नदी भारत-नेपाल सीमा के पूर्व में हिमालय पूर्व, गंगा बेसिन के ऊपर तिब्बती पठार के दक्षिण-मध्य भाग, तिब्बत के दक्षिण-पूर्वी भाग, पटकाई-बम पहाड़ियों, मेघालय पहाड़ियों के उत्तरी ढलानों, असम के मैदानों के दक्षिण-मध्य भाग में बहती है , और बांग्लादेश का उत्तरी भाग। बेसिन, विशेष रूप से तिब्बत के दक्षिण में, वर्षा के उच्च स्तर की विशेषता है। कंचनजंगा (8,586 मीटर) 8,000 मीटर से ऊपर एकमात्र चोटी है, इसलिए ब्रह्मपुत्र बेसिन के भीतर उच्चतम बिंदु है।