Suatu upaya pengurutan genom kapas telah dimulai pada tahun 2007 oleh konsorsium para peneliti umum. Mereka setuju pada strategi untuk mengurutkan genom kapas tetraploid yang dibudidayakan. "Testraploid" berarti bahwa kapas dibudidayakan sebenarnya memiliki dua genom terpisah dalam nukleusnya, disebut sebagai genom A dan D. Konsorsium sequencing pertama kali setuju untuk mengurutkan kerabat D-genom kapas yang dibudidayakan (G. raimondii, spesies kapas Amerika Tengah liar) karena ukurannya yang kecil dan terbatas unsur berulang. Ini hampir sepertiga jumlah basa kapas tetraploid (AD), dan setiap kromosom hanya ada sekali. [klafification needed] Genom G. arboreum akan diurut selanjutnya. Genomnya kira-kira dua kali ukuran G. raimondii. Sebagian dari perbedaan dalam ukuran antara kedua genom adalah penguatan retrotransposon (GORGE). Setelah genom diploid dirakit, riset dapat mulai mengurutkan genom yang sebenarnya dari varietas kapas yang dibudidayakan. Strategi ini adalah keluar dari kebutuhan; jika seseorang mengurutkan genom testraploid tanpa genom diploid model, urutan DNA euchromatic dari genom AD akan mengumpulkan dan unsur-unsur repetatif dari genom AD akan perakitan secara independen ke urutan A dan D masing-masing. Kemudian tidak akan ada cara untuk membatalkan kekacauan urutan AD tanpa membandingkan mereka untuk mitra diploid mereka.
Agar dapat memahami bentuk testraploid, apa yang harus digunakan sebagai perbandingan dalam cotton GORGE?
mitra diploid