لعب الشيوخ دورا أساسيا في تحصين كتاب صحيح البخاري وحمايته من النقد؛ وذلك بالنظر لما يتضمنه من أحكام ومضامين تتلاقى وتتناغم مع توجهات "شيوخ السنة" وأتباعهم الكثر، فكانوا يلجؤون في أحيان كثيرة إلى الأساليب اللفظية العنيفة في مواجهة منتقدي البخاري، من قبيل التكفير والتفسيق. وكانت الدول والحكومات الإسلامية المعتنقة للمذهب السني تشاطر الشيوخ في ذلك، سواء عبر متابعة "خصوم البخاري" وملاحقتهم قضائيا تحت ذريعة "المس بالأمن الروحي"، أو من خلال منع أي نقاش فكري من شأنه إثارة موضوع نقد أحاديث السنة.