA no Vietname.
Em 1980, a Monsanto estabeleceu o prémio Edgar Monsanto Queeny para a Segurança, em homenagem ao seu antigo presidente (1928–1960), para encorajar a prevenção de acidentes.
Os cientistas da Monsanto tornaram-se os primeiros a modificar geneticamente células de uma planta, em 1982. Cinco anos depois, a Monsanto conduziu os primeiros testes de culturas geneticamente modificados no terreno.
Através de processos de fusões ou Spin-offs entre 1997 e 2002, a Monsanto fez uma transição, deixando de ser um gigante químico, para tornar-se num gigante de biotecnologia. Parte desse processo envolveu a venda por parte da Monsanto, em 1999, da fábrica de fenilalanina à Great Lakes Chemical Corporation (GLC), por 125 milhões de dólares. Em 2000, a GLC processou a Monsanto devido a uma quebra de 71 milhões de dólares em relação às vendas expectadas.
Em 2001, um químico reformado da Monsanto chamado William S. Knowles, foi nomeado co-vencedor do Prémio Nóbel da Química pela sua pesquisa sobre a hidrogenação catalítica assimétrica, que foi realizada primariamente na Monsanto, na década de 60, até à sua reforma em 1986.
Ao longo de 2004 e 2005 a Monsanto abriu processos contra muitos agricultores no Canadá e nos E.U.A. no âmbito da violação de patentes, mais especificamente o cultivo de sementes contendo os genes patenteados pela Monsanto, por parte dos agricultores. Em alguns dos casos os agricultores alegaram que as sementes foram semeadas involuntariamente, tendo sido trazidas pelo vento, vindas de safras vizinhas, alegação essa rejeitada no caso Monsanto Canada Inc. contra Schmeiser. Essas instâncias começaram em meados do meio até ao final da década de 90, sendo que um dos casos mais significativos foi decido em favor da Monsanto, pela Suprema Corte do Canadá. Com uma votação de 5-4, no final de Maio de 2004, o tribunal decidiu que “ao cultivar uma planta contendo o gene patenteado e composto por células patenteadas sem licença, os recorrentes (Percy Schmeiser, produtor de Colza), privaram os acusadores da total exploração da sua patente”. Com esta decisão, os tribunais canadianos seguiram o Supremo Tribunal dos E.U.A. na sua decisão sobre questões de patentes envolvendo plantas e genes.
Em Fevereiro de 2005, a Monsanto fez pedidos de patente sobre técnicas para a criação de suínos que, iriam conceder-lhes a propriedade de todos os porcos nascidos de tais técnicas e todos os rebanhos relacionados. A Greepeace afirma que a Monsanto está a tentar reivindicar a propriedade sobre técnicas de criação comuns. A Monsanto alega que a patente é uma medida preventiva para rastrear os animais do seu sistema. A empresa acrescenta ainda que o método patenteado utiliza um aparelho de inseminação especializado que exige menos espermatozóides do que normalmente é necessário.
Em 2006, a Public Patent Foundation apresentou pedidos, juntamente com a United States Patent and Trademark Office para revogar quatro patentes que a Monsanto tem usado nos seus processos de patentes contra os agricultores. Na primeira ronda de re-examinação, todas as quatro patentes foram revogadas pelo Escritório de Patentes, em quatro decisões distintas, datadas desde Fevereiro até Julho de 2007. A Monsanto tem, desde então, apresentado respostas às re-examinações.
Em Outubro de 2008, a divisão canadiana da empresa, a Monsanto Canada Inc. foi nomeada pela MediaCorp Canada Inc. como uma das empregadoras presentes no Top 100 do Canadá, algo que foi apresentado na revista Maclean’s. Mais tarde nesse mesmo mês, a Monsanto Canada Inc. foi também nomeada como uma das empregadoras de topo pela Manitoba, algo que foi anunciado pelo jornal Winnipeg Free Press.

Na última quinta-feira, 25 de fevereiro, a Incubadora de Empresas de Base Tecnológica da Unicamp (Incamp) recebeu em seu auditório o grupo Inseed Investimento, gestora de recursos focada em inovação early stage, que tem como objetivo gerar valor para investidas e investidores e é responsável pela gestão do Criatec 1, Criatec 3 - fundo de Investimento com a finalidade de capitalizar as micro e pequenas empresas inovadoras - e FIMA (Fundo de Inovação em Meio Ambiente) – que disponibiliza R$ 165 milhões para investimento. Edismar Rezende, representante da iniciativa, apresentou o Inseed, o Criatec 3 e o FIMA, além de abordar peculiaridades do processo de avaliação, ferramentas de valuation desenvolvidas, oportunidades e disponibilidade de recursos no cenário de crise. Ao final da apresentação do representante da Inseed, empresas incubadas na Incamp Geocrop e Cybox Tecnologia apresentaram seus pitches, assim como a empresa Calipso.
Foram apresentados três pontos chave a serem analisados incialmente em uma empresa candidata a receber investimento: o perfil dos empreendedores, a inovação tecnológica e o mercado a ser explorado. Em relação aos empreendedores, a gestora analisa comprometimento com o negócio, postura construtiva e colaborativa e também o background da equipe em empreender. Em inovação é analisado quais os benefícios adicionais que a empresa traz e quais as barreiras, ou seja, valor de concorrência e dispositivos que não permitam cópia por parte de terceiros. E, na análise de mercado, é observado a força macroeconômica, disponibilidade de recursos, necessidade dos serviços ou produtos oferecidos e soluções disponíveis para o mercado.
Rezende explicou o que se deve pensar sobre seu negócio antes de conversar com potenciais investidores. “É necessário ter clareza sobre o modelo de negócio e oferta de valor, sobre a inovação que permite que sua empresa se diferencie de forma significativa no mercado e de outros players e sobre a visão de crescimento do negócio. A Inseed Investimentos constrói a tese de investimentos com o empreendedor, ou seja, ajuda na definição de onde e como se deseja chegar. O Criatec 3 é uma real oportunidade em meio à crise econômica que o país está enfrentando”, afirma, reforçando que é a inovação que dá grandes diferencias ao negócio.
Com fundo total de R$ 200 milhões de capital comprometido e valores aportados por empresa variando de R$ 1,5 a R$ 10 milhões, o Criatec 3 é voltado para empresas estabelecidas no Brasil, que desenvolvam tecnologias inovadoras e que tenham potencial de crescimento, com possibilidade de inscrição no Fundo até 2019 e com duração total de 10 anos. São selecionadas micro e pequenas empresas com faturamento líquido de até R$ 12 milhões (no ano anterior ao investimento), nos seguintes setores: tecnologia da informação e da comunicação, biotecnologia, agronegócio, novos materiais e nanotecnologia.
A história do grupo é baseada nos gestores da incubadora da UFMG (Universidade Federal de Minas Gerais), que desejavam aumentar a conexão entre a academia e o mercado. Por isso, em 2007, surgiu a Inseed, com a finalidade de gerir o Criatec 1, primeiro fundo de investimento em empresas emergentes criado pelo BNDES (Banco Nacional de Desenvolvimento Econômico e Social), voltado especificamente para empresas nascentes e, também, o maior do país até então. Outro fundo gerido é o FIMA, criado em 2011. “Apesar da tendência sustentável, é difícil achar negócios inovadores dentro desta temática para investir”, conta Rezende.