Pada tahun 1640, pemerintah teokratis kota dan nine-square rencana berada di tempat, dan kota diganti nama Newhaven dari Quinnipiac. Namun, daerah sebelah utara New Haven tetap Quinnipiac sampai tahun 1678, sewaktu dinamai kembali Hamden. Perkampungan menjadi markas besar Koloni New Haven. Pada waktu itu, Koloni New Haven terpisah dari Koloni Connecticut, yang didirikan di sebelah utara pusat Hartford. Salah satu perbedaan utama antara kedua koloni itu adalah bahwa koloni New Haven adalah teokrasi tidak toleran yang tidak mengizinkan gereja - gereja lain didirikan, sementara koloni Connecticut mengizinkan berdirinya gereja - gereja lain.
Koloni mana yang terletak di sebelah utara Koloni New Haven, yang berpusat di sekitar daerah yang dikenal sebagai Hartford?
Koloni Connecticut