Setelah menjalankan urusan militer kekaisaran di negara - negara bagian Coahuila dan Durango, Jenderal Agustín Enrique Brincourt membuat persiapan untuk menyerang negara bagian Chihuahua. Pada tanggal 8 Juli 1865 Brincourt menyeberangi Sungai Nazas di bagian utara Durango, menuju Chihuahua. Pada 22 Juli Brincourt menyeberangi bank Río Florido ke Ciudad Jiméneez; Suatu hari kemudian dia tiba di Valle de Allende di mana dia mengirim Kolonel Pyot dengan garnisun untuk mengambil alih Hidalgo del Parral. Brincourt melanjutkan melalui Santa Rosalia de Camargo dan Santa Cruz de Rosales. Presiden Juárez tetap di ibu kota negara sampai 5 Agustus 1865 ketika ia berangkat ke El Paso del Norte (saat Ciudad Juárez) karena bukti bahwa Prancis akan menyerang kota itu. Pada hari yang sama, Presiden bernama Jenderal Manuel Ojinaga gubernur baru dan menempatkan dia bertanggung jawab atas semua pasukan republik. Sementara itu, Jenderal Villagran terkejut pasukan kekaisaran mengendalikan Hidalgo de Parral; Kolonel Pyot dikalahkan dan terpaksa mundur. Pada Pertempuran Parral, Prancis kehilangan 55 orang untuk pasukan Republik. Pada tanggal 13 Agustus 1865, pasukan Prancis dengan kira - kira 2.500 pria tiba di pinggiran kota Chihuahua, dan pada tanggal 15 Agustus 1865, Jenderal Brincourt mengalahkan pasukan republik, menguasai ibu kota negara bagian. Brincourt menunjuk Tomás Zuloaga sebagai Prefek Chihuahua. Takut Perancis akan melanjutkan kampanye mereka ke El Paso del Norte, Presiden Juárez dipindahkan ke El Carrizal, tempat terpencil di pegunungan dekat El Paso del Norte, pada bulan Agustus 1865,. Akan mudah bagi pasukan Perancis untuk terus mengejar Presiden Juárez melintasi perbatasan, tapi mereka takut perselisihan dengan pasukan Amerika. Jenderal François Achille Bazaine memerintahkan pasukan Prancis untuk mundur kembali ke negara bagian Durango setelah hanya mencapai satu titik satu hari perjalanan ke utara Chihuahua City. Jenderal Brincourt meminta 1.000 orang untuk ditinggalkan untuk membantu mempertahankan kontrol atas negara, tapi permintaannya ditolak. Setelah kematian Jenderal Ojinaga, pemerintah Republik menyatakan Jenderal Villagran bertanggung jawab atas pertempuran melawan pasukan Imperial. Prancis meninggalkan negara pada 29 Oktober 1865. Presiden Juárez kembali ke Chihuahua City pada tanggal 20 November 1865 dan tetap tinggal di kota sampai tanggal 9 Desember 1865 ketika ia kembali ke El Paso del Norte. Tidak lama setelah presiden meninggalkan Chihuahua City, Terrazas dipulihkan sebagai gubernur negara pada tanggal 11 Desember 1865.
Pemerintah Republik menyatakan siapa yang bertanggung jawab atas perang melawan imperialis?
Jenderal Villagran