Com efeito, é em primeiro lugar a forma como a agricultura será gerida que fará a qualidade da produção dos biocombustíveis, e é isso que temos antes de mais de reter sobre esta questão. Os biocombustíveis em causa podem ser produzidos de forma produtivista, com OGM, com factores de produção por hectare: mas então o factor ecológico global seria negativo. Em contrapartida, se cumprirmos a lógica de orientação da Política Agrícola Comum desde há algum tempo, isto é, se praticarmos uma maior rotação das culturas e respeitarmos efectivamente o ambiente, então os biocombustíveis e a sua produção poderiam tornar-se um complemento positivo para os agricultores no que respeita à produção directa. Com efeito, mais vale produzir um biodiesel puro, um óleo puro, ou utilizar a biomassa para criar hidrogénio, do que obedecer a uma lógica que consiste em introduzir uma fraca percentagem de combustível de origem agrícola nos combustíveis que, esses, são sempre combustíveis fósseis, pelo que são sempre produtos extremamente poluentes na produção.