رغم ما يشاع عن علاقته القوية بالأمين العام لحزب العدالة والتنمية عبد الإله بنكيران، أبدا محمد أمحجور موقفا رافضا لسماعي تبوء رئيس الحكومة السابق، لولاية ثالثة على رأس الحزب. معتبرا أن هذا التمديد لا يخرج عن "منطق تعديل الدساتير في دول الخراب والظلم فيما عرف بالجمهوريات الملكية".