public void refreshTrajectories() {
		Atom a = null;
		int m = model.getTapePointer();
		int n = model.getAtomCount();
		for (int i = 0; i < n; i++) {
			if (trajectoryBitSet.get(i)) {
				a = model.getAtom(i);
				viewer.setTrajectory(i, m, a.getTrajectoryRx(), a.getTrajectoryRy(), a.getTrajectoryRz());
			}
		}
	}