Pemberontakan nasional segera terhadap pemerintah baru dimulai oleh pemberontakan Kurdi tahun 1979 dengan pemberontakan Khuzestan, bersama dengan pemberontakan di Provinsi Sistan dan Baluchestan dan daerah-daerah lainnya. Selama beberapa tahun berikutnya, pemberontakan ini ditundukkan dengan cara kekerasan oleh pemerintah Islam baru. Pemerintah baru melakukan pembersihan sendiri dari oposisi politik non-Islam. Meskipun nasionalis maupun Marxis awalnya bergabung dengan Islamisme untuk menggulingkan Shah, puluhan ribu orang dieksekusi oleh pemerintah Islam sesudahnya.
Pemerintah Iran yang baru membersihkan dirinya dari oposisi politik apa?
non-Islam