text: supported_aminoacids = ["ALA", "ARG", "ASH", "ASN", "ASP", "CYS", "CYT", "GLH",
                          "GLN", "GLU", "GLY", "HID", "HIE", "HIS", "HIP", "ILE",
                          "LEU", "LYS", "LYN", "MET", "PHE", "PRO", "SER", "TRP",
                          "THR", "TYR", "VAL", "ACE", "NMA"]
  aminoacids_3letter = ['ALA', 'ARG', 'ASH', 'ASN', 'ASP', 'CYS', 'GLH', 'GLN',
                        'GLU', 'GLY', 'HID', 'HIE', 'HIS', 'HIP', 'ILE', 'LEU',
                        'LYS', 'LYN', 'MET', 'PHE', 'PRO', 'SER', 'TRP', 'THR',
                        'TYR', 'VAL']
  
  aminoacids_1letter = ["A",  "R", "D", "N", "D", "C", "E", "Q", "E", "G", "H", "H",
                              "H",  "H", "I", "L", "K", "K", "M", "F", "P", "S", "W", "T",
                              "Y", "V"]
  
  protein_atomnames_dictionary = {
      "END": [["H1", "1H", "HN1", "HN1", "HT1"], ["H2", "2H", "HN2", "HN2", "HT2"],
              ["H3", "3H", "HN3", "H", "HN3", "HT3"], ["OXT", "O1", "OT2", "OXT", "OXT"]],
      "ALA": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB1', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB1', 'HB1', 'HB1'], ['HB2', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB2', 'HB2', 'HB2'],
              ['HB3', '3HB', 'HB3', 'HB3', 'HB3', 'HB3', 'HB3'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "ARG": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG2', '1HG', 'HG1', 'HG1', 'HG2', '2HG', 'HG2'], ['HG3', '2HG', 'HG2', 'HG2', 'HG1', 'HG1', 'HG3'],
              ['HD2', '1HD', 'HD1', 'HD1', 'HD2', 'HD2', '2HD'], ['HD3', '2HD', 'HD2', 'HD2', 'HD1', 'HD1', 'HD3'],
              ['HE', 'HE', 'HNE', 'HE', 'HE', 'HE', 'HE'], ['HH11', '1HH1', 'HN11', 'HH11', 'HH11', 'HH11', 'HH11'],
              ['HH12', '2HH1', 'HN12', 'HH12', 'HH12', 'HH12', 'HH12'],
              ['HH21', '1HH2', 'HN21', 'HH22', 'HH21', 'HH21', 'HH21'],
              ['HH22', '2HH2', 'HN22', 'HH21', 'HH22', 'HH22', 'HH22'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD'],
              ['CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['NE', 'NE', 'NE', 'NE', 'NE', 'NE', 'NE'], ['NH1', 'NH1', 'NH1', 'NH1', 'NH1', 'NH1', 'NH1'],
              ['NH2', 'NH2', 'NH2', 'NH2', 'NH2', 'NH2', 'NH2'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "ASH": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HD2', 'HD2', 'HD2'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'], ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'],
              ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'], ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'],
              ['OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1'], ['OD2', 'OD2', 'OD2', 'OD2', 'OD2', 'OD2', 'OD2']],
      "ASN": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HD21', '1HD2', 'HN21', 'HD21', 'HD1', 'HD21', 'HD21'],
              ['HD22', '2HD2', 'HN22', 'HD22', 'HD2', 'HD22', 'HD22'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['ND2', 'ND2', 'ND2', 'ND2', 'ND2', 'ND2', 'ND2'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'],
              ['OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1']],
      "ASP": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'], ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'],
              ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'], ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'],
              ['OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1', 'OD1'], ['OD2', 'OD2', 'OD2', 'OD2', 'OD2', 'OD2', 'OD2']],
      "CYS": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG', 'HG', 'HSG', 'HG', 'HG', 'HG', 'HG'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'],
              ['SG', 'SG', 'SG', 'SG', 'SG', 'SG', 'SG']],
      "CYT": [['H', 'H', 'HN', 'HN', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'], ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'],
              ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'], ['SG', 'SG', 'SG', 'SG', 'SG', 'SG', 'SG']],
      "GLN": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', 'HB1', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG2', '1HG', 'HG1', 'HG1', '2HG', 'HG2', 'HG2'], ['HG3', '2HG', 'HG2', 'HG2', 'HG1', 'HG1', 'HG3'],
              ['HE21', '1HE2', 'HN21', 'HE1', 'HE21', 'HE21', 'HE21'],
              ['HE22', '2HE2', 'HN22', 'HE2', 'HE22', 'HE22', 'HE22'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'], ['OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1']],
      "GLY": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA2', '1HA', '2HA', 'HA1', 'HA2', 'HA2', 'HA1'],
              ['HA3', '2HA', 'HA2', 'HA2', 'HA1', 'HA1', 'HA2'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "GLU": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG2', '1HG', 'HG1', 'HG1', 'HG2', '2HG', 'HG2'], ['HG3', '2HG', 'HG2', 'HG2', 'HG1', 'HG1', 'HG3'],
              ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'], ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'],
              ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'], ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'],
              ['CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'], ['OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1'],
              ['OE2', 'OE2', 'OE2', 'OE2', 'OE2', 'OE2', 'OE2']],
      "GLH": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG2', '1HG', 'HG1', '2HG', 'HG2', 'HG2', 'HG2'], ['HG3', '2HG', 'HG2', 'HG2', 'HG1', 'HG1', 'HG3'],
              ['HE2', 'HE2', 'HE2'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'], ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'],
              ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'], ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'],
              ['CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'], ['OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1', 'OE1'],
              ['OE2', 'OE2', 'OE2', 'OE2', 'OE2', 'OE2', 'OE2']],
      "HIE": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN1'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2'], ['HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1'],
              ['HE2', 'HNE2', 'HE2', 'HE2'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2'],
              ['CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1'], ['NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "HID": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN1'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HD1', 'HD1', 'HND1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1'], ['HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2'],
              ['HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2'],
              ['CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1'], ['NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "HIP": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN1'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HD1', 'HD1', 'HND1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1'], ['HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2'],
              ['HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1'], ['HE2', 'HNE2', 'HE2', 'HE2'],
              ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'], ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'],
              ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'], ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'],
              ['CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2'], ['CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1', 'ND1'],
              ['NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2', 'NE2'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "ILE": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB', 'HB', 'HB', 'HB', 'HB3', 'HB', 'HB'], ['HG12', '1HG1', '2HG1', 'HG11', 'HG12', 'HG12', 'HG12'],
              ['HG13', '2HG1', 'HG12', 'HG12', 'HG11', 'HG11', 'HG13'],
              ['HG21', '1HG2', 'HG21', 'HG21', 'HG21', 'HG21', 'HG21'],
              ['HG22', '2HG2', 'HG22', 'HG22', 'HG22', 'HG22', 'HG22'],
              ['HG23', '3HG2', 'HG23', 'HG23', 'HG23', 'HG23', 'HG23'],
              ['HD11', '1HD1', 'HD11', 'HD11', 'HD11', 'HD11', 'HD11'],
              ['HD12', '2HD1', 'HD12', 'HD12', 'HD12', 'HD12', 'HD12'],
              ['HD13', '3HD1', 'HD13', 'HD13', 'HD13', 'HD13', 'HD13'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG1', 'CG1', 'CG1', 'CG1', 'CG1', 'CG1', 'CG1'], ['CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2'],
              ['CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "LYN": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H1', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG2', '1HG', 'HG1', 'HG1', 'HG2', 'HG2', 'HG2'], ['HG3', '2HG', 'HG2', 'HG2', 'HG1', 'HG1', 'HG3'],
              ['HD2', '1HD', 'HD1', 'HD1', 'HD2', 'HD2', 'HD2'], ['HD3', '2HD', 'HD2', 'HD2', 'HD1', 'HD1', 'HD3'],
              ['HE2', '1HE', 'HE1', 'HE1', 'HE2', 'HE2', 'HE2'], ['HE3', '2HE', 'HE2', 'HE2', 'HE1', 'HE1', 'HE3'],
              ['HZ1', '1HZ', 'HNZ1', 'HZ1', 'HZ1', 'HZ1', 'H11'], ['HZ2', '2HZ', 'HNZ2', 'HZ2', 'HZ2', 'HZ2', 'H12'],
              ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'], ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'],
              ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'], ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'],
              ['CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD'], ['CE', 'CE', 'CE', 'CE', 'CE', 'CE', 'CE'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['NZ', 'NZ', 'N1', 'NZ', 'NZ', 'NZ', 'NZ'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "LYS": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H1', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG2', '1HG', 'HG1', 'HG1', '2HG', 'HG2', 'HG2'], ['HG3', '2HG', 'HG2', 'HG2', 'HG1', 'HG1', 'HG3'],
              ['HD2', '1HD', 'HD1', 'HD2', '2HD'], ['HD3', '2HD', 'HD2', 'HD2', 'HD1', 'HD1', 'HD3'],
              ['HE2', '1HE', 'HE1', '2HE', 'HE2'], ['HE3', '2HE', 'HE2', 'HE2', 'HE1', 'HE1', 'HE3'],
              ['HZ1', '1HZ', 'HNZ1', 'HZ1', 'HZ1', 'HZ1', 'H11'], ['HZ2', '2HZ', 'HNZ2', 'HZ2', 'HZ2', 'HZ2', 'H12'],
              ['HZ3', '3HZ', 'HNZ3', 'HZ', 'HZ3', 'HZ3', 'HZ3'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD'],
              ['CE', 'CE', 'CE', 'CE', 'CE', 'CE', 'CE'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['NZ', 'NZ', 'N1', 'NZ', 'NZ', 'NZ', 'NZ'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "LEU": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG', 'HG', 'HG', 'HG', 'HG', 'HG', 'HG'], ['HD11', '1HD1', 'HD11', 'HD11', 'HD11', 'HD11', 'HD11'],
              ['HD12', '2HD1', 'HD12', 'HD12', 'HD12', 'HD12', 'HD12'],
              ['HD13', '3HD1', 'HD13', 'HD13', 'HD13', 'HD13', 'HD13'],
              ['HD21', '1HD2', 'HD21', 'HD21', 'HD21', 'HD21', 'HD21'],
              ['HD22', '2HD2', 'HD22', 'HD22', 'HD22', 'HD22', 'HD22'],
              ['HD23', '3HD2', 'HD23', 'HD23', 'HD23', 'HD23', 'HD23'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1'],
              ['CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "MET": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG2', '1HG', 'HG1', 'HG1', '2HG', 'HG2', 'HG2'], ['HG3', '2HG', 'HG2', 'HG2', 'HG1', 'HG1', 'HG3'],
              ['HE1', '1HE', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1'], ['HE2', '2HE', 'HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2'],
              ['HE3', '3HE', 'HE3', 'HE3', 'HE3', 'HE3', 'HE3'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CE', 'CE', 'CE', 'CE', 'CE', 'CE', 'CE'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'],
              ['SD', 'SD', 'SD', 'SD', 'SD', 'SD', 'SD']],
      "PHE": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1'], ['HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2'],
              ['HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1'], ['HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2'],
              ['HZ', 'HZ', 'HZ', 'HZ', 'HZ', 'HZ', 'HZ'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1'],
              ['CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2'], ['CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1'],
              ['CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2'], ['CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "PRO": [['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'], ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'],
              ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'], ['HG2', '1HG', '2HG', 'HG1', 'HG2', 'HG2', 'HG2'],
              ['HG3', '2HG', 'HG2', 'HG2', 'HG1', 'HG1', 'HG3'], ['HD2', '1HD', '2HD', 'HD1', 'HD2', 'HD2', 'HD2'],
              ['HD3', '2HD', 'HD1', 'HD2', 'HD1', 'HD1', 'HD3'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD', 'CD'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "SER": [['H', 'H', 'HN', 'HN', 'H2', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HG', 'HG', 'HOG', 'HG', 'HG', 'HG', 'HG'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'],
              ['OG', 'OG', 'OG', 'OG', 'OG', 'OG', 'OG']],
      "THR": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB', 'HB', 'HB', 'HB', 'HB1', 'HB3', 'HB'], ['HG1', 'HG1', 'HOG1', 'HG1', 'HG1', 'HG1', 'HG1'],
              ['HG21', '1HG2', 'HG21', 'HG21', 'HG21', 'HG21', 'HG21'],
              ['HG22', '2HG2', 'HG22', 'HG22', 'HG22', 'HG22', 'HG22'],
              ['HG23', '3HG2', 'HG23', 'HG23', 'HG23', 'HG23', 'HG23'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'], ['OG1', 'OG1', 'OG1', 'OG1', 'OG1', 'OG1', 'OG1']],
      "TRP": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1'], ['HE1', 'HE1', 'HNE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1'],
              ['HE3', 'HE3', 'HE3', 'HE3', 'HE3', 'HE3', 'HE3'], ['HZ2', 'HZ2', 'HZ2', 'HZ2', 'HZ2', 'HZ2', 'HZ2'],
              ['HZ3', 'HZ3', 'HZ3', 'HZ3', 'HZ3', 'HZ3', 'HZ3'], ['HH2', 'HH2', 'HH2', 'HH2', 'HH2', 'HH2', 'HH2'],
              ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'], ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'],
              ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'], ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'],
              ['CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1'], ['CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2'],
              ['CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2'], ['CE3', 'CE3', 'CE3', 'CE3', 'CE3', 'CE3', 'CE3'],
              ['CZ2', 'CZ2', 'CZ2', 'CZ2', 'CZ2', 'CZ2', 'CZ2'], ['CZ3', 'CZ3', 'CZ3', 'CZ3', 'CZ3', 'CZ3', 'CZ3'],
              ['CH2', 'CH2', 'CH2', 'CH2', 'CH2', 'CH2', 'CH2'], ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'],
              ['NE1', 'NE1', 'NE1', 'NE1', 'NE1', 'NE1', 'NE1'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "TYR": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB2', '1HB', '2HB', 'HB1', 'HB2', 'HB2', 'HB2'], ['HB3', '2HB', 'HB2', 'HB2', 'HB1', 'HB1', 'HB3'],
              ['HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1', 'HD1'], ['HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2', 'HD2'],
              ['HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1', 'HE1'], ['HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2', 'HE2'],
              ['HH', 'HH', 'HOH', 'HH', 'HH', 'HH', 'HH'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG', 'CG'], ['CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1', 'CD1'],
              ['CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2', 'CD2'], ['CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1', 'CE1'],
              ['CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2', 'CE2'], ['CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ', 'CZ'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O'],
              ['OH', 'OH', 'OH', 'OH', 'OH', 'OH', 'OH']],
      "VAL": [['H', 'H', 'HN', 'H2', 'HN', 'H', 'HN'], ['HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA', 'HA'],
              ['HB', 'HB', 'HB', 'HB3', 'HB', 'HB', 'HB'], ['HG11', '1HG1', 'HG11', 'HG11', 'HG11', 'HG11', 'HG11'],
              ['HG12', '2HG1', 'HG12', 'HG12', 'HG12', 'HG12', 'HG12'],
              ['HG13', '3HG1', 'HG13', 'HG13', 'HG13', 'HG13', 'HG13'],
              ['HG21', '1HG2', 'HG21', 'HG21', 'HG21', 'HG21', 'HG21'],
              ['HG22', '2HG2', 'HG22', 'HG22', 'HG22', 'HG22', 'HG22'],
              ['HG23', '3HG2', 'HG23', 'HG23', 'HG23', 'HG23', 'HG23'], ['C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C', 'C'],
              ['CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA', 'CA'], ['CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB', 'CB'],
              ['CG1', 'CG1', 'CG1', 'CG1', 'CG1', 'CG1', 'CG1'], ['CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2', 'CG2'],
              ['N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N', 'N'], ['O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O', 'O']],
      "HOH": [['1HW', 'H1', 'H1 1'], ['2HW', 'H2', 'H1 2'], ['OW', 'O', 'O1']],
      "ACE": [['CA', 'CH3'], ['HH31', 'HA1', 'H', '1H', 'H1'], ['HH32', 'HA2', '2H', 'H2'], ['HH33', 'HA3', '3H', 'H3'],
              ['C', 'C'], ['O', 'O']],
      "NMA": [['HH31', '1HA', 'HA1'], ['HH32', '2HA', 'HA2'], ['HH33', '3HA', 'HA3'], ['CA', 'C'], ['H', 'H'], ['N']],
  }
  
  supported_metals = ["MN", "MG", "ZN", "CA", "CU", "FE", "NI", "CO", "PB"]
  
  coordination_geometries = {
      'octahedric': [[90, 180], 6],
      'tetrahedric': [[109.5], 4]
  }
  
  default_mutations_maps = {
      'ALA-ARG': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['HG2', 'HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-ALA': ['disappear', 1, 0], 'ALA-ARG': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-ASH': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['OD1', 'OD2', 'HD2'],
          {'ALA-ASH': ['appear', 0, 1], 'ASH-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-ASN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['OD1', 'ND2', 'HD21', 'HD22'],
          {'ASN-ALA': ['disappear', 1, 0], 'ALA-ASN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-ASP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['OD1', 'OD2'],
          {'ALA-ASP': ['appear', 0, 1], 'ASP-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-CYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'SG']],
          ['HG'],
          {'CYS-ALA': ['disappear', 1, 0], 'ALA-CYS': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-GLH': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['HG2', 'HG3', 'CD', 'OE1', 'OE2', 'HE2'],
          {'GLH-ALA': ['disappear', 1, 0], 'ALA-GLH': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-GLN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['HG2', 'HG3', 'CD', 'OE1', 'NE2', 'HE21', 'HE22'],
          {'ALA-GLN': ['appear', 0, 1], 'GLN-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-GLU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['HG2', 'HG3', 'CD', 'OE1', 'OE2'],
          {'ALA-GLU': ['appear', 0, 1], 'GLU-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-GLY': [
          ['N', 'H', 'CA', 'O', 'C'],
          [['HA', 'HA2'], ['CB', 'HA3']],
          ('HB1', 'HB2', 'HB3'),
          {'GLY-ALA': ['appear', 1, 0], 'ALA-GLY': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['ND1', 'CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1'],
          {'HID-ALA': ['disappear', 1, 0], 'ALA-HID': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['ND1', 'CD2', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'ALA-HIE': ['appear', 0, 1], 'HIE-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['ND1', 'CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'HIP-ALA': ['disappear', 1, 0], 'ALA-HIP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB1', 'HB'], ['HB2', 'CG1'], ['HB3', 'CG2']],
          ['HG12', 'HG13', 'CD1', 'HG21', 'HG22', 'HG23', 'HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'ILE-ALA': ['disappear', 1, 0], 'ALA-ILE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['HG', 'CD1', 'CD2', 'HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'ALA-LEU': ['appear', 0, 1], 'LEU-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['HG2', 'HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'LYN-ALA': ['disappear', 1, 0], 'ALA-LYN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['HG2', 'HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'ALA-LYS': ['appear', 0, 1], 'LYS-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['HG2', 'HG3', 'SD', 'CE', 'HE1', 'HE2', 'HE3'],
          {'MET-ALA': ['disappear', 1, 0], 'ALA-MET': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ALA-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['CD1', 'CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'ALA-PHE': ['appear', 0, 1], 'PHE-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG'], ['H', 'CD']],
          ['HG2', 'HG3', 'HD2', 'HD3'],
          {'ALA-PRO': ['appear', 0, 1], 'PRO-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'OG']],
          ['HG'],
          {'ALA-SER': ['appear', 0, 1], 'SER-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB1', 'HB'], ['HB2', 'OG1'], ['HB3', 'CG2']],
          ['HG1', 'HG21', 'HG22', 'HG23'],
          {'ALA-THR': ['appear', 0, 1], 'THR-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['CD1', 'CD2', 'HD1', 'NE1', 'CE3', 'CE2', 'HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'ALA-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['HB1', 'CG']],
          ['CD1', 'CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'ALA-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ALA-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB1', 'HB'], ['HB2', 'CG1'], ['HB3', 'CG2']],
          ['HG11', 'HG12', 'HG13', 'HG21', 'HG22', 'HG23'],
          {'ALA-VAL': ['appear', 0, 1], 'VAL-ALA': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-ASH': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HG2', 'OD1'], ['HG3', 'OD2']],
          ['CD', 'HD3', 'NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-ASH': ['disappear', 0, 1], 'ASH-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-ASN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'OD1'], ['HG3', 'ND2'], ['CD', 'HD21'], ['HD2', 'HD22']],
          ['HD3', 'NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ASN-ARG': ['appear', 1, 0], 'ARG-ASN': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ARG-ASP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'OD1'], ['HG3', 'OD2']],
          ['CD', 'HD2', 'HD3', 'NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-ASP': ['disappear', 0, 1], 'ASP-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-CYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'SG'], ['HG2', 'HG']],
          ['HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'CYS-ARG': ['appear', 1, 0], 'ARG-CYS': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ARG-GLH': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['HD2', 'OE1'], ['HD3', 'OE2'], ['NE', 'HE2']],
          ['HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'GLH-ARG': ['appear', 1, 0], 'ARG-GLH': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ARG-GLN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['HD2', 'OE1'], ['HD3', 'NE2'], ['NE', 'HE21'], ['HE', 'HE22']],
          ['CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-GLN': ['disappear', 0, 1], 'GLN-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-GLU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['HD2', 'OE1'], ['HD3', 'OE2']],
          ['NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-GLU': ['disappear', 0, 1], 'GLU-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-GLY': [
          ['N', 'H', 'CA', 'O', 'C'],
          [['HA', 'HA2'], ['CB', 'HA3']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'HH11', 'HH12', 'NH2', 'HH21',
           'HH22'),
          {'GLY-ARG': ['appear', 1, 0], 'ARG-GLY': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ARG-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD3', 'CE1'], ['NE', 'NE2'], ['HE', 'HE1']],
          ['CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-HID': ['disappear', 0, 1], 'HID-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'CE1'], ['HD3', 'NE2'], ['NE', 'HE1'], ['HE', 'HE2']],
          ['CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-HIE': ['disappear', 0, 1], 'HIE-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD3', 'CE1'], ['NE', 'NE2'], ['HE', 'HE1'],
           ['CZ', 'HE2']],
          ['NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'HIP-ARG': ['appear', 1, 0], 'ARG-HIP': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ARG-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG12'], ['HG3', 'HG13'], ['CD', 'CD1'], ['HD2', 'HG21'],
           ['HD3', 'HG22'], ['NE', 'HG23'], ['HE', 'HD11'], ['CZ', 'HD12'], ['NH1', 'HD13']],
          ['NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ILE-ARG': ['appear', 1, 0], 'ARG-ILE': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ARG-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'HG'], ['HG3', 'CD1'], ['CD', 'CD2'], ['HD2', 'HD11'], ['HD3', 'HD12'], ['NE', 'HD13'], ['HE', 'HD21'],
           ['CZ', 'HD22'], ['NH1', 'HD23']],
          ['NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-LEU': ['disappear', 0, 1], 'LEU-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['HD3', 'HD3'], ['HD2', 'HD2'], ['NE', 'CE'], ['HE', 'HE2'], ['CZ', 'HE3'], ['NH1', 'NZ'], ['NH2', 'HZ1'],
           ['HH11', 'HZ2']],
          ['HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'LYN-ARG': ['appear', 1, 0], 'ARG-LYN': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ARG-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['HD3', 'HD3'], ['HD2', 'HD2'], ['NE', 'CE'], ['HE', 'HE2'], ['CZ', 'HE3'], ['NH1', 'NZ'], ['NH2', 'HZ1'],
           ['HH11', 'HZ2'], ['HH12', 'HZ3']],
          ['HH21', 'HH22'],
          {'ARG-LYS': ['disappear', 0, 1], 'LYS-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['CD', 'SD'], ['HD2', 'CE'], ['HD3', 'HE1'], ['NE', 'HE2'], ['HE', 'HE3']],
          ['CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'MET-ARG': ['appear', 1, 0], 'ARG-MET': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ARG-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD2', 'HD2'], ['HD3', 'CE1'], ['NE', 'CE2'], ['HE', 'HE1'],
           ['CZ', 'CZ'], ['NH1', 'HE2'], ['NH2', 'HZ']],
          ['HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-PHE': ['disappear', 0, 1], 'PHE-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['CD', 'CD'], ['HD3', 'HD3'],
           ['HD2', 'HD2']],
          ['H', 'NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['HG2', 'HG']],
          ['HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG1'], ['HG3', 'HG21'], ['CD', 'HG22'],
           ['HD2', 'HG23']],
          ['HD3', 'NE', 'HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-THR': ['disappear', 0, 1], 'THR-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD2', 'NE1'], ['HD3', 'CE3'], ['NE', 'CE2'], ['HE', 'HE1'],
           ['CZ', 'HE3'], ['NH1', 'CZ3'], ['NH2', 'CZ2'], ['HH11', 'HZ3'], ['HH12', 'HZ2'], ['HH21', 'CH2'],
           ['HH22', 'HH2']],
          [],
          {'ARG-TRP': ['', 0, 1], 'TRP-ARG': ['', 1, 0]},
      ],
      'ARG-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CZ', 'CZ'], ['HD2', 'HD2'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD3', 'CE1'], ['NE', 'CE2'],
           ['HE', 'HE1'], ['NH1', 'HE2'], ['NH2', 'OH'], ['HH11', 'HH']],
          ['HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-TYR': ['disappear', 0, 1], 'TYR-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ARG-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG11'], ['HG3', 'HG12'], ['CD', 'HG13'],
           ['HD2', 'HG21'], ['HD3', 'HG22'], ['NE', 'HG23']],
          ['HE', 'CZ', 'NH1', 'NH2', 'HH11', 'HH12', 'HH21', 'HH22'],
          {'ARG-VAL': ['disappear', 0, 1], 'VAL-ARG': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-ASN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'OD1'], ['OD2', 'ND2'], ['HD2', 'HD21']],
          ['HD22'],
          {'ASH-ASN': ['appear', 0, 1], 'ASN-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-ASP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'OD1', 'OD2'],
          [],
          ['HD2'],
          {'ASP-ASH': ['appear', 1, 0], 'ASH-ASP': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-CYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'SG'], ['OD1', 'HG']],
          ['OD2', 'HD2'],
          {'ASH-CYS': ['disappear', 0, 1], 'CYS-ASH': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-GLH': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3'], ['HD2', 'CD']],
          ['OE1', 'OE2', 'HE2'],
          {'ASH-GLH': ['appear', 0, 1], 'GLH-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-GLN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3'], ['HD2', 'CD']],
          ['OE1', 'NE2', 'HE21', 'HE22'],
          {'ASH-GLN': ['appear', 0, 1], 'GLN-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-GLU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3'], ['HD2', 'CD']],
          ['OE1', 'OE2'],
          {'GLU-ASH': ['disappear', 1, 0], 'ASH-GLU': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-GLY': [
          ['N', 'H', 'CA', 'O', 'C'],
          [['HA', 'HA2'], ['CB', 'HA3']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'OD1', 'OD2', 'HD2'),
          {'ASH-GLY': ['disappear', 0, 1], 'GLY-ASH': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['OD1', 'ND1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['HD1', 'CE1', 'NE2', 'HE1'],
          {'HID-ASH': ['disappear', 1, 0], 'ASH-HID': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['OD1', 'ND1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['CE1', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'HIE-ASH': ['disappear', 1, 0], 'ASH-HIE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['OD1', 'ND1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['HD1', 'CE1', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'ASH-HIP': ['appear', 0, 1], 'HIP-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['OD1', 'HG12'], ['OD2', 'HG13'], ['HD2', 'CD1']],
          ['HG21', 'HG22', 'HG23', 'HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'ASH-ILE': ['appear', 0, 1], 'ILE-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG'], ['OD2', 'CD1'], ['HD2', 'CD2']],
          ['HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'LEU-ASH': ['disappear', 1, 0], 'ASH-LEU': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3']],
          ['CD', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'ASH-LYN': ['appear', 0, 1], 'LYN-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3']],
          ['CD', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-ASH': ['disappear', 1, 0], 'ASH-LYS': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3'], ['HD2', 'SD']],
          ['CE', 'HE1', 'HE2', 'HE3'],
          {'ASH-MET': ['appear', 0, 1], 'MET-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['OD1', 'CD1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['HD1', 'CE1', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'ASH-PHE': ['appear', 0, 1], 'PHE-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3'], ['H', 'CD'], ['HD2', 'HD2']],
          ['HD3'],
          {'PRO-ASH': ['disappear', 1, 0], 'ASH-PRO': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['OD1', 'HG']],
          ['OD2', 'HD2'],
          {'SER-ASH': ['appear', 1, 0], 'ASH-SER': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['OD1', 'HG1'], ['OD2', 'HG21'], ['HD2', 'HG22']],
          ['HG23'],
          {'THR-ASH': ['disappear', 1, 0], 'ASH-THR': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'CD1'], ['OD2', 'CD2'], ['HD2', 'HD1']],
          ['NE1', 'CE3', 'CE2', 'HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-ASH': ['disappear', 1, 0], 'ASH-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASH-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['OD1', 'CD1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['HD1', 'CE1', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'ASH-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASH-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['OD1', 'HG11'], ['OD2', 'HG12'], ['HD2', 'HG13']],
          ['HG21', 'HG22', 'HG23'],
          {'ASH-VAL': ['appear', 0, 1], 'VAL-ASH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-ASP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'OD1'], ['ND2', 'OD2']],
          ['HD21', 'HD22'],
          {'ASN-ASP': ['disappear', 0, 1], 'ASP-ASN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-CYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'SG'], ['OD1', 'HG']],
          ['ND2', 'HD21', 'HD22'],
          {'ASN-CYS': ['disappear', 0, 1], 'CYS-ASN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-GLH': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['ND2', 'HG3'], ['HD21', 'CD'], ['HD22', 'OE1']],
          ['OE2', 'HE2'],
          {'ASN-GLH': ['appear', 0, 1], 'GLH-ASN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-GLN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['ND2', 'HG3'], ['HD21', 'CD'], ['HD22', 'OE1']],
          ['NE2', 'HE21', 'HE22'],
          {'GLN-ASN': ['disappear', 1, 0], 'ASN-GLN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASN-GLU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['ND2', 'HG3'], ['HD21', 'CD'], ['HD22', 'OE1']],
          ['OE2'],
          {'GLU-ASN': ['disappear', 1, 0], 'ASN-GLU': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASN-GLY': [
          ['N', 'H', 'CA', 'O', 'C'],
          [['HA', 'HA2'], ['CB', 'HA3']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'OD1', 'ND2', 'HD21', 'HD22'),
          {'ASN-GLY': ['disappear', 0, 1], 'GLY-ASN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'ND1'], ['ND2', 'CD2'], ['HD21', 'HD1'], ['HD22', 'CE1']],
          ['HD2', 'NE2', 'HE1'],
          {'ASN-HID': ['appear', 0, 1], 'HID-ASN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'ND1'], ['ND2', 'CD2'], ['HD21', 'CE1'], ['HD22', 'HD2']],
          ['NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'ASN-HIE': ['appear', 0, 1], 'HIE-ASN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'ND1'], ['ND2', 'CD2'], ['HD21', 'HD1'], ['HD22', 'CE1']],
          ['HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'ASN-HIP': ['appear', 0, 1], 'HIP-ASN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['OD1', 'HG12'], ['ND2', 'HG13'], ['HD21', 'CD1'],
           ['HD22', 'HG21']],
          ['HG22', 'HG23', 'HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'ASN-ILE': ['appear', 0, 1], 'ILE-ASN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD22', 'HD22'], ['HD21', 'HD21'], ['OD1', 'HG'], ['ND2', 'CD1']],
          ['CD2', 'HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD23'],
          {'ASN-LEU': ['appear', 0, 1], 'LEU-ASN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['ND2', 'HG3'], ['HD21', 'CD'], ['HD22', 'HD2']],
          ['HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'LYN-ASN': ['disappear', 1, 0], 'ASN-LYN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASN-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['ND2', 'HG3'], ['HD21', 'CD'], ['HD22', 'HD2']],
          ['HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'ASN-LYS': ['appear', 0, 1], 'LYS-ASN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['ND2', 'HG3'], ['HD21', 'SD'], ['HD22', 'CE']],
          ['HE1', 'HE2', 'HE3'],
          {'MET-ASN': ['disappear', 1, 0], 'ASN-MET': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASN-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'CD1'], ['ND2', 'CD2'], ['HD21', 'HD1'], ['HD22', 'CE1']],
          ['HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'PHE-ASN': ['disappear', 1, 0], 'ASN-PHE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASN-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['OD1', 'HG2'], ['ND2', 'HG3'], ['H', 'CD'], ['HD21', 'HD2'],
           ['HD22', 'HD3']],
          [],
          {'PRO-ASN': ['', 1, 0], 'ASN-PRO': ['', 0, 1]},
      ],
      'ASN-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['OD1', 'HG']],
          ['ND2', 'HD21', 'HD22'],
          {'ASN-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-ASN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['OD1', 'HG1'], ['ND2', 'HG21'], ['HD21', 'HG22'],
           ['HD22', 'HG23']],
          [],
          {'THR-ASN': ['', 1, 0], 'ASN-THR': ['', 0, 1]},
      ],
      'ASN-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'CD1'], ['ND2', 'CD2'], ['HD21', 'HD1'], ['HD22', 'NE1']],
          ['CE3', 'CE2', 'HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-ASN': ['disappear', 1, 0], 'ASN-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASN-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'CD1'], ['ND2', 'CD2'], ['HD21', 'HD1'], ['HD22', 'CE1']],
          ['HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'ASN-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-ASN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASN-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['OD1', 'HG11'], ['ND2', 'HG12'], ['HD21', 'HG13'],
           ['HD22', 'HG21']],
          ['HG22', 'HG23'],
          {'ASN-VAL': ['appear', 0, 1], 'VAL-ASN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-CYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'SG'], ['OD1', 'HG']],
          ['OD2'],
          {'ASP-CYS': ['disappear', 0, 1], 'CYS-ASP': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-GLH': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3']],
          ['CD', 'OE1', 'OE2', 'HE2'],
          {'ASP-GLH': ['appear', 0, 1], 'GLH-ASP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-GLN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3']],
          ['CD', 'OE1', 'NE2', 'HE21', 'HE22'],
          {'ASP-GLN': ['appear', 0, 1], 'GLN-ASP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-GLU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3']],
          ['CD', 'OE1', 'OE2'],
          {'GLU-ASP': ['disappear', 1, 0], 'ASP-GLU': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASP-GLY': [
          ['N', 'H', 'CA', 'O', 'C'],
          [['HA', 'HA2'], ['CB', 'HA3']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'OD1', 'OD2'),
          {'ASP-GLY': ['disappear', 0, 1], 'GLY-ASP': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'ND1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['HD1', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1'],
          {'HID-ASP': ['disappear', 1, 0], 'ASP-HID': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASP-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'ND1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'HIE-ASP': ['disappear', 1, 0], 'ASP-HIE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASP-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'ND1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['HD1', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'ASP-HIP': ['appear', 0, 1], 'HIP-ASP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['OD1', 'HG12'], ['OD2', 'HG13']],
          ['CD1', 'HG21', 'HG22', 'HG23', 'HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'ASP-ILE': ['appear', 0, 1], 'ILE-ASP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG'], ['OD2', 'CD1']],
          ['CD2', 'HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'LEU-ASP': ['disappear', 1, 0], 'ASP-LEU': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASP-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3']],
          ['CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'ASP-LYN': ['appear', 0, 1], 'LYN-ASP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3']],
          ['CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-ASP': ['disappear', 1, 0], 'ASP-LYS': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASP-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3']],
          ['SD', 'CE', 'HE1', 'HE2', 'HE3'],
          {'ASP-MET': ['appear', 0, 1], 'MET-ASP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'CD1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['HD1', 'CE1', 'HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'ASP-PHE': ['appear', 0, 1], 'PHE-ASP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['OD1', 'HG2'], ['OD2', 'HG3'], ['H', 'CD']],
          ['HD2', 'HD3'],
          {'PRO-ASP': ['disappear', 1, 0], 'ASP-PRO': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASP-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['OD1', 'HG']],
          ['OD2'],
          {'SER-ASP': ['appear', 1, 0], 'ASP-SER': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ASP-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['OD1', 'HG1'], ['OD2', 'HG21']],
          ['HG22', 'HG23'],
          {'THR-ASP': ['disappear', 1, 0], 'ASP-THR': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASP-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'CD1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['HD1', 'NE1', 'CE3', 'CE2', 'HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-ASP': ['disappear', 1, 0], 'ASP-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ASP-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['OD1', 'CD1'], ['OD2', 'CD2']],
          ['HD1', 'CE1', 'HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'ASP-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-ASP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ASP-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['OD1', 'HG11'], ['OD2', 'HG12']],
          ['HG13', 'HG21', 'HG22', 'HG23'],
          {'ASP-VAL': ['appear', 0, 1], 'VAL-ASP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-GLH': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'HG2']],
          ['HG3', 'CD', 'OE1', 'OE2', 'HE2'],
          {'CYS-GLH': ['appear', 0, 1], 'GLH-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-GLN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'HG2']],
          ['HG3', 'CD', 'OE1', 'NE2', 'HE21', 'HE22'],
          {'GLN-CYS': ['disappear', 1, 0], 'CYS-GLN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'CYS-GLU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'HG2']],
          ['HG3', 'CD', 'OE1', 'OE2'],
          {'CYS-GLU': ['appear', 0, 1], 'GLU-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-GLY': [
          ['N', 'H', 'CA', 'O', 'C'],
          [['HA', 'HA2'], ['CB', 'HA3']],
          ('HB2', 'HB3', 'SG', 'HG'),
          {'CYS-GLY': ['disappear', 0, 1], 'GLY-CYS': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'ND1']],
          ['CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1'],
          {'HID-CYS': ['disappear', 1, 0], 'CYS-HID': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'CYS-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'ND1']],
          ['CD2', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'CYS-HIE': ['appear', 0, 1], 'HIE-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'ND1']],
          ['CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'CYS-HIP': ['appear', 0, 1], 'HIP-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['SG', 'CG2'], ['HG', 'HG12']],
          ['HG13', 'CD1', 'HG21', 'HG22', 'HG23', 'HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'CYS-ILE': ['appear', 0, 1], 'ILE-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HG', 'HG'], ['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG']],
          ['CD1', 'CD2', 'HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'CYS-LEU': ['appear', 0, 1], 'LEU-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'HG2']],
          ['HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'CYS-LYN': ['appear', 0, 1], 'LYN-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'HG2']],
          ['HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-CYS': ['disappear', 1, 0], 'CYS-LYS': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'CYS-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'HG2']],
          ['HG3', 'SD', 'CE', 'HE1', 'HE2', 'HE3'],
          {'CYS-MET': ['appear', 0, 1], 'MET-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'CD1']],
          ['CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'PHE-CYS': ['disappear', 1, 0], 'CYS-PHE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'CYS-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'HG2'], ['H', 'CD']],
          ['HG3', 'HD2', 'HD3'],
          {'CYS-PRO': ['appear', 0, 1], 'PRO-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HG', 'HG'], ['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'OG']],
          [],
          {'CYS-SER': ['', 0, 1], 'SER-CYS': ['', 1, 0]},
      ],
      'CYS-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['SG', 'CG2'], ['HG', 'HG1']],
          ['HG21', 'HG22', 'HG23'],
          {'CYS-THR': ['appear', 0, 1], 'THR-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'CD1']],
          ['CD2', 'HD1', 'NE1', 'CE3', 'CE2', 'HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'CYS-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-CYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'CYS-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['SG', 'CG'], ['HG', 'CD1']],
          ['CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'TYR-CYS': ['disappear', 1, 0], 'CYS-TYR': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'CYS-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['SG', 'CG2'], ['HG', 'HG11']],
          ['HG12', 'HG13', 'HG21', 'HG22', 'HG23'],
          {'VAL-CYS': ['disappear', 1, 0], 'CYS-VAL': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-GLN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['OE1', 'OE1'], ['OE2', 'NE2'], ['HE2', 'HE21']],
          ['HE22'],
          {'GLN-GLH': ['disappear', 1, 0], 'GLH-GLN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-GLU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD', 'OE1', 'OE2'],
          [],
          ['HE2'],
          {'GLU-GLH': ['appear', 1, 0], 'GLH-GLU': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-GLY': [
          ['N', 'H', 'CA', 'C', 'O'],
          [['HA', 'HA2'], ['CB', 'HA3']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD', 'OE1', 'OE2', 'HE2'),
          {'GLH-GLY': ['disappear', 0, 1], 'GLY-GLH': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'GLH-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['OE2', 'HD2'], ['HE2', 'NE2']],
          ['HE1'],
          {'HID-GLH': ['disappear', 1, 0], 'GLH-HID': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HE2', 'HE2'], ['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'CE1'], ['OE1', 'HD2'], ['OE2', 'NE2']],
          ['HE1'],
          {'HIE-GLH': ['disappear', 1, 0], 'GLH-HIE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HE2', 'HE2'], ['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['OE2', 'HD2']],
          ['NE2', 'HE1'],
          {'GLH-HIP': ['appear', 0, 1], 'HIP-GLH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLH-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG12'], ['HG3', 'HG13'], ['CD', 'CD1'], ['OE1', 'HG21'],
           ['OE2', 'HG22'], ['HE2', 'HG23']],
          ['HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'ILE-GLH': ['disappear', 1, 0], 'GLH-ILE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'HG'], ['HG3', 'CD1'], ['CD', 'CD2'], ['OE1', 'HD11'], ['OE2', 'HD12'], ['HE2', 'HD13']],
          ['HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'LEU-GLH': ['disappear', 1, 0], 'GLH-LEU': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['HE2', 'HE2'], ['OE1', 'HD2'], ['OE2', 'HD3']],
          ['CE', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'GLH-LYN': ['appear', 0, 1], 'LYN-GLH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLH-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['HE2', 'HE2'], ['OE1', 'HD2'], ['OE2', 'HD3']],
          ['CE', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-GLH': ['disappear', 1, 0], 'GLH-LYS': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['HE2', 'HE2'], ['CD', 'SD'], ['OE1', 'CE'], ['OE2', 'HE1']],
          ['HE3'],
          {'GLH-MET': ['appear', 0, 1], 'MET-GLH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLH-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HE2', 'HE2'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['OE2', 'HD2']],
          ['CE2', 'HE1', 'CZ', 'HZ'],
          {'PHE-GLH': ['disappear', 1, 0], 'GLH-PHE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['CD', 'CD'], ['OE1', 'HD2'],
           ['OE2', 'HD3']],
          ['H', 'HE2'],
          {'GLH-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-GLH': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'GLH-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['HG2', 'HG']],
          ['HG3', 'CD', 'OE1', 'OE2', 'HE2'],
          {'SER-GLH': ['appear', 1, 0], 'GLH-SER': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG1'], ['HG3', 'HG21'], ['CD', 'HG22'],
           ['OE1', 'HG23']],
          ['OE2', 'HE2'],
          {'THR-GLH': ['appear', 1, 0], 'GLH-THR': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'NE1'], ['OE2', 'CE3'], ['HE2', 'CE2']],
          ['HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'GLH-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-GLH': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLH-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HE2', 'HE2'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['OE2', 'HD2']],
          ['CE2', 'HE1', 'CZ', 'OH', 'HH'],
          {'TYR-GLH': ['disappear', 1, 0], 'GLH-TYR': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLH-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG11'], ['HG3', 'HG12'], ['CD', 'HG13'],
           ['OE1', 'HG21'], ['OE2', 'HG22'], ['HE2', 'HG23']],
          [],
          {'VAL-GLH': ['', 1, 0], 'GLH-VAL': ['', 0, 1]},
      ],
      'GLN-GLU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['OE1', 'OE1'], ['NE2', 'OE2']],
          ['HE21', 'HE22'],
          {'GLU-GLN': ['appear', 1, 0], 'GLN-GLU': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'GLN-GLY': [
          ['N', 'H', 'CA', 'C', 'O'],
          [['HA', 'HA2'], ['CB', 'HA3']],
          ['HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD', 'OE1', 'NE2', 'HE21', 'HE22'],
          {'GLY-GLN': ['appear', 1, 0], 'GLN-GLY': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'GLN-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['NE2', 'NE2'], ['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['HE21', 'HD2'],
           ['HE22', 'HE1']],
          [],
          {'GLN-HID': ['', 0, 1], 'HID-GLN': ['', 1, 0]},
      ],
      'GLN-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['NE2', 'NE2'], ['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'CE1'], ['OE1', 'HD2'], ['HE21', 'HE1'],
           ['HE22', 'HE2']],
          [],
          {'GLN-HIE': ['', 0, 1], 'HIE-GLN': ['', 1, 0]},
      ],
      'GLN-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['NE2', 'NE2'], ['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['HE21', 'HD2'],
           ['HE22', 'HE1']],
          ['HE2'],
          {'HIP-GLN': ['disappear', 1, 0], 'GLN-HIP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLN-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG12'], ['HG3', 'HG13'], ['CD', 'CD1'], ['OE1', 'HG21'],
           ['NE2', 'HG22'], ['HE21', 'HG23'], ['HE22', 'HD11']],
          ['HD12', 'HD13'],
          {'GLN-ILE': ['appear', 0, 1], 'ILE-GLN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLN-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'HG'], ['HG3', 'CD1'], ['CD', 'CD2'], ['OE1', 'HD11'], ['NE2', 'HD12'], ['HE21', 'HD13'],
           ['HE22', 'HD21']],
          ['HD22', 'HD23'],
          {'GLN-LEU': ['appear', 0, 1], 'LEU-GLN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLN-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['OE1', 'HD2'], ['NE2', 'HD3'], ['HE21', 'CE'], ['HE22', 'HE2']],
          ['HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'LYN-GLN': ['disappear', 1, 0], 'GLN-LYN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLN-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['OE1', 'HD2'], ['NE2', 'HD3'], ['HE21', 'CE'], ['HE22', 'HE2']],
          ['HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'GLN-LYS': ['appear', 0, 1], 'LYS-GLN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLN-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['CD', 'SD'], ['OE1', 'CE'], ['NE2', 'HE1'], ['HE21', 'HE2'], ['HE22', 'HE3']],
          [],
          {'MET-GLN': ['', 1, 0], 'GLN-MET': ['', 0, 1]},
      ],
      'GLN-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['NE2', 'HD2'], ['HE21', 'CE2'],
           ['HE22', 'HE1']],
          ['CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'PHE-GLN': ['disappear', 1, 0], 'GLN-PHE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLN-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['CD', 'CD'], ['OE1', 'HD2'],
           ['NE2', 'HD3']],
          ['H', 'HE21', 'HE22'],
          {'GLN-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-GLN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'GLN-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['HG2', 'HG']],
          ['HG3', 'CD', 'OE1', 'NE2', 'HE21', 'HE22'],
          {'GLN-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-GLN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'GLN-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG1'], ['HG3', 'HG21'], ['CD', 'HG22'],
           ['OE1', 'HG23']],
          ['NE2', 'HE21', 'HE22'],
          {'THR-GLN': ['appear', 1, 0], 'GLN-THR': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'GLN-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'NE1'], ['NE2', 'CE3'], ['HE21', 'CE2'],
           ['HE22', 'HE1']],
          ['HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-GLN': ['disappear', 1, 0], 'GLN-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLN-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['NE2', 'HD2'], ['HE21', 'CE2'],
           ['HE22', 'HE1']],
          ['CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'GLN-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-GLN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLN-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG11'], ['HG3', 'HG12'], ['CD', 'HG13'],
           ['OE1', 'HG21'], ['NE2', 'HG22'], ['HE21', 'HG23']],
          ['HE22'],
          {'GLN-VAL': ['disappear', 0, 1], 'VAL-GLN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-GLY': [
          ['N', 'H', 'CA', 'O', 'C'],
          [['HA', 'HA2'], ['CB', 'HA3']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD', 'OE1', 'OE2'),
          {'GLU-GLY': ['disappear', 0, 1], 'GLY-GLU': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['OE2', 'HD2']],
          ['NE2', 'HE1'],
          {'GLU-HID': ['appear', 0, 1], 'HID-GLU': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'CE1'], ['OE1', 'HD2'], ['OE2', 'NE2']],
          ['HE1', 'HE2'],
          {'GLU-HIE': ['appear', 0, 1], 'HIE-GLU': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'ND1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['OE2', 'HD2']],
          ['NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'GLU-HIP': ['appear', 0, 1], 'HIP-GLU': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG12'], ['HG3', 'HG13'], ['CD', 'CD1'], ['OE1', 'HG21'],
           ['OE2', 'HG22']],
          ['HG23', 'HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'GLU-ILE': ['appear', 0, 1], 'ILE-GLU': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'HG'], ['HG3', 'CD1'], ['CD', 'CD2'], ['OE1', 'HD11'], ['OE2', 'HD12']],
          ['HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'GLU-LEU': ['appear', 0, 1], 'LEU-GLU': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['OE1', 'HD2'], ['OE2', 'HD3']],
          ['CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'LYN-GLU': ['disappear', 1, 0], 'GLU-LYN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLU-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD'],
          [['OE1', 'HD2'], ['OE2', 'HD3']],
          ['CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'GLU-LYS': ['appear', 0, 1], 'LYS-GLU': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['CD', 'SD'], ['OE1', 'CE'], ['OE2', 'HE1']],
          ['HE2', 'HE3'],
          {'MET-GLU': ['disappear', 1, 0], 'GLU-MET': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLU-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['OE2', 'HD2']],
          ['CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'PHE-GLU': ['disappear', 1, 0], 'GLU-PHE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLU-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['CD', 'CD'], ['OE1', 'HD2'],
           ['OE2', 'HD3']],
          ['H'],
          {'PRO-GLU': ['appear', 1, 0], 'GLU-PRO': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'GLU-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['HG2', 'HG']],
          ['HG3', 'CD', 'OE1', 'OE2'],
          {'GLU-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-GLU': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG1'], ['HG3', 'HG21'], ['CD', 'HG22'],
           ['OE1', 'HG23']],
          ['OE2'],
          {'THR-GLU': ['appear', 1, 0], 'GLU-THR': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'GLU-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'NE1'], ['OE2', 'CE3']],
          ['CE2', 'HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-GLU': ['disappear', 1, 0], 'GLU-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLU-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['OE1', 'CE1'], ['OE2', 'HD2']],
          ['CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'GLU-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-GLU': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLU-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG11'], ['HG3', 'HG12'], ['CD', 'HG13'],
           ['OE1', 'HG21'], ['OE2', 'HG22']],
          ['HG23'],
          {'GLU-VAL': ['appear', 0, 1], 'VAL-GLU': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLY-HID': [
          ['N', 'H', 'CA', 'C', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'ND1', 'HD1', 'CD2', 'HD2', 'CE1', 'HE1', 'NE2'),
          {'GLY-HID': ['appear', 0, 1], 'HID-GLY': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLY-HIE': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'ND1', 'CD2', 'HD2', 'CE1', 'HE1', 'NE2', 'HE2'),
          {'HIE-GLY': ['disappear', 1, 0], 'GLY-HIE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLY-HIP': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'ND1', 'HD1', 'CD2', 'HD2', 'CE1', 'HE1', 'NE2', 'HE2'),
          {'GLY-HIP': ['appear', 0, 1], 'HIP-GLY': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLY-ILE': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB', 'CG1', 'HG12', 'HG13', 'CG2', 'HG21', 'HG22', 'HG23', 'CD1', 'HD11', 'HD12', 'HD13'),
          {'ILE-GLY': ['disappear', 1, 0], 'GLY-ILE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLY-LEU': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'HG', 'CD1', 'HD11', 'HD12', 'HD13', 'CD2', 'HD21', 'HD22', 'HD23'),
          {'LEU-GLY': ['disappear', 1, 0], 'GLY-LEU': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLY-LYN': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'),
          {'GLY-LYN': ['appear', 0, 1], 'LYN-GLY': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLY-LYS': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'),
          {'LYS-GLY': ['disappear', 1, 0], 'GLY-LYS': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLY-MET': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'SD', 'CE', 'HE1', 'HE2', 'HE3'),
          {'GLY-MET': ['appear', 0, 1], 'MET-GLY': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLY-PHE': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'CD1', 'HD1', 'CD2', 'HD2', 'CE1', 'HE1', 'CE2', 'HE2', 'CZ', 'HZ'),
          {'GLY-PHE': ['appear', 0, 1], 'PHE-GLY': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLY-PRO': [
          ['C', 'N', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB'], ['H', 'CD']],
          ['HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'HD2', 'HD3'],
          {'GLY-PRO': ['appear', 0, 1], 'PRO-GLY': ['disappear', 1, 0]}
      ],
      'GLY-SER': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'OG', 'HG'),
          {'SER-GLY': ['disappear', 1, 0], 'GLY-SER': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLY-THR': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB', 'OG1', 'HG1', 'CG2', 'HG21', 'HG22', 'HG23'),
          {'GLY-THR': ['appear', 0, 1], 'THR-GLY': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLY-TRP': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'CD1', 'HD1', 'CD2', 'NE1', 'HE1', 'CE3', 'HE3', 'CE2', 'CZ3', 'HZ3', 'CZ2', 'HZ2', 'CH2',
           'HH2'),
          {'GLY-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-GLY': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'GLY-TYR': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB2', 'HB3', 'CG', 'CD1', 'HD1', 'CD2', 'HD2', 'CE1', 'HE1', 'CE2', 'HE2', 'CZ', 'OH', 'HH'),
          {'TYR-GLY': ['disappear', 1, 0], 'GLY-TYR': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'GLY-VAL': [
          ['C', 'N', 'H', 'CA', 'O'],
          [['HA2', 'HA'], ['HA3', 'CB']],
          ('HB', 'CG1', 'HG11', 'HG12', 'HG13', 'CG2', 'HG21', 'HG22', 'HG23'),
          {'VAL-GLY': ['disappear', 1, 0], 'GLY-VAL': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'HID-HIE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'ND1', 'CD2', 'HD2', 'CE1', 'HE1', 'NE2'],
          [['HD1', 'HE2']],
          [],
          {'HID-HIE': ['', 0, 1], 'HIE-HID': ['', 1, 0]},
      ],
      'HID-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'ND1', 'CD2', 'HD2', 'CE1', 'HE1', 'NE2', 'HD1'],
          [],
          ['HE2'],
          {'HID-HIP': ['appear', 1, 0], 'HIP-HID': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'HID-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['ND1', 'HG12'], ['CD2', 'HG13'], ['HD1', 'CD1'],
           ['CE1', 'HG21'], ['HD2', 'HG22'], ['NE2', 'HG23'], ['HE1', 'HD11']],
          ['HD12', 'HD13'],
          {'ILE-HID': ['disappear', 1, 0], 'HID-ILE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'HID-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CD2', 'CD2'], ['ND1', 'HG'], ['HD1', 'CD1'], ['CE1', 'HD11'], ['HD2', 'HD12'], ['NE2', 'HD13'],
           ['HE1', 'HD21']],
          ['HD22', 'HD23'],
          {'HID-LEU': ['appear', 0, 1], 'LEU-HID': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HID-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['HD1', 'CD'], ['CE1', 'HD3'], ['NE2', 'CE'], ['HE1', 'HE2']],
          ['HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'LYN-HID': ['disappear', 1, 0], 'HID-LYN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'HID-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['HD1', 'CD'], ['CE1', 'HD3'], ['NE2', 'CE'], ['HE1', 'HE2']],
          ['HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'HID-LYS': ['appear', 0, 1], 'LYS-HID': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HID-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HE1', 'HE1'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['HD1', 'SD'], ['CE1', 'CE'], ['HD2', 'HE2'], ['NE2', 'HE3']],
          [],
          {'HID-MET': ['', 0, 1], 'MET-HID': ['', 1, 0]},
      ],
      'HID-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['ND1', 'CD1'], ['HD1', 'HD1'], ['CD2', 'CD2'], ['HD2', 'HD2'], ['CE1', 'CE1'], ['HE1', 'HE1'],
           ['NE2', 'CE2']],
          ['HE2', 'CZ', 'HZ'],
          {'HID-PHE': ['appear', 0, 1], 'PHE-HID': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HID-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['CE1', 'CD'], ['HD2', 'HD2'],
           ['HE1', 'HD3']],
          ['H', 'HD1', 'NE2'],
          {'HID-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-HID': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HID-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['ND1', 'HG']],
          ['CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1'],
          {'HID-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-HID': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HID-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['ND1', 'HG1'], ['CD2', 'HG21'], ['HD1', 'HG22'],
           ['CE1', 'HG23']],
          ['HD2', 'NE2', 'HE1'],
          {'HID-THR': ['disappear', 0, 1], 'THR-HID': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HID-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['ND1', 'CD1'], ['HD1', 'HD1'], ['CD2', 'CD2'], ['CE1', 'NE1'], ['NE2', 'CE3'], ['HD2', 'CE2'],
           ['HE1', 'HE1']],
          ['CZ3', 'HZ3', 'CZ2', 'HZ2', 'CH2', 'HH2', 'HE3'],
          {'HID-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-HID': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HID-TYR': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'H', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['ND1', 'CD1'], ['HD1', 'HD1'], ['CD2', 'CD2'], ['HD2', 'HD2'], ['CE1', 'CE1'], ['HE1', 'HE1'],
           ['NE2', 'CE2']],
          ['HE2', 'CZ', 'OH', 'HH'],
          {'HID-TYR': ['appear', 0, 1], 'PHE-TYR': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HID-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['ND1', 'HG11'], ['CD2', 'HG12'], ['HD1', 'HG13'],
           ['CE1', 'HG21'], ['HD2', 'HG22'], ['NE2', 'HG23']],
          ['HE1'],
          {'HID-VAL': ['disappear', 0, 1], 'VAL-HID': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HIE-HIP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'CB', 'ND1', 'CD2', 'HD2', 'CE1', 'HE1', 'NE2', 'HE2'],
          [],
          ['HD1'],
          {'HIE-HIP': ['appear', 1, 0], 'HIP-HIE': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'HIE-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['ND1', 'HG12'], ['CD2', 'HG13'], ['CE1', 'CD1'],
           ['HD2', 'HG21'], ['NE2', 'HG22'], ['HE1', 'HG23'], ['HE2', 'HD11']],
          ['HD12', 'HD13'],
          {'HIE-ILE': ['appear', 0, 1], 'ILE-HIE': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIE-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CD2', 'CD2'], ['ND1', 'HG'], ['CE1', 'CD1'], ['HD2', 'HD11'], ['NE2', 'HD12'], ['HE1', 'HD13'],
           ['HE2', 'HD21']],
          ['HD22', 'HD23'],
          {'HIE-LEU': ['appear', 0, 1], 'LEU-HIE': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIE-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HE2', 'HE2'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['CE1', 'CD'], ['NE2', 'HD3'], ['HE1', 'CE']],
          ['HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'LYN-HIE': ['disappear', 1, 0], 'HIE-LYN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'HIE-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HE2', 'HE2'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['CE1', 'CD'], ['NE2', 'HD3'], ['HE1', 'CE']],
          ['HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'HIE-LYS': ['appear', 0, 1], 'LYS-HIE': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIE-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HE1', 'HE1'], ['HE2', 'HE2'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['CE1', 'SD'], ['HD2', 'CE'], ['NE2', 'HE3']],
          [],
          {'MET-HIE': ['', 1, 0], 'HIE-MET': ['', 0, 1]},
      ],
      'HIE-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['ND1', 'CD1'], ['HE2', 'HE2'], ['CD2', 'CD2'], ['HD2', 'HD2'], ['CE1', 'CE1'], ['HE1', 'HE1'],
           ['NE2', 'CE2']],
          ['HD1', 'CZ', 'HZ'],
          {'HIE-PHE': ['appear', 0, 1], 'PHE-HIE': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIE-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['CE1', 'CD'], ['HD2', 'HD2'],
           ['HE1', 'HD3']],
          ['H', 'NE2', 'HE2'],
          {'HIE-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-HIE': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HIE-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['ND1', 'HG']],
          ['CD2', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'HIE-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-HIE': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HIE-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['ND1', 'HG1'], ['CD2', 'HG21'], ['CE1', 'HG22'],
           ['HD2', 'HG23']],
          ['NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'THR-HIE': ['appear', 1, 0], 'HIE-THR': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'HIE-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['ND1', 'CD1'], ['CD2', 'CD2'], ['CE1', 'NE1'], ['NE2', 'CE3'], ['HE2', 'HE3'], ['HD2', 'CE2'],
           ['HE1', 'HE1']],
          ['CZ3', 'HZ3', 'HD1', 'CZ2', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'HIE-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-HIE': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIE-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['ND1', 'CD1'], ['HE2', 'HE2'], ['CD2', 'CD2'], ['HD2', 'HD2'], ['CE1', 'CE1'], ['HE1', 'HE1'],
           ['NE2', 'CE2']],
          ['HD1', 'CZ', 'OH', 'HH'],
          {'HIE-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-HIE': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIE-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['ND1', 'HG11'], ['CD2', 'HG12'], ['CE1', 'HG13'],
           ['HD2', 'HG21'], ['NE2', 'HG22'], ['HE1', 'HG23']],
          ['HE2'],
          {'VAL-HIE': ['appear', 1, 0], 'HIE-VAL': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'HIP-ILE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['ND1', 'HG12'], ['CD2', 'HG13'], ['HD1', 'CD1'],
           ['CE1', 'HG21'], ['HD2', 'HG22'], ['NE2', 'HG23'], ['HE1', 'HD11'], ['HE2', 'HD12']],
          ['HD13'],
          {'ILE-HIP': ['disappear', 1, 0], 'HIP-ILE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'HIP-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CD2', 'CD2'], ['ND1', 'HG'], ['HD1', 'CD1'], ['CE1', 'HD11'], ['HD2', 'HD12'], ['NE2', 'HD13'],
           ['HE1', 'HD21'], ['HE2', 'HD22']],
          ['HD23'],
          {'HIP-LEU': ['appear', 0, 1], 'LEU-HIP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIP-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HE2', 'HE2'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['HD1', 'CD'], ['CE1', 'HD3'], ['NE2', 'CE'],
           ['HE1', 'HE3']],
          ['NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'HIP-LYN': ['appear', 0, 1], 'LYN-HIP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIP-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HE2', 'HE2'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['HD1', 'CD'], ['CE1', 'HD3'], ['NE2', 'CE'],
           ['HE1', 'HE3']],
          ['NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-HIP': ['disappear', 1, 0], 'HIP-LYS': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'HIP-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HE1', 'HE1'], ['HE2', 'HE2'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['HD1', 'SD'], ['CE1', 'CE'], ['HD2', 'HE3']],
          ['NE2'],
          {'HIP-MET': ['disappear', 0, 1], 'MET-HIP': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HIP-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['ND1', 'CD1'], ['HD1', 'HD1'], ['CD2', 'CD2'], ['HD2', 'HD2'], ['CE1', 'CE1'], ['HE1', 'HE1'], ['HE2', 'HE2'],
           ['NE2', 'CE2']],
          ['CZ', 'HZ'],
          {'HIP-PHE': ['appear', 0, 1], 'PHE-HIP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIP-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['ND1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['CE1', 'CD'], ['HD2', 'HD2'],
           ['HE1', 'HD3']],
          ['H', 'NE2', 'HD1', 'HE2'],
          {'HIP-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-HIP': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HIP-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['ND1', 'HG']],
          ['CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'HIP-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-HIP': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HIP-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['ND1', 'HG1'], ['CD2', 'HG21'], ['HD1', 'HG22'],
           ['CE1', 'HG23']],
          ['HD2', 'NE2', 'HE1', 'HE2'],
          {'HIP-THR': ['disappear', 0, 1], 'THR-HIP': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'HIP-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['ND1', 'CD1'], ['HD1', 'HD1'], ['CD2', 'CD2'], ['CE1', 'NE1'], ['NE2', 'CE3'], ['HE2', 'HE3'], ['HD2', 'CE2'],
           ['HE1', 'HE1']],
          ['CZ3', 'HZ3', 'CZ2', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'HIP-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-HIP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIP-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['ND1', 'CD1'], ['HD1', 'HD1'], ['CD2', 'CD2'], ['HD2', 'HD2'], ['CE1', 'CE1'], ['HE1', 'HE1'], ['NE2', 'CE2'],
           ['HE2', 'HE2']],
          ['CZ', 'OH', 'HH'],
          {'HIP-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-HIP': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'HIP-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['ND1', 'HG11'], ['CD2', 'HG12'], ['HD1', 'HG13'],
           ['CE1', 'HG21'], ['HD2', 'HG22'], ['NE2', 'HG23']],
          ['HE1', 'HE2'],
          {'VAL-HIP': ['appear', 1, 0], 'HIP-VAL': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ILE-LEU': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['CG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['CD1', 'CD1'], ['HG13', 'CD2'], ['HG12', 'HG'],
           ['HG21', 'HD21'], ['HG22', 'HD22'], ['HD11', 'HD11'], ['HD12', 'HD12'], ['HD13', 'HD13'], ['HG23', 'HD23']],
          [],
          {'LEU-ILE': ['', 1, 0], 'ILE-LEU': ['', 0, 1]},
      ],
      'ILE-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['CG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['HG12', 'HG2'], ['HG13', 'HG3'], ['CD1', 'CD'], ['HG21', 'HD2'],
           ['HG22', 'HD3'], ['HG23', 'CE'], ['HD11', 'HE2'], ['HD12', 'HE3'], ['HD13', 'NZ']],
          ['HZ1', 'HZ2'],
          {'ILE-LYN': ['appear', 0, 1], 'LYN-ILE': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'ILE-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['CG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['HG12', 'HG2'], ['HG13', 'HG3'], ['CD1', 'CD'], ['HG21', 'HD2'],
           ['HG22', 'HD3'], ['HG23', 'CE'], ['HD11', 'HE2'], ['HD12', 'HE3'], ['HD13', 'NZ']],
          ['HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-ILE': ['disappear', 1, 0], 'ILE-LYS': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ILE-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['CG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['HG12', 'HG2'], ['HG13', 'HG3'], ['CD1', 'SD'], ['HG21', 'CE'],
           ['HG22', 'HE1'], ['HG23', 'HE2'], ['HD11', 'HE3']],
          ['HD12', 'HD13'],
          {'ILE-MET': ['disappear', 0, 1], 'MET-ILE': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ILE-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['CG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['CD1', 'CD1'], ['HG12', 'CD2'], ['HG23', 'CE2'],
           ['HG13', 'HD1'], ['HG21', 'CE1'], ['HG22', 'HD2'], ['HD11', 'HE1'], ['HD12', 'CZ'], ['HD13', 'HE2']],
          ['HZ'],
          {'PHE-ILE': ['disappear', 1, 0], 'ILE-PHE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ILE-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['CG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['HG12', 'HG2'], ['HG13', 'HG3'], ['CD1', 'CD'], ['HG21', 'HD2'],
           ['HG22', 'HD3']],
          ['H', 'HG23', 'HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'ILE-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-ILE': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'ILE-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['CG1', 'HB3'], ['CG2', 'OG'], ['HG12', 'HG']],
          ['HG13', 'CD1', 'HG21', 'HG22', 'HG23', 'HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'SER-ILE': ['appear', 1, 0], 'ILE-SER': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ILE-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HG21', 'HG21'], ['HB', 'HB'], ['HG23', 'HG23'], ['CG2', 'CG2'], ['HG22', 'HG22'], ['CG1', 'OG1'],
           ['HG12', 'HG1']],
          ['HG13', 'CD1', 'HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'THR-ILE': ['appear', 1, 0], 'ILE-THR': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'ILE-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['CD1', 'CD1'], ['HB', 'HB2'], ['CG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['HG12', 'CD2'], ['HG13', 'HD1'],
           ['HG21', 'NE1'], ['HG22', 'CE3'], ['HG23', 'CE2'], ['HD11', 'HE1'], ['HD12', 'HE3'], ['HD13', 'CZ3']],
          ['CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-ILE': ['disappear', 1, 0], 'ILE-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ILE-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['CG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['CD1', 'CD1'], ['HG12', 'CD2'], ['HG13', 'HD1'],
           ['HG21', 'CE1'], ['HG22', 'HD2'], ['HG23', 'CE2'], ['HD11', 'HE1'], ['HD12', 'CZ'], ['HD13', 'HE2']],
          ['OH', 'HH'],
          {'TYR-ILE': ['disappear', 1, 0], 'ILE-TYR': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'ILE-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['CG2', 'CG2'], ['HB', 'HB'], ['CG1', 'CG1'], ['HG12', 'HG12'], ['HG13', 'HG13'], ['HG21', 'HG21'],
           ['HG23', 'HG23'], ['HG22', 'HG22'], ['CD1', 'HG11']],
          ['HD11', 'HD12', 'HD13'],
          {'VAL-ILE': ['appear', 1, 0], 'ILE-VAL': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'LEU-LYN': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG', 'HG2'], ['CD1', 'HG3'], ['CD2', 'CD'], ['HD11', 'HD2'], ['HD12', 'HD3'], ['HD13', 'CE'],
           ['HD21', 'HE2'], ['HD22', 'HE3'], ['HD23', 'NZ']],
          ['HZ1', 'HZ2'],
          {'LYN-LEU': ['disappear', 1, 0], 'LEU-LYN': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'LEU-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG', 'HG2'], ['CD1', 'HG3'], ['CD2', 'CD'], ['HD11', 'HD2'], ['HD12', 'HD3'], ['HD13', 'CE'],
           ['HD21', 'HE2'], ['HD22', 'HE3'], ['HD23', 'NZ']],
          ['HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LEU-LYS': ['appear', 0, 1], 'LYS-LEU': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'LEU-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG', 'HG2'], ['CD1', 'HG3'], ['CD2', 'SD'], ['HD11', 'CE'], ['HD12', 'HE1'], ['HD13', 'HE2'],
           ['HD21', 'HE3']],
          ['HD22', 'HD23'],
          {'MET-LEU': ['appear', 1, 0], 'LEU-MET': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'LEU-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CD1', 'CD1'], ['CD2', 'CD2'], ['HG', 'HD1'], ['HD11', 'CE1'], ['HD12', 'HD2'], ['HD13', 'CE2'],
           ['HD21', 'HE1'], ['HD22', 'CZ'], ['HD23', 'HE2']],
          ['HZ'],
          {'PHE-LEU': ['disappear', 1, 0], 'LEU-PHE': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'LEU-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG', 'HG2'], ['CD1', 'HG3'], ['HD11', 'HD2'], ['HD12', 'HD3'],
           ['HD13', 'CD']],
          ['H', 'CD2', 'HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'PRO-LEU': ['appear', 1, 0], 'LEU-PRO': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'LEU-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['HG', 'HG']],
          ['CD1', 'CD2', 'HD11', 'HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'LEU-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-LEU': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'LEU-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG', 'HG1'], ['CD1', 'HG21'], ['CD2', 'HG22'],
           ['HD11', 'HG23']],
          ['HD12', 'HD13', 'HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'THR-LEU': ['appear', 1, 0], 'LEU-THR': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'LEU-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CD1', 'CD1'], ['CD2', 'CD2'], ['HG', 'HD1'], ['HD11', 'NE1'], ['HD12', 'CE3'], ['HD13', 'CE2'],
           ['HD21', 'HE1'], ['HD22', 'HE3'], ['HD23', 'CZ3']],
          ['CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-LEU': ['disappear', 1, 0], 'LEU-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'LEU-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CD1', 'CD1'], ['CD2', 'CD2'], ['HG', 'HD1'], ['HD11', 'CE1'], ['HD12', 'HD2'], ['HD13', 'CE2'],
           ['HD21', 'HE1'], ['HD22', 'CZ'], ['HD23', 'HE2']],
          ['OH', 'HH'],
          {'TYR-LEU': ['disappear', 1, 0], 'LEU-TYR': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'LEU-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG', 'HG11'], ['CD1', 'HG12'], ['CD2', 'HG13'],
           ['HD11', 'HG21'], ['HD12', 'HG22'], ['HD13', 'HG23']],
          ['HD21', 'HD22', 'HD23'],
          {'VAL-LEU': ['appear', 1, 0], 'LEU-VAL': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'LYN-LYS': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'HG2', 'HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3',
           'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          [],
          ['HZ3'],
          {'LYN-LYS': ['appear', 0, 1], 'LYS-LYN': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'LYN-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CE', 'CE'], ['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['HE2', 'HE2'], ['HE3', 'HE3'], ['CD', 'SD'], ['HD2', 'HE1']],
          ['HD3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'LYN-MET': ['disappear', 0, 1], 'MET-LYN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'LYN-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HE2', 'HE2'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD3', 'CE1'], ['CE', 'CE2'],
           ['HE3', 'HE1'], ['NZ', 'CZ'], ['HZ1', 'HZ']],
          ['HZ2'],
          {'LYN-PHE': ['disappear', 0, 1], 'PHE-LYN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'LYN-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['CD', 'CD'], ['HD3', 'HD3'],
           ['HD2', 'HD2']],
          ['H', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'PRO-LYN': ['appear', 1, 0], 'LYN-PRO': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'LYN-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['HG2', 'HG']],
          ['HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'SER-LYN': ['appear', 1, 0], 'LYN-SER': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'LYN-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG1'], ['HG3', 'HG21'], ['CD', 'HG22'],
           ['HD2', 'HG23']],
          ['HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'LYN-THR': ['disappear', 0, 1], 'THR-LYN': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'LYN-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HZ2', 'HZ2'], ['HE3', 'HE3'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD2', 'NE1'], ['HD3', 'CE3'],
           ['CE', 'CE2'], ['HE2', 'HE1'], ['NZ', 'CZ3'], ['HZ1', 'CZ2']],
          ['HZ3', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-LYN': ['disappear', 1, 0], 'LYN-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'LYN-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HE2', 'HE2'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD3', 'CE1'], ['CE', 'CE2'],
           ['HE3', 'HE1'], ['NZ', 'CZ'], ['HZ1', 'OH'], ['HZ2', 'HH']],
          [],
          {'TYR-LYN': ['', 1, 0], 'LYN-TYR': ['', 0, 1]},
      ],
      'LYN-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG11'], ['HG3', 'HG12'], ['CD', 'HG13'],
           ['HD2', 'HG21'], ['HD3', 'HG22'], ['CE', 'HG23']],
          ['HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2'],
          {'VAL-LYN': ['appear', 1, 0], 'LYN-VAL': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'LYS-MET': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CD', 'SD'], ['CE', 'CE'], ['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['HE2', 'HE2'], ['HE3', 'HE3'], ['HD2', 'HE1']],
          ['HD3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'MET-LYS': ['appear', 1, 0], 'LYS-MET': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'LYS-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HE2', 'HE2'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD3', 'CE1'], ['CE', 'CE2'],
           ['HE3', 'HE1'], ['NZ', 'CZ'], ['HZ1', 'HZ']],
          ['HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-PHE': ['disappear', 0, 1], 'PHE-LYS': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'LYS-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['CD', 'CD'], ['HD3', 'HD3'],
           ['HD2', 'HD2']],
          ['H', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-LYS': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'LYS-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['HG2', 'HG']],
          ['HG3', 'CD', 'HD2', 'HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-LYS': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'LYS-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG1'], ['HG3', 'HG21'], ['CD', 'HG22'],
           ['HD2', 'HG23']],
          ['HD3', 'CE', 'HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-THR': ['disappear', 0, 1], 'THR-LYS': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'LYS-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HZ2', 'HZ2'], ['HZ3', 'HZ3'], ['HE3', 'HE3'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD2', 'NE1'],
           ['HD3', 'CE3'], ['CE', 'CE2'], ['HE2', 'HE1'], ['NZ', 'CZ3'], ['HZ1', 'CZ2']],
          ['CH2', 'HH2'],
          {'LYS-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-LYS': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'LYS-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HD2', 'HD2'], ['HE2', 'HE2'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'HD1'], ['HD3', 'CE1'], ['CE', 'CE2'],
           ['HE3', 'HE1'], ['NZ', 'CZ'], ['HZ1', 'OH'], ['HZ2', 'HH']],
          ['HZ3'],
          {'LYS-TYR': ['disappear', 0, 1], 'TYR-LYS': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'LYS-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG11'], ['HG3', 'HG12'], ['CD', 'HG13'],
           ['HD2', 'HG21'], ['HD3', 'HG22'], ['CE', 'HG23']],
          ['HE2', 'HE3', 'NZ', 'HZ1', 'HZ2', 'HZ3'],
          {'LYS-VAL': ['disappear', 0, 1], 'VAL-LYS': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'MET-PHE': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['SD', 'HD1'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CE', 'CE1'], ['HE1', 'HE1'], ['HE2', 'HE2'], ['HE3', 'HD2']],
          ['CE2', 'CZ', 'HZ'],
          {'MET-PHE': ['appear', 0, 1], 'PHE-MET': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'MET-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG2', 'HG2'], ['HG3', 'HG3'], ['SD', 'CD'], ['CE', 'HD3'],
           ['HE1', 'HD2']],
          ['H', 'HE2', 'HE3'],
          {'MET-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-MET': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'MET-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['HG2', 'HG']],
          ['HG3', 'SD', 'CE', 'HE1', 'HE2', 'HE3'],
          {'SER-MET': ['appear', 1, 0], 'MET-SER': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'MET-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG1'], ['HG3', 'HG21'], ['SD', 'HG22'], ['CE', 'HG23']],
          ['HE1', 'HE2', 'HE3'],
          {'MET-THR': ['disappear', 0, 1], 'THR-MET': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'MET-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['SD', 'HD1'], ['CE', 'NE1'], ['HE2', 'CE3'], ['HE1', 'HE1'], ['HE3', 'HE3']],
          ['CE2', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'MET-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-MET': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'MET-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['SD', 'HD1'], ['CE', 'CE1'], ['HE3', 'HD2'], ['HE1', 'HE1'], ['HE2', 'CE2']],
          ['HE2', 'CZ', 'OH', 'HH'],
          {'TYR-MET': ['disappear', 1, 0], 'MET-TYR': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'MET-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'CG1'], ['HB3', 'CG2'], ['CG', 'HB'], ['HG2', 'HG11'], ['HG3', 'HG12'], ['SD', 'HG13'], ['CE', 'HG21'],
           ['HE1', 'HG22'], ['HE2', 'HG23']],
          ['HE3'],
          {'VAL-MET': ['appear', 1, 0], 'MET-VAL': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'PHE-PRO': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['CD1', 'HG2'], ['CD2', 'HG3'], ['CE1', 'CD'], ['HD2', 'HD2'],
           ['HD1', 'HD3']],
          ['H', 'HE1', 'CE2', 'HE2', 'CZ', 'HZ'],
          {'PHE-PRO': ['disappear', 0, 1], 'PRO-PHE': ['appear', 1, 0]}
      ],
      'PHE-SER': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['CG', 'OG'], ['CD1', 'HG']],
          ['CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'PHE-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-PHE': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'PHE-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['CD1', 'HG1'], ['CD2', 'HG21'], ['HD1', 'HG22'],
           ['CE1', 'HG23']],
          ['HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'THR-PHE': ['appear', 1, 0], 'PHE-THR': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'PHE-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CD1', 'CD1'], ['HD1', 'HD1'], ['CD2', 'CD2'], ['HD2', 'NE1'], ['CE1', 'CE3'], ['HE1', 'HE3'], ['CE2', 'CE2'],
           ['HE2', 'HE1'], ['CZ', 'CZ3'], ['HZ', 'HZ3']],
          ['CZ2', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'PHE-TRP': ['appear', 0, 1], 'TRP-PHE': ['disappear', 1, 0]}
      ],
      'PHE-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG', 'CD1', 'HD1', 'CD2', 'HD2', 'CE1', 'HE1', 'CE2',
           'HE2', 'CZ'],
          [['HZ', 'OH']],
          ['HH'],
          {'PHE-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-PHE': ['disappear', 1, 0]}
      ],
      'PHE-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['CD1', 'HG11'], ['CD2', 'HG12'], ['HD1', 'HG13'],
           ['CE1', 'HG21'], ['HD2', 'HG22'], ['CE2', 'HG23']],
          ['HE1', 'CZ', 'HE2', 'HZ'],
          {'PHE-VAL': ['disappear', 0, 1], 'VAL-PHE': ['appear', 1, 0]},
      ],
      'PRO-SER': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'OG'], ['HG2', 'HG'], ['CD', 'H']],
          ['HG3', 'HD2', 'HD3'],
          {'PRO-SER': ['disappear', 0, 1], 'SER-PRO': ['appear', 1, 0]}
      ],
      'PRO-THR': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['CG', 'CG2'], ['HG2', 'HG1'], ['HG3', 'HG21'], ['CD', 'H'], ['HD2', 'HG22'],
           ['HD3', 'HG23']],
          [],
          {'PRO-THR': ['', 0, 1], 'THR-PRO': ['', 1, 0]}
      ],
      'PRO-TRP': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'H'], ['HD2', 'HD1'],
           ['HD3', 'NE1']],
          ['CE3', 'CE2', 'HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'PRO-TRP': ['appear', 0, 1], 'THR-PRO': ['disappear', 1, 0]}
      ],
      'PRO-TYR': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB2'], ['HB3', 'HB3'], ['CG', 'CG'], ['HG2', 'CD1'], ['HG3', 'CD2'], ['CD', 'H'], ['HD2', 'HD1'],
           ['HD3', 'HD2']],
          ['CE1', 'HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'PRO-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-PRO': ['disappear', 1, 0]}
      ],
      'PRO-VAL': [
          ['N', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['CG', 'CG1'], ['HB3', 'CG2'], ['HG2', 'HG11'], ['HG3', 'HG12'], ['CD', 'H'], ['HD2', 'HG13'],
           ['HD3', 'HG21']],
          ['HG22', 'HG23'],
          {'PRO-VAL': ['appear', 0, 1], 'VAL-PRO': ['disappear', 1, 0]}
      ],
      'SER-THR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'OG1'], ['OG', 'CG2'], ['HG', 'HG1']],
          ['HG21', 'HG22', 'HG23'],
          {'THR-SER': ['disappear', 1, 0], 'SER-THR': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'SER-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['OG', 'CG'], ['HG', 'CD1']],
          ['CD2', 'HD1', 'NE1', 'CE3', 'CE2', 'HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-SER': ['disappear', 1, 0], 'SER-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'SER-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB3', 'HB3'], ['HB2', 'HB2'], ['OG', 'CG'], ['HG', 'CD1']],
          ['CD2', 'HD1', 'CE1', 'HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'SER-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-SER': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'SER-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['OG', 'CG2'], ['HG', 'HG11']],
          ['HG12', 'HG13', 'HG21', 'HG22', 'HG23'],
          {'SER-VAL': ['appear', 0, 1], 'VAL-SER': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'THR-TRP': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['OG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['HG1', 'CD1'], ['HG21', 'CD2'], ['HG22', 'HD1'],
           ['HG23', 'NE1']],
          ['CE3', 'CE2', 'HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-THR': ['disappear', 1, 0], 'THR-TRP': ['appear', 0, 1]},
      ],
      'THR-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB', 'HB2'], ['OG1', 'HB3'], ['CG2', 'CG'], ['HG1', 'CD1'], ['HG21', 'CD2'], ['HG22', 'HD1'],
           ['HG23', 'CE1']],
          ['HD2', 'CE2', 'HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'THR-TYR': ['appear', 0, 1], 'TYR-THR': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'THR-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HG21', 'HG21'], ['HB', 'HB'], ['HG23', 'HG23'], ['CG2', 'CG2'], ['HG22', 'HG22'], ['OG1', 'CG1'],
           ['HG1', 'HG11']],
          ['HG12', 'HG13'],
          {'THR-VAL': ['appear', 0, 1], 'VAL-THR': ['disappear', 1, 0]},
      ],
      'TRP-TYR': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB', 'HB2', 'HB3', 'CG'],
          [['CD1', 'CD1'], ['HD1', 'HD1'], ['CD2', 'CD2'], ['NE1', 'HD2'], ['CE3', 'CE1'], ['HE1', 'HE1'], ['CE2', 'CE2'],
           ['HE3', 'HE2'], ['CZ3', 'CZ'], ['HZ3', 'OH'], ['CZ2', 'HH']],
          ['HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'TRP-TYR': ['disappear', 0, 1], 'TYR-TRP': ['appear', 1, 0]}
      ],
      'TRP-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['CD1', 'HG11'], ['CD2', 'HG12'], ['HD1', 'HG13'],
           ['NE1', 'HG21'], ['CE3', 'HG22'], ['CE2', 'HG23']],
          ['HE1', 'HE3', 'CZ3', 'CZ2', 'HZ3', 'HZ2', 'CH2', 'HH2'],
          {'VAL-TRP': ['appear', 1, 0], 'TRP-VAL': ['disappear', 0, 1]},
      ],
      'TYR-VAL': [
          ['N', 'H', 'CA', 'HA', 'C', 'O', 'CB'],
          [['HB2', 'HB'], ['HB3', 'CG1'], ['CG', 'CG2'], ['CD1', 'HG11'], ['CD2', 'HG12'], ['HD1', 'HG13'],
           ['CE1', 'HG21'], ['HD2', 'HG22'], ['CE2', 'HG23']],
          ['HE1', 'CZ', 'HE2', 'OH', 'HH'],
          {'TYR-VAL': ['disappear', 0, 1], 'VAL-TYR': ['appear', 1, 0]},
      ],
  }
  
  input_keywords = {
      "all": ["ARG", "HIE", "HID", "HIP", "LYS", "ASP", "GLU", "SER", "THR",
              "ASN", "GLN", "CYS", "GLY", "PRO", "ALA", "VAL", "ILE", "LEU",
              "MET", "PHE", "TYR", "TRP"],
      "all_protonated": ["ARG", "HIE", "HID", "HIP", "LYS", "LYN", "ASP", "ASH", "GLU", "GLH",
                         "SER", "THR", "ASN", "GLN", "CYS", "CYT", "GLY", "PRO", "ALA", "VAL",
                         "ILE", "LEU", "MET", "PHE", "TYR", "TRP"],
      "positive": ["ARG", "HIE", "HID", "HIP", "LYS"],
      "positive_protonated": ["ARG", "HIE", "HID", "HIP", "LYS", "LYN"],
      "negative": ["ASP", "GLU"],
      "negative_protonated": ["ASP", "ASH", "GLU", "GLH"],
      "polar": ["SER", "THR", "ASN", "GLN"],
      "special": ["CYS", "CYT", "GLY", "PRO"],
      "hydrophobic": ["ALA", "VAL", "ILE", "LEU", "MET", "PHE", "TYR", "TRP"]
  }
  