Bolsa 12/15294-7 - Sequenciamento de nova geração, Polimorfismo de um único nucleotídeo - BV FAPESP
EMU concedido no processo 2019/21644-0: SeqStudio" Genetic Analyzer System
Processo: 12/15294-7
Assunto(s): Sequenciamento de nova geração Polimorfismo de um único nucleotídeo
A avicultura é um dos setores do agronegócio que mais vem se destacando no Brasil, principalmente devido ao desenvolvimento das técnicas de melhoramento genético. Por meio de mapas genéticos saturados de marcadores moleculares, principalmente os SNPS (polimorfismos de base única), é possível mapear locos de características quantitativas (QTL) e desta forma, identificar alelos associados às características de interesse zootécnico. Uma das características de maior importância é a relacionada ao desenvolvimento muscular, principalmente o músculo de peito, por ser a parte de maior valor comercial. A grande dificuldade na seleção desta característica é que ela tem correlação positiva com as características de gordura, ou seja, ao selecionar para maior desenvolvimento de músculo de peito, ocorre simultaneamente o acúmulo de gordura. Com o objetivo inicial de realizar o mapeamento de QTLs para características de desempenho e carcaça, em 1999 foi iniciado no Brasil o Projeto Genoma da Galinha, uma parceria entre a EMBRAPA Suínos e Aves e a ESALQ/USP. Este projeto vem contribuindo para a Genômica avícola, e atualmente há grandes expectativas de avanços científicos com as tecnologias de sequenciamento de nova geração, que são capazes de gerar informações altamente reproduzíveis e informativas. Portanto, este projeto visa realizar o sequenciamento do genoma de duas linhagens parentais da EMBRAPA (corte e postura), para a detecção de SNPs e INDELs (deleções/inserções) por meio de ferramentas de Bioinformática numa região-alvo no cromossomo 2 da galinha, que foi associada anteriormente com deposição muscular peitoral. Em seguida, serão selecionados os polimorfismos de melhor qualidade, para realizar a anotação funcional. Estes resultados permitirão a construção de um catálogo detalhado dos polimorfismos nesta região e futuramente estes poderão ser validados em outras populações e as mutações causais poderão ser identificadas, contribuindo para o melhoramento genético brasileiro e mundial.
GODOY, T. F.; MOREIRA, G. C. M.; BOSCHIERO, C.; GHEYAS, A. A.; GASPARIN, G.; PADUAN, M.; ANDRADE, S. C. S.; MONTENEGRO, H.; BURT, D. W.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L. SNP and INDEL detection in a QTL region on chicken chromosome 2 associated with muscle deposition. ANIMAL GENETICS, v. 46, n. 2, p. 158-163, APR 2015. Citações Web of Science: 8.
GODOY, Thaís Fernanda. Identificação de polimorfismos em região do cromossomo 2 da galinha associado a deposição de músculo. 2014. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.