The same way we do on land, really. It is basically the reasoning of 'if we haven't seen any trace of species X in a good number of years, most likely they are extinct.' Sometimes those assumptions are correct. sometimes they are very false. (Like with coelacanths) 

Though note that unexplored parts of the ocean don't necessarily have to mean you can't know if an animal species is extinct. Many species have very specific habitats they don't deviate from. If you have a species that can only exist in shallow water or tide-pools, for example, then the fact that the deep sea has not yet been explored is not really an issue. That is not where those animals could live in the first place. Additionally, you don't always need to have explored a region. A lot of this is based on traces of their survivals, but that doesn't necessarily mean seeing the fish in the flesh. Finding remnants of them in the stomachs of other fish, finding them in fishing nets, finding them washed up on beaches. all of that can count towards being able to tell a species exists still or not. And if there is a huge change in that (for example, we used to find X species frequently in the stomach of dolphins, but they haven't been spotted there in 30 years) that can be a good indicator said species is gone.

Again, not ever 100% and some species have clung onto life in places unknown to us at first, but still a reasonable guess. 
අපි ගොඩබිම කරන ආකාරයටම, ඇත්ත වශයෙන්ම. එය මූලික වශයෙන් තර්කය වන්නේ &#39;අපි හොඳ වසර ගණනකින් X විශේෂයේ කිසිදු හෝඩුවාවක් දැක නොමැති නම්, බොහෝ විට ඔවුන් වඳ වී ගොස් ඇත.&#39; සමහර විට එම උපකල්පන නිවැරදි වේ. සමහර විට ඒවා ඉතා බොරු ය. (සීලකාන්ත් මෙන්) සාගරයේ ගවේෂණය නොකළ කොටස් අනිවාර්යයෙන්ම සත්ව විශේෂයක් වඳ වී ගොස් ඇත්දැයි ඔබට දැනගත නොහැකි බව සැලකිල්ලට ගත යුතු බව සලකන්න. බොහෝ විශේෂවලට ඉතා නිශ්චිත වාසස්ථාන ඇත, ඒවායින් බැහැර නොවේ. ඔබට නොගැඹුරු ජලයේ හෝ උදම් තටාකවල පමණක් පැවතිය හැකි විශේෂයක් තිබේ නම්, උදාහරණයක් ලෙස, ගැඹුරු මුහුද තවමත් ගවේෂණය කර නොමැති බව ඇත්ත වශයෙන්ම ගැටළුවක් නොවේ. ඒ සත්තුන්ට මුලින්ම ජීවත් වෙන්න පුළුවන් තැනක් නෙවෙයි. අතිරේකව, ඔබට සෑම විටම කලාපයක් ගවේෂණය කිරීමට අවශ්‍ය නොවේ. මේවායින් බොහොමයක් ඔවුන්ගේ පැවැත්මේ හෝඩුවාවන් මත පදනම් වී ඇත, නමුත් එයින් අදහස් කරන්නේ මාංසයේ මාළු දැකීම නොවේ. අනෙකුත් මසුන්ගේ බඩේ ඒවා සොයා ගැනීම, මාළු දැල් තුළ ඒවා සොයා ගැනීම, වෙරළ තීරයේ ගසාගෙන ගොස් ඇති ඒවා සොයා ගැනීම. විශේෂයක් තවමත් පවතිනවාද නැද්ද යන්න පැවසීමට හැකිවීම සඳහා ඒ සියල්ල ගණන් ගත හැකිය. එහි විශාල වෙනසක් තිබේ නම් (උදාහරණයක් ලෙස, අපි ඩොල්ෆින් මත්ස්‍යයන්ගේ බඩේ නිතර X විශේෂයන් සොයා ගත්තෙමු, නමුත් වසර 30 කින් ඔවුන් එහි දක්නට ලැබුණේ නැත) එය හොඳ දර්ශකයක් විය හැකිය, විශේෂ අතුරුදහන් වී ඇති බව. නැවතත්, කිසි විටෙකත් 100% ක් නොවන අතර සමහර විශේෂයන් මුලින් අප නොදන්නා ස්ථානවල ජීවයට ඇලී ඇත, නමුත් තවමත් සාධාරණ අනුමානයකි. 