للكندي أكثر من ثلاثين أطروحة ، والتي تأثرت فيها بأفكار جالينوس. أهم أعماله في هذا المجال هو رسالة فــــــــــي قدر منفعة صناعة الطب، والذي أوضح فيها كيفيـــــــة استخدام الرياضيات في الطب، ولا سيما في مجالالصيدلة. على سبيل المثال، وضع الكندي مقياس رياضي لتحديد فعالية الدواء، إضافة إلى نظام يعتمد على أطوار القمر، يسمح للطبيب بتحديد الأيام الحرجة لمرض المريض.