أحس السوسي بأن بيئة فاس والرباط لم ترويا عطشه من العلوم، فعزم السفر نحو بلاد الكنانة مصر، غير أن الفقر حال دون إتمام مسيرته، فاتجه قاصدا المدينة الحمراء "مراكش " وأنشأ بها أول مدرسة حرة، وذلك لإيمانه بأن التعليم والتربية هما السبيل القويم لمحاربة الجهل والتخلف، ومحاربة الاستعمار ومناهجه التعليمية التي احتقرت عقيدة الأمة ومحو لغتها، واعتنى السوسي بالمواد المهملة في المقررات الرسمية التي أرساها الاحتلال الفرنسي، كاللغة العربية والقرآن والتاريخ المغربي، والسيرة النبوية، وفي النظام العتيق كالتفسير وعلوم الحديث والأدب .