A intensificação sem limites da agricultura é tão prejudicial para a biodiversidade quanto o é a cessação da actividade agrícola por parte dos agricultores, com o consequente declínio das zonas rurais. Uma estratégia comunitária a favor a biodiversidade deverá assegurar uma agricultura sustentável, no sentido mais lato, que integre, paralelamente aos aspectos biológicos, as vertentes económica e social e, em suma, contribua para a sobrevivência do meio rural. Por outro lado, a manutenção desta agricultura sustentável constitui um imperativo do modelo agrícola europeu, assente na defesa da multifuncionalidade da agricultura, tal como reiterado pelo Conselho e pelo Parlamento Europeu em diversas resoluções. A PAC é um instrumento útil a favor da biodiversidade, à semelhança das resoluções da Cimeira da Terra adoptadas nos Conselhos de Helsínquia e de Gotemburgo. Por conseguinte, é um erro limitar a defesa da biodiversidade ao âmbito restrito do segundo pilar da política agrícola comunitária - e, mais concretamente, aos programas ambientais de promoção da extensificação da agricultura orgânica, de preservação das espécies locais e de preservação dos diferentes habitats naturais, etc. por duas razões: em primeiro lugar, porque o segundo pilar da PAC representa 10% do orçamento para a agricultura e, em segundo lugar, porque os programas agro-ambientais, apesar de abrangerem 20% da superfície agrária, têm sido aplicados de uma forma muito desigual, limitando-se no momento actual quase exclusivamente às zonas menos produtivas de cinco Estados-Membros da União, situação que se vê agravada pela fraca importância atribuída à eco-condicionalidade das ajudas, a saber, aos mercados que deram origem a uma formulação de exigências mínimas. Seria, pelo exposto, necessário reforçar a eco-condicionalidade e assegurar um apoio activo aos mecanismos da política de mercados agrícolas a favor do meio ambiente e da biodiversidade. Importaria fazer com que estas exigências tivessem reflexo na legislação relativa à qualidade alimentar, aos produtos fitossanitários, às sementes e aos recursos genéticos.