Namun, kapas Bt tidak efektif untuk melawan banyak hama kapas, seperti serangga tanaman, kutu busuk, dan kutu - kutu; tergantung pada keadaan mungkin masih diinginkan untuk menggunakan insektisida terhadap ini. Sebuah penelitian tahun 2006 yang dilakukan oleh peneliti Cornell, Pusat Kebijakan Agricultural Cina dan Akademi Ilmu Pengetahuan Cina di pertanian kapas Bt di Cina menemukan bahwa setelah tujuh tahun hama sekunder yang biasanya dikendalikan oleh pestisida telah meningkat, mengurangi penggunaan pestisida pada tingkat yang sama dengan kapas non-Bt dan menyebabkan lebih sedikit keuntungan bagi para petani karena biaya ekstra benih GM. Akan tetapi, sebuah penelitian tahun 2009 oleh Akademi Sains Cina, Universitas Stanford dan Universitas Rutgers menyanggah hal ini. Mereka menyimpulkan bahwa kapas GM dengan efektif mengendalikan cacing. Kebanyakan hama sekunder adalah mirida (serangga tumbuhan) yang meningkat berkaitan dengan suhu dan curah hujan setempat dan hanya terus meningkat di setengah desa yang dipelajari. Selain itu, peningkatan penggunaan insektisida untuk mengendalikan serangga - serangga sekunder ini jauh lebih kecil daripada berkurangnya penggunaan insektisida total akibat adopsi kapas Bt. Sebuah penelitian di Cina 2012 menyimpulkan bahwa kapas Bt membagi - bagi penggunaan pestisida dan melipatgandakan tingkat kepik, renda, dan laba - laba. Dinas Internasional untuk Akuisisi Aplikasi Agri-biotech (ISAAA) mengatakan bahwa, di seluruh dunia, kapas GM ditanam di area 25 juta hektar pada 2011. Ini adalah 69% dari total area di seluruh dunia ditanam di kapas.
Apa yang dikatakan studi 2012 adalah dua kali lipat oleh penggunaan kapas Cina?
kepik, renda, dan laba - laba