Algoritma kompresi genetika adalah generasi terbaru dari algoritma lossless yang mengkompres data (biasanya urutan nukleotida) menggunakan algoritma kompresi konvensional dan algoritma genetik yang diadaptasi ke tipe data tertentu. Pada 2012, tim ilmuwan dari Johns Hopkins University menerbitkan algoritma kompresi genetik yang tidak menggunakan genom referensi untuk kompresi. HAPZIPPER disesuaikan untuk data HapMap dan mencapai lebih dari 20-fold kompresi (95% pengurangan dalam ukuran berkas), menyediakan 2- sampai 4-fold kompresi yang lebih baik dan dalam waktu yang jauh lebih cepat dari umum terkemuka keperluan kompresi tujuan umum. Untuk ini, Chanda, Elhaik, dan Bader memperkenalkan pengkodean berbasis MAF (MAFE), yang mengurangi heterogenitas dataset dengan menyortir SNPs oleh frekuensi alele minor mereka, sehingga homogenisasi dataset tersebut. Algoritma lain pada tahun 2009 dan 2013 (DNAZip dan GenomeZip) memiliki rasio kompresi hingga 1200-fold yang memungkinkan 6 miliar genom manusia diploid dasar yang disimpan dalam 2.5 megabytes (relatif terhadap genom referensi atau rata-rata atas banyak genom).
Apa dua algoritma memiliki rasio kompresi hingga 1200-fold?
DNAZip dan GenomeZip