لعدة سنوات، نجح نختنبو الثاني في صد محاولات الغزو من قبل الإمبراطورية الأخمينية. ومع ذلك، لعدة أسباب منها تعرضه للخيانة من قبل خادمه السابق منطور الرودسي، هُزم نختنبو الثاني في نهاية المطاف من قبل القوات الفارسية واليونانية في معركة بيلوسيوم (343 قبل الميلاد). احتل الفرس منف ثم استولوا على بقية مصر، وضموا البلاد إلى الإمبراطورية الأخمينية تحت قيادة أردشير الثالث. هرب نختنبو جنوبًا وحافظ على سلطته لبعض الوقت. مصيره اللاحق غير معروف.