Depo sistemleri için en gerekli olan sistemlerden birisi havalandırmadır. Ürün ve eşyaların istiflenmesine hava şartları oldukça önemlidir. Depo içerisinde yer alan ürünlerin depo havalandırma sistemleri ile korunması gereklidir. Depolarda havalandırma sisteminin yer alması, deponun bulunduğu alan kadar içerisinde temiz ve yeterli hava bulunmasını sağlamaktadır. Depo içerisinde yer alan ürünlerin kötü ve pis havadan korunması sağlanmakta ve bu sayede ürünlere zarar gelmesi önlenmektedir.Depo havalandırma sistemlerinin bir diğer artısı ısıtma ve soğutma sistemlerini içermesidir. Depolama sistemleri açısından oldukça önemli bir sistem olan havalandırma sistemi, depoda bulunan ürünün bulunması gereken oda sıcaklığında ayarlanmalı ve belirli saatlerde temiz ve kirli hava giriş-çıkışlarını sağlayacak yeterlilikte olmalıdır. Ürünlerin sıcaklık dereceleri dikkate alınarak depolarda bulunan odalara uygun sıcaklık dereceleri verilmelidir.
Havalandırma Sistemlerinin FaydalarıDepolarda yer alacak havalandırma sistemlerinin tek faydası ürünlerin temiz hava ile temas etmesini sağlamak değildir. Depo havalandırma sistemleri aynı zamanda yangın gibi doğal afetlerde deponun korunmasını sağlamaktadır. Günümüzde gelişen teknoloji ile birlikte havalandırma sistemlerine getirilen bu ek özellik ile yangınlar önlenebilmektedir.Her ürünün bulunması gereken sıcaklık düzeyi farklı olduğu için depo çalışanları açısından depo içerisinde uzun süre bulunmak ya da kalmak hayati risk teşkil edebilmektedir. Bu riski ortadan kaldırmak amacıyla kullanılan havalandırma sistemleri çalışanlar açısından iş güvenliği sağlayan bir sistemdir.Depolar içerisinde bulunan bazı makineler benzin, mazot veya LPG ile çalışabilmektedir. Özellikle sevkiyat amacı ya da ürünlerin taşınma amacı ile kullanılan araçlar bunlara örnektir. Bu makinelerden çıkan kirli hava hem ürünlere hem de depo çalışanlarına zarar verebilmektedir. Bu zararın önlenmesi için depolama sistemleri içerisinde mutlaka havalandırma sistemleri kullanılmalıdır.