Jefferson dan James Madison konsep pemisahan sudah lama diperdebatkan. Jefferson menolak untuk mengeluarkan Proklamasi Thanksgiving dikirim kepadanya oleh Kongres selama kepresidenannya, meskipun ia mengeluarkan pernyataan Thanksgiving dan Doa sebagai Gubernur Virginia. Madison mengeluarkan empat pernyataan agama sementara Presiden, tapi memveto dua tagihan atas dasar mereka melanggar amandemen pertama. Di pihak lain, Jefferson dan Madison menghadiri upacara keagamaan di Capitol. Bertahun-tahun sebelum kratifikasi Konstitusi, Madison berpendapat "Karena jika Agama dibebaskan dari otoritas Lembaga secara umum, masih kurang bisa tunduk pada badan legislatif." Setelah pensiun dari kepresidenan, Madison menulis tentang "perpisahan gereja dari negara bagian." "Strongly dijaga sebagai pemisahan antara Agama & Pemerintah dalam Konstitusi Amerika Serikat," Madison menulis, dan dia menyatakan, "perbedaan praktis antara Agama dan Pemerintah Sipil sangat penting untuk kemurnian keduanya, dan dijamin oleh Konstitusi Amerika Serikat." Dalam surat kepada Edward Livingston Madison diperluas lebih lanjut, "Kami mengajarkan dunia kebenaran besar bahwa Pemerintah. melakukan lebih baik tanpa Raja & Mulia daripada dengan mereka. Manfaat akan berlipat ganda dengan pelajaran lain bahwa Agama berkembang dalam kemurnian yang lebih besar, tanpa selain dengan bantuan Pemerintah. " Draf asli Madison dari Bill of Rights telah termasuk ketentuan mengikat Amerika, serta Pemerintah Federal, dari sebuah pendirian agama, tetapi House tidak lulus mereka.
Jefferson menolak untuk mengeluarkan apa, ketika itu dikirim kepadanya oleh Kongres selama kepresidenannya?
Proklamasi Thanksgiving