مارغوليس وكثير من علماء الأحياء غيرها، انتقدوا في السنوات الأخيرة قوة الانتقاء الطبيعي؛ ففي عام 2016م، جمعت الجمعية الملَكية في لندن -وهي أقدم وأشهر جمعية علمية- علماء الأحياء التطوري المؤثّرين من جميع أنحاء العالم لمناقشة هذه المشكلة بالذات، فانقسم العلماء إلى فريقين، اعتقد الأول ما اعتقده داروين من قبل وهو أن الانتقاء الطبيعي كان القوة المحركة للتطور، أما الفريق الآخر فقد عارضهم بشدة، واقترحوا بدائل حلّت مشكلات لم تستطع الداروينية حلها، سنذكر هنا ثلاثة منها: