Pasal VI dimulai dengan mengatakan bahwa tiga pasal berikutnya akan membahas keberatan yang mungkin timbul atas teori itu, yang pertama adalah bahwa sering kali tidak ada bentuk perantara antara spesies - spesies yang berkaitan erat, meskipun teori itu menyiratkan adanya bentuk - bentuk seperti itu. Sebagaimana dinyatakan Darwin, " Pertama - tama, mengapa, jika spesies - spesies telah turun dari spesies lain melalui gradasi yang sangat baik, tidakkah kita di mana - mana melihat bentuk transisi yang tak terhitung banyaknya? Mengapa tidak semua alam dalam kebingungan, bukannya spesies yang, seperti yang kita lihat mereka, didefinisikan dengan baik?" Darwin mengaitkan hal ini dengan persaingan antara berbagai bentuk, dikombinasikan dengan sejumlah kecil individu dari bentuk menengah, sering menyebabkan kepunahan bentuk - bentuk tersebut. Kesulitan ini dapat disebut sebagai ketiadaan atau langkanya varietas transisi di ruang habitat.
Apa yang akhirnya diputuskan Darwin adalah alasan bahwa alam bukanlah kekacauan variasi?
dengan persaingan antara berbagai bentuk, dikombinasikan dengan sejumlah kecil individu dari bentuk menengah, sering menyebabkan kepunahan bentuk - bentuk tersebut.