Alerjik astım tedavisinde eğer hastanın etkili korunma ve ilaç tedavisine rağmen bulguların kontrol altına alınamaması söz konusu olursa alerji aşısı, bu konuda deneyimli bir çocuk alerji uzmanı tarafından uygun şekilde yapılırsa çocuklarda etkili bir tedavidir. Alerji aşısı astıma neden olan alerjik maddelerin vücuda küçük dozlarda belirli aralarla verilerek vücudun immün sisteminin alerjiye karşı direncinin artırılmasını sağlayan bir tedavi yöntemidir. Alerji aşıları, dil altı ve cilt altı enjeksiyon aşısı olmak üzere iki tiptir. Dil altı aşısı 3 yaşından sonra, cilt altı enjeksiyon aşılar ise 5 yaşından sonra uygulanabilir.
Dil altı aşıların yan etkileri daha az iken, cilt altı enjeksiyon aşıları ise daha etkili bulunmuştur. Alerji aşı tedavisi astım bulgularını azaltmakta veya tamamen ortadan kaldırmaktadır. Buna bağlı olarak ilaç gereksinimi de azalmakta hatta bazı hastalarda ortadan kalkmaktadır. Sonuç olarak hayat kalitesi artmaktadır. Alerji aşılarında sadece uygun konsantrasyonlarda hastanın duyarlı olduğu alerjenler bulunmaktadır. Özellikle çok fazla alerjisi olan hastalarda, gerçek alerjinin tespiti ve çapraz reaksiyon yapan nedenlerin ayırt edilmesi için bileşene dayalı alerji testi yani moleküler alerji testi yapılabilmektedir. Bu testte alerji aşısının daha etkili bir şekilde seçilmesi, hastalığın ciddiyeti ve aşı süresi hakkında bilgi sağlamaktadır. Aşı süresi, 3 ila 5 yıl arasında yapılmaktadır. Yapılırken bazı hastalarda alerjik reaksiyon gelişebilir. Anafilaksi denilen sistemik reaksiyon çok nadir görülmekte ve böyle bir durum oluşursa aşı tedavisi sonlandırılmaktadır. Sonuç olarak alerji aşısı astımlı çocuklarda, astım belirtilerini ve ilaç ihtiyacını ortadan kaldıran, hayat kalitesini artıran önemli ve etkili bir tedavi yöntemidir.