Since each graphical desktop provides its own window manager, which window manager you choose is usually influenced by which desktop you have selected. GNOME uses the <command>mutter</command> window manager, Plasma uses <command>kwin</command>, and Xfce (which we present later) has <command>xfwm</command>. The Unix philosophy always allows using one's window manager of choice, but following the recommendations allows an administrator to best take advantage of the integration efforts led by each project.
بما أن كل بيئة سطح مكتب توفر مدير نوافذ خاص بها، فإن اختيار الأولى يشمل اختيار الأخير عادة. تعتمد GNOME على مدير النوافذ <command>mutter</command>، أما KDE فتعتمد على <command>kwin</command>، وXfce (التي سنعرضها لاحقاً) لديها <command>xfwm</command>. تسمح فلسفة يونكس دائماً باستخدام مدير النوافذ الذي تريده، لكن اتباع التوصيات يسمح لمدير النظام بالاستفادة العظمى من جهود التكامل التي يبذلها كل مشروع.