Setelah kualifikasi ketiga Kerry luka, ia berhak atas setiap peraturan Angkatan Laut untuk ditugaskan kembali jauh dari tugas tempur. Kerry memilih untuk ditugaskan kembali sebagai ajudan militer di Boston, New York atau Washington, DC tanggal 11 April 1969, ia melaporkan kepada Dinas Transportasi Laut Militer Atlantik yang berbasis di Brooklyn, di mana ia akan tetap bertugas aktif pada tahun berikutnya sebagai ajudan pribadi kepada seorang perwira, Laksamana Belakang Walter Schlech. Pada tanggal 1 Januari 1970 Kerry untuk sementara dipromosikan menjadi Letnan penuh. Kerry telah menyetujui perpanjangan tugas aktifnya dari Desember 1969 hingga Agustus 1970 untuk melaksanakan tugas Swift Boat. John Kerry bertugas aktif di Angkatan Laut Amerika Serikat dari bulan Agustus 1966 sampai Januari 1970. Ia terus melayani di Cagar Laut hingga Februari 1978.
Di mana Kerry ditugaskan kembali pada bulan April 1969?
kepada Dinas Transportasi Laut Militer Atlantik yang berbasis di Brooklyn