لم يكن تأثير مرض هوكينج على حركته فقط، إنما سبب له أيضًا صعوبة في التنفس، وهذا ما ألزمه بإجراء عملية جراحية لتركيب أنبوب تنفس في القصبة الهوائية. كان لتلك العملية تأثير على صوت هوكينج، وأصبح يتواصل مع الآخرين عبر الإشارة إلى كل كلمة حرفًا بحرف. استخدم هوكينج فيما بعد برنامج إكواليزر لاختيار الكلمات التي يريد نطقها من قائمة كلمات يتحكم فيها بيده، ويقوم الحاسوب بنطقها نيابة عنه.