Sekolah tersebut bubar dari University of Deseret dan menjadi Brigham Young Academy, dengan kelas yang dimulai pada tanggal 3 Januari 1876. Warren Dusenberry melayani sebagai kepala sekolah sementara selama beberapa bulan sampai bulan April 1876 sewaktu pilihan Brigham Young untuk menjadi kepala sekolah tiba seorang imigran Jerman bernama Karl Maeser. Di bawah pengarahan Maeser sekolah, banyak orang terpelajar termasuk masa depan Mahkamah Agung AS, George Sutherland, dan masa depan Senator Reed Smoot. Akan tetapi, sekolah itu tidak menjadi universitas hingga akhir masa jabatan Benjamin Cluff, Jr sebagai pimpinan institusi tersebut. Pada waktu itu, sekolah ini juga secara pribadi didukung oleh anggota masyarakat dan tidak diserap dan disponsori secara resmi oleh Gereja LDS hingga 18 Juli 1896. Serangkaian keputusan manajerial aneh oleh Cluff menyebabkan penurunan pangkatnya; Namun, dalam aksi resmi terakhirnya, ia mengusulkan kepada Dewan bahwa Akademi diberi nama "Brigham Young University." Saran ini menerima banyak sekali tentangan, dan banyak anggota Dewan mengatakan bahwa sekolah itu tidak cukup besar untuk menjadi universitas, tetapi keputusan itu akhirnya berlalu. Satu lawan keputusan, Anthon H. Lund, kemudian berkata, "Saya berharap kepala mereka akan tumbuh cukup besar untuk topi mereka."
Siapa yang bertanggung jawab untuk mengusulkan nama BYU saat ini?
Benjamin Cluff, Jr