أما العلمانية، فهي تحضر لدى الحافظ بمثابتها منظومة متكاملة، تستدعي جميع حيّزات التجربة التاريخية: معرفيًا، واجتماعيًا، وسياسيًا. فهي على المستوى المعرفي معادل للعقلانية، فهي " تؤمن بالاكتشاف التدريجي للحقيقة، سواء في الطبيعة أم بالمجتمع، بواسطة العقل وحده تحت رقابة التجربة.. وبدون هذه العقلانية ما كان للعلوم أن تتقدم هذا التقدم المذهل، وبالتالي لا يمكن للعلم أن يتقدم في مجتمع يرفض هذه العقلانية… فالعلمنة إذن إحدى التظاهرات الفرعية لعملية عقلنة المجتمع ". وهنا نلاحظ أنّ التلازم الذي طرحه بين الدولة الحديثة والعلمانية، لم يتوقف عند حدود السطح السياسي، والترسيمات المحدودة عن "فصل الدين عن الدولة" بل استعاد المنظور المعرفي دوره، بوصفه أساسًا جوهريًا لبناء الدولة الحديثة. استنادًا إلى الوعي المطابق لدى ياسين الحافظ المؤسس على: أولًا، عقل وإعقال للواقع، لا يتم الوصول إليه بداهة بل بالتحليل الدقيق للعناصر والمكوّنات، في حركتها الجدلية الدائمة. وفي التحليل الأخير هو ليس سوى التقاط الواقع في سيرورته التاريخية، في خط تطورها العام. وهو ثانيًا، وعي عقلاني، يعتمد العقل منطلقًا ووسيلة، ويستبعد الرؤى المثالية أو الإشراقية. وهو ثالثًا، وعي نسبي، لا يدّعي الحيازة على الحقيقة المطلقة، إنه وعي يقترب من الواقع يلتقط ظاهراته ويحللها، ومن ثم ينقدها ليصل إلى تكوين تصور مفهومي يعاد اختباره في الممارسة، ويتم تصويبه على أساسها. والمفاهيم لدى الحافظ هي "توسطات ضرورية تجعل الواقع المتنوع والمعقد جاهزًا للوصف والتحليل، وليست أقانيم للعبادة والتقديس، توسطات ضرورية، لكنها ليست الواقع".