the distinction is made based on the origin of the zooids

in everything from a fruit fly to a human the first fertilized cell divides many times into a mass of cells, aligns itsself along some gradient and develops bands of cells with know fates 

siphonophore cells bud off the first fertilized cell with their fate seemingly already determined. as you pointed out the function is the same but the development is distinct 
පළතුරු මැස්සෙකුගේ සිට මිනිසා දක්වා වූ සෑම දෙයකම සත්ත්ව විශේෂයේ මූලාරම්භය මත පදනම්ව වෙනස හඳුනාගෙන ඇත, පළමු සංසේචනය වූ සෛලය සෛල ස්කන්ධයකට බොහෝ වාරයක් බෙදී, යම් අනුක්‍රමයක් ඔස්සේ පෙළගස්වන අතර සිෆෝනොෆෝර් සෛල දෛවයේ අංකුර ඇති සෛල පටි වර්ධනය කරයි ඔවුන්ගේ ඉරණම දැනටමත් තීරණය කර ඇති බව පෙනෙන පරිදි පළමු සංසේචනය කළ සෛලය. ඔබ පෙන්වා දුන් පරිදි කාර්යය සමාන නමුත් සංවර්ධනය වෙනස් වේ 