Alton aproveitou todo o seu talento e treinamento para criar o Good Eats, um esperto e divertido programa que mistura saciedade com sabedoria, história com cultura pop e ciência com o senso comum culinário. O programa foi ao ar no ano de 1999, no Food Network e Alton não apenas escreveu e produziu o programa, como também estrelou cada episódio das 14 temporadas. O programa, hoje em exibição no Food Network Brasil, conquistou o Peabody Award em abril de 2007, por sua excelência nas notícias, educação e entretenimento, e começou a ser apresentado no Cooking Channel, em setembro de 2011.
No Food Network Brasil, Alton Brown também apresenta Mestres da Sabotagem (Cutthroat Kitchen), uma série que exige chefs astutos e estratégicos. Ele é o mediador perfeito para o caos proposto, e seu expertise e senso de humor deliciosamente diabólico dão o tom exato ao programa."
Alton também participa regularmente do Iron Chef América (Iron Chef America), The Next Iron Chef e Food Network Star: A Próxima Estrela (Food Network Star), três destaques da programação do Food Network no Brasil, como historiador de alimentos, cientista, comentarista e jurado. No Food Network Star: A Próxima Estrela (Food Network Star), Alton trabalha com Bobby Flay e Giada De Laurentiis na oitava temporada do programa, orientando uma equipe de cinco pessoas, no qual apenas uma será escolhida para ser a nova estrela do canal.