असम राज्य में 20 सितंबर, 1942 को क्षेत्रीय पुलिस स्टेशन में भारतीय राष्ट्रीय ध्वज फहराने का उद्देश्य 'मृणालू बाहिनी' था। 17 वर्षीय कनकलता की सरासर बहादुरी से प्रेरित होकर कई निहत्थे युवकों और ग्रामीणों ने थाने के प्रभारी अधिकारी बार-बार चेतावनी के बावजूद थाने की ओर मार्च किया। पुलिस ने जुलूस को आगे बढ़ाया देखते हुए, पुलिस सेना को बरा  दिया था । जुलूस का नेतृत्व कर रहे कनकलता पर निशाने लगा कर, जिसकी गोली मारकर हत्या कर दी गई और उसके झंडे को जमीन में ना गिरने देकर मुकुंदा कपाटी के नाम से जानने वाले एक ग्रामीण ब्यक्ति ने उठा लिया जिसे उसे भी पुलिस ने गोली मार दी । कनकलता बरुआ ने इस प्रकार अपनी मातृभूमि के लिए लड़ते हुए अपनी जान गंवा दी, जब वह केवल 17 वर्ष की थीं ।