Güvenlik Bilimleri Enstitüsü, öncelikle Jandarma ve Sahil Güvenlik Akademisinin (JSGA) öğretim elemanı ihtiyacını karşılamak ve Jandarma ve Sahil Güvenlik Teşkilatları personeline lisansüstü eğitim ile bilimsel anlayış ve bakış açısı kazandırmak amacıyla, JSGA bünyesinde 13 Ekim 2016 tarihinde kurulmuştur. Enstitü, disiplinler arası yüksek lisans ve doktora eğitimleri ile akademik camiada bir boşluğu doldurmak, teşkilatların ihtiyaçları doğrultusunda kurs, sertifika ve diğer eğitim programlarını düzenlemek, sivil kişilere güvenlik alanında lisansüstü ve meslek içi eğitimler vermek için yaratıcılık ve yeniliği teşvik ederek disiplinler arası yaklaşımı özendiren, ulusal ve uluslararası alanda sürdürülebilir bir marka değerini yaratmak isteyen, yükseköğretime açılan bir bilim kapısı olma hedefi yolunda ilerlemektedir. Enstitünün bu hedef doğrultusunda icra ettiği görevler;
Teşkilatın ihtiyaç duyduğu alanlarda lisansüstü eğitim-öğretim yapmak,
Akademi için öğretim elemanı yetiştirmek,
Teşkilatın ihtiyaç alanlarına yönelik yönetici adayı personel yetiştirilmesi için kurs, sertifika ve diğer eğitim programlarının oluşturulması ve uygulanmasını Akademi Araştırma ve Eğitim Merkezleri Müdürlüğü ile koordine içinde planlamak ve yürütmek, • Bilimsel araştırma, inceleme ve yayın faaliyetlerinde bulunmak,
Akademik danışmanlık hizmetleri yapmak,
Bilimsel toplantı, sempozyum, konferans, seminer, çalıştay vb. faaliyetleri düzenlemektir.
Enstitü bünyesinde teşkil edilen Suç Araştırmaları, Güvenlik Yönetimi, Kamu Yönetimi, Uluslararası Güvenlik ve Terörizm, Deniz Emniyeti ve Güvenliği Anabilim Dallarında (8) lisansüstü program (Suç Araştırmaları Tezli YL, Güvenlik Yönetimi Tezli-Tezsiz YL, Kamu Yönetimi Tezli YL-DR, Afet Yönetimi Tezli YL, Uluslararası Güvenlik ve Terörizm Tezli YL, Deniz Emniyeti ve Güvenliği Tezli YL) ile akademik faaliyetlerini sürdürmektedir.