O Município de São João do Pacuí integra o Território de Desenvolvimento Norte. Com área de 416km2, o território municipal compõe a Bacia do Rio São Francisco.
Em 2010, São João do Pacuí contava com população de 4.040 habitantes, dos quais 98,95% residiam em domicílios com energia elétrica, 68,27% contavam com coleta de lixo em seu domicílio, e 14,53% eram atendidos por serviços de abastecimento de água e de esgotamento sanitário inadequados. A renda per capita em São João do Pacuí era de R$346,53.
Nesse mesmo ano, a cada 1.000 crianças nascidas vivas em São João do Pacuí, 18,8 não deveriam sobreviver ao primeiro ano de vida. E, se os padrões de educação daquele ano se mantivessem ao longo de sua vida escolar, a geração de crianças que ingressava em 2010 na escola, quando completasse 18 anos, teria concluído 7,05 anos de estudo.
O Índice de Desenvolvimento Humano Municipal — indicador que considera dados de renda, educação e longevidade, tendo o valor 1,0 como melhor situação — de São João do Pacuí foi de 0,625 em 2010.
Segundo levantamento de 2017, o Município de São João do Pacuí compõe o Microterritório de Desenvolvimento de Montes Claros, a Comarca de Coração de Jesus, a Macrorregião de Saúde de Norte (Montes Claros), a Microrregião de Saúde de Norte (Montes Claros), e integra as áreas de abrangência da Superintendência Regional de Educação Montes Claros e da Superintendência Regional de Meio Ambiente e Desenvolvimento Sustentável Norte de Minas.