توفي المختار السوسي سنة 1383 عقب مضاعفات ناتجة عن إصابته في حادثة سير وفي هذه المرحلة صرف جهده وهمته إلى إخراج مؤلفاته وكأنما كان يسابق الأجل، فخلف تراثا علميا كبيرا وغنيا، مخطوطا ومطبوعا، تعددت واجهاته بين الأدب والتاريخ والتربية والتعليم والفقه والتصوف، كما تركزت كتبه ومؤلفاته حول منطقة سوس فألف " خلال جزولة " في أربعة أجزاء وهو وصف لأربع رحلات علمية في المناطق السوسية مليئة بالفوائد العلمية والأدبية والتاريخية ، ثم " الإلغيات " في 3 أجزاء تضمن مذكراته خلال نفيه إلى مسقط رأسه، ثم " سوس العالمة " بمثابة مقدمة لموسوعة المعسول الشهيرة والتي قدمت في عشرين جزءا، و" إيليغ قديما وحديثا " تاريخ إمارة أسستها أسرة شريفة في قلب جبال جزولة السوسية منذ القرن 11 الهجري، و" معتقل الصحراء " يشمل مذكرات المعتقل الصحراوي إثر النفي الثاني وفيه نبذة من نشاط النخبة السياسية المغربية في المنفى... إلى ذلك من المؤلفات التي لا يسع الحيز لعدها.