Ada keberatan ilmiah serius terhadap proses seleksi alam sebagai mekanisme kunci evolusi, termasuk Karl von Nägeli's bersikeras bahwa karakteristik sepele dengan tidak ada keuntungan adaptif tidak dapat dikembangkan oleh pilihan. Darwin mengakui bahwa ini bisa dikaitkan dengan karakteristik adaptif. Perkiraannya bahwa usia Bumi memungkinkan evolusi bertahap diperdebatkan oleh William Thomson (kemudian dianugerahi gelar Lord Kelvin), yang menghitung bahwa hal itu telah mendingin dalam waktu kurang dari 100 juta tahun. Darwin menerima warisan campuran, tetapi Fleeming Jenkin menghitung bahwa sebagai sifat campuran, seleksi alam tidak dapat mengumpulkan sifat - sifat yang berguna. Darwin mencoba untuk memenuhi keberatan ini dalam edisi ke-5. Mivart mendukung evolusi, dan menyusun keberatan ilmiah dan agama terhadap seleksi alam. Sebagai tanggapan, Darwin membuat perubahan besar pada edisi keenam. Masalah usia Bumi dan keturunan hanya diselesaikan pada abad ke-20.
Apa pembenaran untuk keberatannya terhadap proses seleksi alam Karl von Nägel memberi?
bersikeras bahwa karakteristik sepele dengan tidak ada keuntungan adaptif tidak dapat dikembangkan oleh pilihan