generally speaking, pre-existing towns or settlements weren't renamed, and san francisco is the exception.  [according to the 1847 ordinance changing the name of the town,](_URL_0_) "yerba buena" was renamed "san francisco" to prevent confusion.  [look, for instance, at this 1839 American map of the US and Mexico-- the settlement of yerba buena is mislabeled as "st. francisco,"](_URL_4_) but the other dots on the map of california generally correlate with their modern names.  [see also this 1846 map,](_URL_1_) where most settlements (except for modern sacramento) have recognizable names-- and the settlement on san francisco bay is called "san francisco" by the cartographers rather than its proper name of "yerba buena."

there was no wholesale renaming. don't forget that a sizeable number of mexicans living in california flipped over to the american government during the mexican war.  i'll turn it over to a previous post i made, detailing the chaotic conditions in mexico that led to californios going over to the american side:

[Copy-pasted from a previous reply](_URL_2_):
 > [in addition to the internal warfare over control over the government, major portions of the country tried to secede.](_URL_3_) while the republic of the rio grande and the republic of yucatan never really got off the ground, texas managed to successfully beat back the mexican army and gained its independence in 1836.

 > california was not excluded from this political turmoil, and several mexican governors ended up getting being violently removed-- california governors micheltorena, gutierrez and victoria were all deposed by violent revolt. mexico was doing so badly at the time that multiple former mexican governors of california actually were in favor of being annexed by foreign powers. the relative stability brought by the americans was welcomed by a significant portion of californio society, including mariano vallejo, the richest man in california. many of the rest, like former mexican governors andres pico and pio pico, ended up staying on after the switch to american control and remaining prominent citizens. (andres pico, for instance, was elected to the california legislature and served in the state militia after the americans took over.) 

given this chaos, and the defection of large numbers of the californio elite, it's not surprising that the names stayed in place.  i have a handy table of the spanish, english, and modern names of the places marked, too, from north to south.

Spanish name | English name (1846 map) | Modern city
---|---|----
Nueva Helvetia | New Helvetia | Overtaken by the adjacent City of Sacramento in the 1800s
Yerba Buena | San Francisco | San Francisco
Misión Santa Clara de Asís | Santa Clara | Santa Clara
Pueblo San José de Guadalupe | San Jose | San Jose
Monterey | Monterey | Monterey
Misión San Miguel Arcángel | San Miguel | San Miguel
Misión San Luis Obispo de Tolosa | San Luis Obispo | San Luis Obispo
Misión La Purísima Concepción | La Purissima | Lompoc (named after the local ranch rather than the mission)
Misión Santa Bárbara | Santa Barbara | Santa Barbara
Misión San Buenaventura | San Buenaventura | Ventura (but the official name is still San Buenaventura)
Misión San Fernando Rey de España | San Fernando | Mission Hills (neighborhood of Los Angeles); the City of San Fernando is less than a mile away
Pueblo de Nuestra Señora la Reina de los Ángeles del Río de Porciúncula | Pueblo de los Angelos | Los Angeles
Misión San Juan Capistrano | San Juan | San Juan Capistrano
Misión San Luis Rey de Francia | San Luis | Oceanside (mission seized by the U.S. Army until 1865 and fell into disuse)
Misión San Diego de Alcalá | San Diego | San Diego
සාමාන්‍යයෙන් කථා කරන විට, පෙර පැවති නගර හෝ ජනාවාස නැවත නම් නොකළ අතර සැන් ෆ්‍රැන්සිස්කෝ යනු ව්‍යතිරේකයකි. [නගරයේ නම වෙනස් කරන 1847 ආඥාපනතට අනුව,](_URL_0_) &quot;yerba buena&quot; ව්‍යාකූලත්වය වැලැක්වීම සඳහා &quot;san francisco&quot; ලෙස නම් කරන ලදී. [බලන්න, උදාහරණයක් ලෙස, එක්සත් ජනපදයේ සහ මෙක්සිකෝවේ 1839 ඇමරිකානු සිතියමේ-- yerba buena ජනාවාස &quot;ශාන්ත ෆ්‍රැන්සිස්කෝ,&quot;](_URL_4_) ලෙස වැරදි ලෙස ලේබල් කර ඇත, නමුත් කැලිෆෝනියා සිතියමේ ඇති අනෙකුත් තිත් සාමාන්‍යයෙන් ඔවුන්ගේ නූතන සමග සහසම්බන්ධ වේ. නම්. [මෙම 1846 සිතියමද බලන්න,](_URL_1_) බොහෝ ජනාවාස (නූතන සැක්‍රමෙන්ටෝ හැර) හඳුනාගත හැකි නම් ඇත-- සහ සැන් ෆ්‍රැන්සිස්කෝ බොක්කෙහි ජනාවාස සිතියම් ශිල්පීන් විසින් එහි නියම නම වන &quot;යෙර්බා බුවනට වඩා &quot;සැන් ෆ්‍රැන්සිස්කෝ&quot; ලෙස හැඳින්වේ. .&quot; තොග නැවත නම් කිරීමක් සිදු නොවීය. මෙක්සිකානු යුද්ධයේදී කැලිෆෝනියාවේ වෙසෙන මෙක්සිකානුවන් සැලකිය යුතු සංඛ්‍යාවක් ඇමරිකානු රජයට පෙරළූ බව අමතක නොකරන්න. කැලිෆෝර්නියෝස් ඇමරිකානු පැත්තට යාමට හේතු වූ මෙක්සිකෝවේ අවුල් සහගත තත්ත්වයන් විස්තර කරමින් මම එය පෙර කළ සටහනකට හරවන්නෙමි: [පෙර පිළිතුරකින් පිටපත් කර ඇත](_URL_2_): &gt; [අභ්‍යන්තරයට අමතරව ආන්ඩුව පාලනය කිරීම සඳහා වූ යුද්ධය, රටේ ප්‍රධාන කොටස් වෙන් වීමට උත්සාහ කළහ.](_URL_3_) රියෝ ග්‍රෑන්ඩ් ජනරජය සහ යුකැටන් ජනරජය කිසි විටෙකත් ගොඩ නොනැගුණු අතර, ටෙක්සාස් මෙක්සිකානු හමුදාව සාර්ථකව පරාජය කර ජයග්‍රහණය කළේය 1836 දී එහි ස්වාධීනත්වය. &gt; කැලිෆෝනියාව මෙම දේශපාලන කැලඹීමෙන් බැහැර නොකළ අතර මෙක්සිකානු ආණ්ඩුකාරවරුන් කිහිප දෙනෙකු ප්‍රචණ්ඩ ලෙස ඉවත් කිරීම අවසන් විය-- කැලිෆෝනියා ආණ්ඩුකාරවරුන් වන micheltorena, gutierrez සහ victoria ප්‍රචණ්ඩ කැරැල්ලකින් බලයෙන් පහ කරන ලදී. මෙක්සිකෝව එකල කෙතරම් නරක ලෙස ක්‍රියා කරමින් සිටියේද යත්, කැලිෆෝනියාවේ හිටපු මෙක්සිකානු ආණ්ඩුකාරවරුන් කිහිප දෙනෙකු ඇත්ත වශයෙන්ම විදේශ බලවතුන් විසින් ඈඳා ගැනීමට පක්ෂව සිටියහ. ඇමරිකානුවන් විසින් ගෙන එන ලද සාපේක්ෂ ස්ථාවරත්වය, කැලිෆෝනියාවේ ධනවත්ම මිනිසා වන මරියානෝ වැලෙජෝ ඇතුළු කැලිෆෝර්නියෝ සමාජයේ සැලකිය යුතු කොටසක් විසින් පිළිගනු ලැබීය. හිටපු මෙක්සිකානු ආණ්ඩුකාරවරුන් වන ඇන්ඩ්‍රෙස් පිකෝ සහ පියෝ පිකෝ වැනි ඉතිරි බොහෝ දෙනෙක්, ඇමරිකානු පාලනයට මාරු වීමෙන් පසුව සහ ප්‍රමුඛ පුරවැසියන් ලෙස රැඳී සිටීම අවසන් විය. (උදාහරණයක් ලෙස, ඇන්ඩ්‍රෙස් පිකෝ, කැලිෆෝනියා ව්‍යවස්ථාදායකයට තේරී පත් වූ අතර, ඇමරිකානුවන් බලයට පත්වීමෙන් පසු ප්‍රාන්ත මිලීෂියාවේ සේවය කළේය.) මෙම අවුල් සහගත තත්ත්වය සහ කැලිෆෝර්නියෝ ප්‍රභූන් විශාල සංඛ්‍යාවකගේ අපගමනය සැලකිල්ලට ගෙන, නම් එම ස්ථානයේම පැවතීම පුදුමයක් නොවේ. . උතුරේ සිට දකුණ දක්වා සලකුණු කර ඇති ස්ථානවල ස්පාඤ්ඤ, ඉංග්‍රීසි සහ නවීන නම්වල පහසු වගුවක් මා සතුව ඇත. ස්පාඤ්ඤ නාමය | ඉංග්රීසි නම (1846 සිතියම) | නූතන නගරය ---|---|---- Nueva Helvetia | New Helvetia | 1800 ගණන්වලදී යාබද සැක්‍රමෙන්ටෝ නගරය අභිබවා ගියේය යෙර්බා බුවන | සැන් ෆ්රැන්සිස්කෝ | San Francisco Misión Santa Clara de Asís | සැන්ටා ක්ලාරා | Santa Clara Pueblo San José de Guadalupe | සැන් ජෝස් | San Jose Monterey | මොන්ටෙරේ | Monterey Misión San Miguel Arcángel | සැන් මිගෙල් | San Miguel Misión San Luis Obispo de Tolosa | San Luis Obispo | San Luis Obispo Misión La Purísima Concepción | ලා පුරිස්සම | ලොම්පොක් (මෙහෙයුමට වඩා දේශීය ගොවිපල ලෙස නම් කර ඇත) Misión Santa Bárbara | සැන්ටා බාබරා | Santa Barbara Misión San Buenaventura | San Buenaventura | Ventura (නමුත් නිල නාමය තවමත් San Buenaventura වේ) Misión San Fernando Rey de España | සැන් ප්‍රනාන්දු | මිෂන් හිල්ස් (ලොස් ඇන්ජලීස් අසල්වැසි); සැන් ප්‍රනාන්දු නගරය සැතපුමකට වඩා අඩු දුරකින් Pueblo de Nuestra Señora la Reina de los angeles del Río de Porciúncula | Pueblo de los Angelos | Los Angeles Misión San Juan Capistrano | සැන් ජුවාන් | San Juan Capistrano Misión San Luis Rey de Francia | සැන් ලුයිස් | Oceanside (මෙහෙයුම 1865 දක්වා එක්සත් ජනපද හමුදාව විසින් අල්ලාගෙන භාවිතයෙන් ඉවත් විය) Misión San Diego de Alcalá | සැන් ඩියාගෝ | සැන් ඩියාගෝ