As doenças transmitidas ao homem pelos animais são designadas, genericamente, de zoonoses. O Centro de Controle de Zoonoses coordena, presta orientação técnica e normatiza o controle das zoonoses no município. Funciona também como unidade de referência nacional para zoonoses urbanas e como centro colaborador da Organização Mundial de Saúde/ OMS.
Serviços prestados: captura de animais encontrados em logradouros e vias públicas; vacinação contra raiva em focos de doença e nos cães resgatados do canil de apreensão; internação de cães e gatos agressores em canis individuais, em áreas de isolamento, para observação veterinária; registro de cães e demais animais passíveis de registro com vistas a garantir as normas de saúde pública.
Em conjunto com as Subprefeituras e com os Núcleos Regionais de Zoonoses da Secretaria Municipal de Saúde são prestados, ainda, os serviços de controle de roedores e controle epidemiológico da leptospirose; controle de vetores, tais como moscas, baratas, percevejos e carrapatos; controle de mosquitos ou pernilongos, através da captura de larvas; controle do mosquito transmissor do dengue.
As solicitações destes serviços podem ser feitas diretamente ao Centro de Controle de Zoonoses ou ainda ao SAC/ Serviço de Atendimento ao Cidadão da Subprefeitura em que se localiza seu bairro. O Centro de Controle de Zoonoses dispõe de biblioteca com acervo especializado nas áreas de zoonoses e medicina veterinária, que realiza empréstimos entre bibliotecas e também para funcionários da área de saúde pública. Consulta no local permitida ao público em geral.