Aquí tienes una función en JavaScript que cumple con tus requisitos:
function generateArray(n) {
  const result = [];
  for (let i = 0; i <= n; i++) {
    result.push(i);
  }
  result.push(-1);
  return result;
}

// Ejemplo de uso:
const n = 5;
const array = generateArray(n);
console.log(array);

Esta función crea una matriz vacía, la llena con números del 0 al n (incluido) y luego agrega el número extra -1 al final. Puedes usar la función con cualquier valor de n que desees para generar la matriz correspondiente.
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