Sistema de clasificación APG II
# Sistema de clasificación APG II

    Para el sistema de clasificación más actualizado ver Sistema de clasificación APG III
El Sistema de clasificación APG II es un sistema para la clasificación de angiospermas según criterios filogenéticos, publicado en 2003 por un vasto grupo de investigadores que se autodenominó en conjunto «APG II» (del inglés Angiosperm Phylogeny Group, Grupo para la Filogenia de las Angiospermas). Es sucesor del Sistema de clasificación APG de 1998, y fue sucedido por el Sistema de clasificación APG III de 2009.
Este sistema de clasificación de plantas es marcadamente diferente de los anteriores tradicionales, basados en criterios morfológicos. El sistema está en pleno desarrollo y evolución, siendo revisado constantemente, pues muchos nodos de la filogenia son de conocimiento muy reciente (por ejemplo, que Amborella es la angiosperma basal) y otros no tienen un posicionamiento cladístico concreto.
Este sistema solo abarca categorías taxonómicas desde las especies hasta los órdenes, y no categoriza los taxones por encima del orden. Siguiendo esta línea, a los grupos de categoría superior a orden se los llama con nombres «informales» (no sujetos al Código Internacional de Nomenclatura Botánica), por lo que es más apropiado llamarlos «clados» en lugar de «taxones».

# Sistema de clasificación APG II
## Reseña

El sistema APG II es la siguiente versión del Sistema APG de 1998, actualización motivada por los avances obtenidos en 5 años en el conocimiento sobre la filogenia de las angiospermas. Esto generó varios cambios en la circunscripción familiar y en la clasificación, así como la adición de unos pocos órdenes nuevos.
En general, el APG II adoptó un acercamiento conservador y fueron propuestos cambios en el Sistema APG solamente cuando hubo nueva evidencia sustancial que apoyara una revisión de aquella clasificación. Así:
* Se reconocieron cinco órdenes adicionales: Austrobaileyales, Canellales, Celastrales, Crossosomatales y Gunnerales. Estos representan grupos monofiléticos bien sustentados de familias no clasificadas en órdenes en APG.
* La circunscripción de los órdenes del APG solo se cambió para adicionar un número de familias no clasificadas en un orden del APG, o se incrementó para incluir grupos hermanos (cuando los análisis lo demostraron posible frente a familias previamente no posicionadas, que bien podían ser anidadas en un orden del APG, o bien sustentadas como grupos hermanos de un orden del APG).
* Ningún orden del APG fue fusionado o fraccionado, y ninguna familia fue transferida de un orden a otro. Excepto Oncothecaceae, movida desde Garryales hasta euastéridas I sin orden asignado.
* Si bien APG II muestra un mejor conocimiento de las interrelaciones entre los órdenes y algunas de las familias no clasificadas, todavía son inciertas las relaciones entre los órdenes mayores de monocotiledóneas y eudicotiledóneas nucleares, y parte de los órdenes de rósidas y astéridas.
* En la categoría de familia, algunas fueron «sinonimializadas» o recircunscriptas (especialmente familias de Asparagales, Malpighiales y Lamiales) para preservar la monofilia y evitar redundacias taxonómicas y solo cuando fue necesario. Pocas familias fueron restablecidas desde la sinonimia para convertirlas en monofiléticas cuando fue posible, según los conocimientos disponibles sobre las relaciones entre géneros. En algunos casos, se listan las familias entre corchetes, indicando la posibilidad de alternar las circunscripciones.
Con los cambios introducidos con el APG II, el número de órdenes se ha incrementado de 40 a 45, y el número de familias se ha reducido de 462 a 457. De las 457 familias, 55 están listadas entre corchetes.
Entre 1998 y 2003, se han publicado 5 sistemas para las angiospermas:
* Sistemas de Judd y colaboradores (1999 y 2002) y de Stevens (2001) que siguen más o menos el sistema presentado en APG.
* Sistema de Thorne (2001) que se aproxima al del APG.
* Sistemas de Doweld (2001) y de Wu y colaboradores (2002) que básicamente siguen aquel propuesto por Takhtajan (1997).
Posteriormente a 2003, Stevens en el Angiosperm Phylogeny Website continuó actualizando su sistema de clasificación a medida que aparecían nuevas publicaciones, por lo que se considera más actualizado que el APG II, pero más inestable (véase APW).

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## Árbol filogenético

A pesar de ciertas «irregularidades» en la clasificación, el sistema representa un amplio consenso de los más respetables botánicos sistemáticos de la comunidad científica. El árbol filogenético aún no está terminado y hay cambios prácticamente con cada publicación científica, muchos de los nodos de esta clasificación ya han cambiado. La publicación completa en formato .pdf se enlaza en las referencias. Una clasificación actualizada se puede ver en Angiosperm Phylogeny Website.
Los nodos basales son los mejor consensuados hasta la fecha, a saber:
* Angiospermas: árbol filogenético consensuado. Todos los grupos explicitados en el gráfico son monofiléticos, aunque aún falta dilucidar las relaciones entre algunos de ellos. Dibujado y traducido al castellano a partir de APG II 2003, dejando como incógnitas las relaciones que aún no están consensuadas en 2006.
Un árbol consensuado y más actualizado hasta la categoría de orden, se puede ver en este enlace del APW.

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## Filogenia y clados

Principales clados en el sistema (sin categoría taxonómica ni nombre científico):
* angiospermas :
    magnólidas
    monocotiledóneas
       commelínidas
    eudicotiledóneas
       eudicotiledóneas nucleares
          rósidas
             eurrósidas I
             eurrósidas II
          astéridas
             euastéridas I
             euastéridas II

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## Filogenia y clados
### Cladograma APG II

* cladograma que muestra las interrelaciones de los órdenes y de algunas familias sustentadas por porcentajes jackknife o bootstrap superiores al 50% en:
* un análisis a gran escala de las secuencias de: 18S ADNr, rbcL y atpB desde una gran muestra de angiospermas.
* un análisis de varios genes de angiospermas filogenéticamente basales.
* un análisis de secuencias de rbcL con una amplia muestra de eudicotiledóneas.
Con más detalle (pero excluyendo una docena de géneros sin ubicación), comenzando cada listado con algunas familias u órdenes no ubicados en determinados clados:
* clado angiospermas
          familia Amborellaceae
          familia Chloranthaceae
          familia Nymphaeaceae [+ familia Cabombaceae]
       orden Austrobaileyales
    clado magnólidas
          orden Canellales
          orden Laurales
          orden Magnoliales
          orden Piperales
    clado monocotiledóneas
             familia Petrosaviaceae
          orden Acorales
          orden Alismatales
          orden Asparagales
          orden Dioscoreales
          orden Liliales
          orden Pandanales
       clado commelínidas
                familia Dasypogonaceae
             orden Arecales
             orden Commelinales
             orden Poales
             orden Zingiberales
    orden Ceratophyllales
    clado eudicotiledóneas
             familia Buxaceae [+ familia Didymelaceae]
             familia Sabiaceae
             familia Trochodendraceae [+ familia Tetracentraceae]
          orden Proteales
          orden Ranunculales
       clado eudicotiledóneas nucleares
                familia Aextoxicaceae
                familia Berberidopsidaceae
                familia Dilleniaceae
             orden Gunnerales
             orden Caryophyllales
             orden Santalales
             orden Saxifragales
          clado rósidas
                   familia Aphloiaceae
                   familia Geissolomataceae
                   familia Ixerbaceae
                   familia Picramniaceae
                   familia Strasburgeriaceae
                   familia Vitaceae
                orden Crossosomatales
                orden Geraniales
                orden Myrtales
             clado eurrósidas I
                      familia Zygophyllaceae [+ familia Krameriaceae]
                      familia Huaceae
                   orden Celastrales
                   orden Cucurbitales
                   orden Fabales
                   orden Fagales
                   orden Malpighiales
                   orden Oxalidales
                   orden Rosales
             clado eurrósidas II
                      familia Tapisciaceae
                   orden Brassicales
                   orden Malvales
                   orden Sapindales
          clado astéridas
                orden Cornales
                orden Ericales
             clado euastéridas I
                      familia Boraginaceae
                      familia Icacinaceae
                      familia Oncothecaceae
                      familia Vahliaceae
                   orden Garryales
                   orden Gentianales
                   orden Lamiales
                   orden Solanales
             clado euastéridas II
                      familia Bruniaceae
                      familia Columelliaceae [+ familia Desfontainiaceae]
                      familia Eremosynaceae
                      familia Escalloniaceae
                      familia Paracryphiaceae
                      familia Polyosmaceae
                      familia Sphenostemonaceae
                      familia Tribelaceae
                   orden Apiales
                   orden Aquifoliales
                   orden Asterales
                   orden Dipsacales
Nota: "+ ..." = Familia segregante opcional, que puede separase de la familia precedente.