تعد الفطريات المسبب الأكبر للأمراض النباتية والمسؤولة عن أخطرها، حيث تتسبب الفطريات بالإضرار بالنباتات عن طريق قتل خلايا النبات أو التسبب في إجهادها، وتنتقل العدوى الفطرية عن طريق البذور المصابة والتربة والأعشاب الضارة، وتنتشر هذه الفطريات عن طريق الرياح والمياه، أو حركة التربة الملوثة، أو الحيوانات، أو الآلات أو أدوات الزراعة وغيرها.