هذه بعض الافتراضات التي تُفندها أدلة جديدة أو تفسيرات جديدة، والهدف من ذكر هذه الافتراضات وكيف يتم تفنيدها هو بيان الطبيعة المتغيرة للأفكار العلمية وأن هناك مناقشة حية مستمرة، وعلى الرغم من أن معظم علماء الأحياء يقبلون افتراضات الداروينية، إلا أن هناك غيرهم ينتقدونها بشدة مثل عالم الأحياء دينيس نوبل من جامعة أوكسفورد، فهو يقول: