Hidalgo diserahkan ke Uskup Durango, Francisco Gabriel de Olivares, untuk defrocking resmi dan ekskomunikasi pada tanggal 27 Juli 1811. Kemudian, ia dinyatakan bersalah atas pengkhianatan oleh pengadilan militer dan dieksekusi oleh regu tembak pada tanggal 30 Juli pukul 7 pagi. Sebelum dieksekusi, ia mengucapkan terima kasih kepada para sipirnya, Prajurit Pribadi Ortega dan Melchor, dalam surat - surat atas perlakuan manusiawi mereka. Pada eksekusinya, Hidalgo meletakkan tangan kanannya di atas hatinya untuk menunjukkan penembak di mana mereka harus bertujuan. Dia juga menolak menggunakan penutup mata. Tubuhnya, bersama mayat Allende, Aldama dan José Mariano Jiménez dipenggal, dan kepalanya dipajang di keempat sudut Alhóndiga de Granaditas di Guanajuato. Para kepala tetap di sana selama sepuluh tahun sampai akhir Perang Kemerdekaan Meksiko untuk menjadi peringatan bagi pemberontak lainnya. Tubuh Hidalgo yang tanpa kepala pertama kali dipamerkan di luar penjara tetapi kemudian dikuburkan di Gereja St Francis di Chihuahua. Jasad - jenazah itu belakangan akan dipindahkan pada tahun 1824 ke Mexico City.
Di negara bagian mana mayat tanpa kepala Hidalgo dikubur?
Chihuahua