Sosyal Bilimler Enstitüsü, 17 Mart 2006 Tarih ve 26111 Sayılı Resmi Gazete’de yayımlanarak yürürlüğe giren Ordu Üniversitesi’ne bağlı olarak Yüksek Lisans ve Doktora seviyesinde eğitim-öğretim ve araştırma yapılması amacıyla kurulmuştur.
Enstitümüzde 2008 yılında İktisat, Tarih, Türk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalları açılmış olup aynı yıl öğrenci alınmıştır. 2012 yılında Müzik Ana Sanat Dalı, 2013 yılında Çalışma Ekonomisi ve Endüstri İlişkileri Anabilim Dalı, 2013 yılında İlköğretim Anabilim Dalı Sınıf Öğretmenliği Eğitimi Bilim Dalı, 2014 yılında Sinema ve Televizyon Anabilim Dalı aktif hale gelmiştir. 2015 yılında Tarih Doktora Programı açılarak öğrenci almaya başlamıştır.
2009 Yılında Güzel Sanatlar Fakültesinin kurulmasıyla, Sahne Sanatları, Resim, Grafik ve Tasarım, Heykel, Seramik ve Cam, Fotoğrafçılık, Geleneksel, Moda Tasarımı ve İç Mimarlık ve Çevre Tasarım Ana Bilim dalları Enstitümüzde temsil edilmeye başlanmıştır. Ancak Ana Bilim Dalları Aktif değildir.
Enstitümüz bünyesinde bulunan Sosyal Bilimler Araştırmaları Dergisi, yılda iki sayı olarak yayın hayatına devam etmektedir. Dergimiz, sosyal bilim alanlarında yapılan tüm akademik çalışmaları kabul etmektedir.
Enstitümüzdeki aktif program sayısının artırılmasına yönelik çalışmalar devam etmektedir.