بعدما اشتد عوده اتجه نحو مراكش لاستكمال معارفه فانكب على التحصيل بجامع ابن يوسف منقطعا عن المخالطة بتأثير نفحة صوفية، وبعدما أحس السوسي أن مراكش لن تستطيع إشباع نهمه للعلوم وتحقيق طموحه المعرفي، اتجه صوب العاصمة العلمية فاس ليتم دراسته في المدرسة البوعنانية، حيث نهم العلوم الشرعية علي يد علماء مدينة فاس، وكذا التاريخ والجغرافيا والحساب والأدب، واندمج في البيئة الفاسية المتفتحة على العالم في ظل حركة ثقافية ووطنية حية، كانت ثمرتها نشأة طائفة من المفكرين الشباب في تلك المرحلة التي كان فيها الاستعمار الفرنسي باسطا ذراعيه على بلاد المغرب.