جمعة كان مؤيدا لنظام مبارك ومعارضا بشدة لحكومة محمد مرسي، واستغل خطبة الجمعة في صيف 2012 في جولة الإعادة في الانتخابات الرئاسية بين مرسي و أحمد شفيق، كفرصة لإعلان تأييده لشفيق، وذهب إلى حد القول: "إن شفيق كان أقرب إلى الله من مرسي"، وكأن وحيا جاءه بهذا الخصوص.