وكان مولر ضمن المنتخب الذي رفع كأس العالم عام 2014 في البرازيل، إلا أنّه استُبعد عن "المانشافت" مع زميليه "ماتس هوملز" و"جيروم بواتنغ" منذ مارس 2019،وذلك من قبل المدرب "يواكيم لوف" الذي حاول إعادة بناء المنتخب، بعد تلقّيه صفعة موجعة في مونديال روسيا 2018، حيث خرج من دور المجموعات.