Zenginleştirme analizi olarak olağan bir adım, bir genler listesinde zenginleştirilmiş yolları çıkarmaktır. Ancak hangi veritabanının daha iyi olduğu hakkında bir tartışma bulamıyorum. En popüler olanlardan ikisi (benim özel ortamımda) Reactome ve KEGG'dir (Belki de Bioconductor'da bunları kullanan araçlar olduğu için). KEGG, ftp erişimi için bir abonelik gerektirir ve araştırmam için çok miktarda KGML dosyası indirmem gerekir. şimdi Reactome'a doğru eğiliyorum
Yollarla ilişkili daha fazla geni olan hangisi? Hangisi daha tam açıklamalı, bunları karşılaştıran herhangi bir kağıt var mı?