2000 yılında Ege Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği Bölümü'nden "Linux İşletim Sisteminde Güvenlik" konulu teziyle mezun oldu. 2001'de Türk Hava Yolları Bilgi Teknolojileri Başkanlığı’nda Mainframe sunuculardan sorumlu sistem mühendisi olarak göreve başlayan Emre Kunt, sonraki yıllarda Unix ve Linux sistemler ile Java tabanlı web uygulama sunucularının yönetiminden sorumlu kıdemli mühendis olarak çalıştı. 2005’te İstanbul Üniversitesi'nden MBA, 2009'da Marmara Üniversitesi'nden İşletme Anabilim Dalında doktor ünvanı aldı. 2011-2014 yılları arasında Türk Hava Yolları'nın iş kritik BT sistemlerinden sorumlu birim müdürü olarak görev aldı. 2014-1015 yıllarında Türk Hava Yolları Bilgi Teknolojileri Altyapı ve Operasyon Başkan Yardımcısı olarak görev aldı. Ocak 2016’dan bu yana aynı kurumda Bilgi Teknolojileri Altyapı ve Operasyon Başkanı görevini yürütmektedir.