Yıllar önce, Jake Sully ( Sam Worthington ) ağır şekilde yaralanmış ve o zamandan beri belden aşağısı felç olmuştur. Uzaktaki Pandora’ya seyahat etmesi için ona bir proje teklif edildiğinde, kabul eder. Gezegenin kendisi harikalarla ve aynı zamanda tehlikelerle dolu doğal bir cennettir. Ancak, Na’vi’nin altına girip onların zayıflıklarını bulması için görevlendirildiği için Sully zevk için burada değildir.
Na’visler gezegenin yerli insanlarıdır ve onları çevreleyen doğa ile uyum içinde yaşarlar. Pandora, çok değerli ham madde unobtainium açısından zengindir. Pandora’nın atmosferinde insanlar var olamayacağı için, insan ve Na’vi DNA’sından genetik olarak manipüle edilmiş melezlerin yaratıldığı bilimsel bir proje başlatıldı: sözde avatar. Bu avatar, insan beynini ve duygu reseptörlerini avatar vücuduna bağlayarak Sully tarafından kontrol edilir. Projenin başı bilim adamı Dr. Başlangıçta Jake’e şüpheyle yaklaşan Grace Augustine ( Sigourney Weaver ). Jake’in Pandora hakkındaki soruşturmaları sırasında genç ve güzel Na’vi karısı Neytiri ( Zoe Saldana) ile tanışır.) bu onu hemen büyülüyor. Onlar aracılığıyla yavaş yavaş Na’vislerin yaşamını ve kültürünü öğrendi. Ama Jake, Na’vis’le ne kadar çok zaman geçirirse, kendisiyle ve dış dünyayla o kadar çok çatışmaya giriyor. Tüm dünyanın kaderini belirleyecek bir savaşta kimin tarafında olacağını seçmesi gerekiyor.