Ankara Metrosu İşletmesi, hareketli blok sinyalizasyonu kavramını esas alan bir Otomatik Tren Kumandası (ATC) sistemiyle işletilmektedir. Bu sistemde, tren ile yol arasındaki çift yönlü iletişim, hat boyunca döşenmiş olan ve aynı zamanda trenin konumunu belirleme işlevini de yapan endüktif lup vasıtasıyla sağlanır. Otomatik Tren Kumandası (ATC) Sistemi, Ankara Metrosu işletim sisteminin üç farklı modda çalışmasını sağlamaktadır:
ATO : Tam Otomatik Mod
CABS : Yarı Otomatik Mod (Kabin Sinyalizasyonlu)
MANUEL (M) : Manuel Mod (sürücü kontrollü)
Ana hat üzerindeki işletme, normal olarak otomatik(ATO) veya Kabin-sinyalli (CABS) modlarında yapılır. Depodaki tren hareketleri ise sadece Kabin-sinyalli (CABS) veya Manuel (M) modlarında gerçekleştirilir. Servise çıkan her bir trenin önündeki kabin içerisinde sürekli bir sürücü bulunur. Sürücünün işletme moduna bağlı olarak değişik görev ve sorumlulukları vardır.
ATO Modu: ATC sistemi, ATO Modunda trene koruma sağlar. Hızlanma, boşta gitme, yavaşlama ve kapı açma gibi tren fonksiyonlarını kumanda eder. Kapı kapatma ve tren kalkış işlevleri sürücü tarafından başlatılır. Ana hat üzerindeki tren işletmesi için normal olarak ATO modu kullanılır.
CABS Modu: ATC sistemi tarafından trene koruma temin edilirken bütün tren işlevleri sürücü tarafından gerçekleştirilir. Bakım alanı dışındaki bölgelerde kullanılan normal işletme modu CABS'dir.
MANUEL(M) Modu: Tüm işlevler sürücü tarafından gerçekleştirilirken tren koruması işletme prosedürleriyle sağlanır. Bu mod, depodaki bakım alanı içerisinde kullanılan trenin normal işletme modudur. Aynı zamanda bu mod, özel arıza yönetimi durumlarında işletme prosedürlerine tam olarak uyulmak suretiyle, ana hatta da uygulanabilir.