في المعلوماتية الحيوية يحدث خطأ في قراءة الحمض النووي عندما يغير مجم التسلسل قاعدة حمض نووي واحدة لقاعدة مختلفة ثم ستخدم القراءات من أداة تجميع التسلسل لإنشاء رسم بياني دي بروجين جراف ستخدم بطرق مختلفة للعثور على أخطاء القراءة نظرة عامة من طريقة تكوين رسم بياني دي بروين يمكننا أن نرى أن هناك إمكانية ل أضعاف عقد مختلفة لعمل ترتيبات الجينوم يمكن تقليل عدد العقد المستخدمة لإنشاء الرسم البياني من خلال النظر فقط في عدد  الموجود في سلسلة الحمض النووي المهمة بالنظر إلى التسلسل الأول يمكننا تحديد العقد ذات الحجم أو أمتار والتي ستكون في الرسم البياني هذه  ثم إنشاء الرسم البياني هو مبين في الشكل الرسم البياني الموضح في الشكل هو نسخة بسيطة للغاية لما يمكن أن يبدو عليه الرسم البياني يتكون هذا الرسم البياني من خلال أخذ آخر عناصر من  وربطها بالعقدة التي تكون عناصرها الستة الأولى متماثلة الشكل هو أبسط رسم بياني ل   حيث أن كل عقدة بها مسار واحد بالضبط مخرج واحد في معظم الأحيان سترى على الأرجح رسم بياني حيث يوجد أكثر من حافة موجهة إلى عقدة أو أكثر من حافة واحدة تترك عقدة يحدث هذا بسبب طريقة اتصال العقد ترتبط العقد بالحواف التي تشير إلى العقد إذا كانت عناصر الأخيرة من  التي تبحث عنها تتطابق مع عناصر الأولى لأي عقدة هذا يسمح لتكوين رسم بياني ذو حواف متعددة تحدث هذه الرسوم البيانية الأكثر تعقيد بسبب إما قراءة الأخطاء أو الاختلافات في سلاسل  كلا السببين يجعل من الصعب تحديد البنية الصحيحة للحمض النووي وما الذي يسبب الاختلافات نظر لأن معظم فروع الحمض النووي ستشتمل على الأرجح على أخطاء القراءة والاختلافات يأمل العلماء في استخدام عملية تجميع يمكنها دمج العقد في الرسم البياني عندما تكون متصلة بشكل لا لبس فيه بعد تنظيف الرسم البياني للرؤوس والحواف التي تم إنشاؤها بواسطة الأخطاء رأس وفقاعات عندما يتم تكوين رسم بياني من بيانات متسلسلة فإن أخطاء القراءة تشكل رأس وفقاعات الرأس هو المكان الذي حدث فيه خطأ أثناء عملية التسلسل وتسبب في إنهاء الرسم البياني قبل الأوان ويتضمن كلا من  الصحيحين وغير الصحيحين تتشكل الفقاعة أيض عند حدوث خطأ أثناء عملية قراءة التسلسل ومع ذلك أينما حدث الخطأ هناك مسار لقراءات  لإعادة الاتصال مع الرسم البياني الرئيسي والاستمرار كما لو لم يحدث شيء على الإطلاق عندما تكون هناك رأس وفقاعات موجودة في رسم بياني دي بروين تم تشكيلها من البيانات فقد تتم إزالتها فقط إذا حدث خطأ ما الذي تسبب في ظهور الطرف أو الفقاعة عندما يستخدم العلماء الجينوم المرجعي يمكنهم بسهولة وبسهولة تحديد مكان وجود النصائح من خلال مقارنة الرسم البياني للجينوم المرجعي والرسم البياني للتسلسل في حالة عدم وجود جينوم مرجعي يتم التخلص من هذه النصائح عن طريق تتبع الفروع إلى الخلف حتى يتم العثور على نقطة من الغموض ثم تتم إزالة هذه النصائح فقط إذا كان الفرع الذي يحتوي على الطرف أقصر من طول الحد الأدنى المحدد عملية إزالة الفقاعات أكثر تعقيد قليلا أول ما يجب القيام به هو تحديد بداية الفقاعة من هناك يتم اتباع كل مسار من بداية الفقاعة حتى نقطة إعادة الاتصال يمكن أن تكون نقطة إعادة الاتصال مختلفة لكل مسار نظر لوجود مسارات بأطوال مختلفة من عقدة البداية تتم إزالة المسار الذي يحتوي على تغطية أقل مثال نظر لتسلسل من أي طول فإن الخطوة الأولى التي يجب القيام بها هي إدخال التسلسل في برنامج التسلسل وتسلسله وقراءة زوج الأساس  بقراءة معينة نظر لعدم وجود برنامج تسلسلي دقيق تمام ستكون هناك دائم بعض القراءات التي تحتوي على أخطاء أكثر طرق التسلسل شيوع هي طريقة البندقية وهي الطريقة الأكثر استخدام في التسلسل بمجرد تحديد الطريقة يجب عليك تحديد طول قراءة  التي ترغب في إرجاعها في حالة التسلسل قام بإرجاع قراءة  مع كل الأخطاء التي حدثت أثناء العملية المذكورة باللون الأحمر بمجرد الحصول على القراءات يتم تجزئتها إلى  ثم يتم تسجيل  في جدول مع عدد المرات التي ظهر فيها كل  في القراءات في هذا المثال تم تجزئة كل قراءة إلى أمتار وإذا حدث خطأ فقد سجل باللون الأحمر ثم تم تسجيل جميع ال  بترددها في الجدول التالي بعد ذلك ستشكل كل خلية فردية في الجدول عقدة مما يسمح بتكوين رسم بياني ل   من  في الشكل يتم تحديد الامتدادات الخطية ثم يتم تشكيل رسم بياني آخر الشكل حيث أصبحت الامتدادات الخطية عقدة واحدة بحجم  مختلف مما يسمح برسم بياني أكثر إيجاز في هذا الرسم البياني المبسط من السهل تحديد العديد من النصائح والفقاعات كما هو مبين في الشكل ويمكن بعد ذلك إزالة هذه الفقاعات والنصائح حيث يمكننا تحديد أنها تشكلت من أخطاء في قراءة  مما يوفر لنا بنية الرسم البياني يجب أن تعكس بدقة وبشكل كامل التسلسل الأصلي إذا اتبعت الرسم البياني دي بروين الموضح في الشكل فسترى أن التسلسل الذي تم تشكيله يتوافق بالفعل مع تسلسل الحمض النووي الوارد في التسلسل مقارنة اثنين من فروع الحمض النووي عند مقارنة شريطين من الحمض النووي يتم استخدام الرسوم البيانية دي بروين الملونة بشكل متكرر لتحديد الأخطاء هذه الأخطاء في كثير من الأحيان الأشكال تسبب فقاعات على غرار تلك المذكورة أعلاه لتشكيل يوجد حالي أربع خوارزميات رئيسية تستخدم لتعميم البيانات وتحديد الفقاعات تقوم الخوارزميات الأربعة بتمديد الرسوم البيانية ل دي بروين عن طريق السماح للعقد والحواف الموجودة في الرسم البياني بتلوين العينات التي تم رصدها منها استدعاء فقاعة عرف الاستخدام الأبسط لرسومات دي بروين الملونة باسم خوارزمية استدعاء الفقاعات تبدو هذه الخوارزمية وفقاعات للجينوم التي تختلف عن الأصل وتحدد موقعها يجب أن تكون هذه الفقاعات نظيفة أو مجرد انحراف عن الجينوم المرجعي ولكن لا يمكن أن يكون سببها حذف قواعد الحمض النووي يمكن أن يكون لهذه الخوارزمية معدلات إيجابية عالية خاطئة نظر لوجود صعوبة في فصل الفقاعات الناتجة عن التكرار والمتغيرة ومع ذلك غالب ما يكون هناك جينوم مرجعي للمساعدة في تحسين الموثوقية يساعد الجينوم المرجعي أيض في اكتشاف المتغيرات وهو ضروري للكشف عن المواقع المتغيرة اكتشف العلماء مؤخر طريقة لاستخدام خوارزمية استدعاء الفقاعة مع اكتشاف تباين أرقام النسخ للسماح بفرصة الكشف غير المتحيز لهذه الاختلافات في المستقبل مسار الاختلاف عند النظر إلى المتغيرات المعقدة هناك احتمال ضئيل للغاية في أن يصنعوا تلوث نظيف نظر لأن هذا هو الحال في أغلب الأحيان تكون خوارزمية اختلاف المسار مفيدة خاصة عند النظر في مكان حدوث الحذف ويكون المتغير معقد إلى درجة أنه مقيد بالأليل المرجعي عندما تكون هناك فقاعة يتم استخدام خوارزمية تباعد المسار بشكل متكرر وتسمح للفقاعات المكتشفة بالحذف في إجراء منتظم للغاية تحدد الخوارزمية أولا كل نقطة اختلاف ثم من كل نقطة من نقاط الاختلاف يتم تتبع السلاسل التي تشكل الفقاعة للعثور على المكان الذي يرتبط فيه المساران بعد العقد في حالة انضمام المسارين تتم إزالة المسار ذي التغطية الأقل وتخزينه في ملف تحليل عينة متعددة يؤدي استخدام عينات متعددة إلى تحسين القدرة ومعدل الاكتشاف الخاطئ للكشف عن المتغيرات في أبسط الحالات يتم دمج العينات في مجموعة من لون واحد ويتم تحليل البيانات كما هو موضح سابق ومع ذلك من خلال الحفاظ على ألوان منفصلة لكل مجموعة عينة تقدم معلومات إضافية حول كيفية تكوين الفقاعات سواء عن طريق الخطأ أو عن طريق التكرار نفسها في عام قام قسم تطوير التكنولوجيا في   في فرامنجهام ماساتشوستس بتطوير نهج جديد يوفر طفرة في التعامل مع الفقاعات باستخدام اختبار التشخيص متعدد الأليل المحدد  يجمع هذا البرنامج بين نقطة النقطة الأمامية وتهجين التحقيق المتزامن المعق والكشف المباشر عن الطفرة للمساعدة في حل المشكلة المزدوجة لتحليل العينات المتعددة البنية الوراثية يمكن استخدام الرسوم البيانية الملونة ل   لتكوين أي عينة من الحمض النووي في مكان معروف حتى عندما تكون التغطية أقل من كافية للتجميع المتغير الخطوة الأولى لهذه العملية هي بناء رسم بياني للأليل المرجعي المتغيرات والبيانات المعروفة من العينة ثم تقوم الخوارزمية بحساب احتمالية كل نمط جيني وحسابات بنية الرسم البياني سواء في التسلسل المحلي أو على نطاق الجينوم ثم يعمم هذا على أنواع أليلية متعددة ويساعد على تكوين التركيب الوراثي ومتغيرات مركبة يتم استخدام هذه الخوارزمية بشكل متكرر حيث لا توجد فقاعات مشكلة للتعامل معها يساعد هذا أيض بشكل مباشر في العثور على المشكلات الأكثر تعقيد في الجينات بشكل مباشر أكثر من أي من الخوارزميات الثلاث المذكورة سابق تصنيف معلوماتية حيوية