As tarefas que incumbem à Agência encontram-se claramente definidas: emissão de certificados e pareceres, apoio técnico à Comissão, elaboração da documentação necessária, realização de inspecções e investigações, controlo da aplicação das normas, elaboração e financiamento de projectos de investigação, cooperação com países terceiros. A Comissão da Política Regional, dos Transporte e do Turismo acolheu positivamente outras importantes alterações, que definem quer a independência da Agência perante e Comissão, quer o dever de informação da agência relativamente ao Parlamento Europeu.