Bu konu aslında tamamen net olmayan bir konu. Öncelikle, sünnetin HIV virüs riskini azalttığını gösteren birçok kanıt vardır. Aynı şekilde HPV virüsüne yakalanma ihtimalini de düşürdüğü bilinmektedir. Yani rastgele seçeceğiniz sünnetli birisinin HPV virüsünden müzdarip olma ihtimali, sünnet olmayan birine göre daha düşüktür. 2006'da yapılan bir meta analize göre genel olarak sünnetli insanların cinsel yolla bulaşan hastalıklara yakalanma ihtimali düşüktür (kaynak 1). Bu faydalarına rağmen, zararlı olduğunu öne sürebileceğimiz etkiler de vardır. En bariz olanı, sünnet olurken yaşanan acıdır. Özellikle eski zamanlarda bu acı maksimum düzeyde hissedilmekteydi. Cinsel zevk olarak ise, araştırmalar yine pek net değil. Çoğu araştırma alınan zevkin azalmadığını öne sürse de bunun tam tersini öne süren araştırmalar da vardır. Çok daha fazla araştırma isteyen bir konudur bu. Psikolojik etkileri de aynı sıkıntıya sahiptir, yine veri eksikliği vardır.