نظرية التطور لداروين هي نظرية فعالة، ونظرية علمية مقبولة؛ لكنها ليست حقيقة مطلقة، أو مؤكدة أو غير قابلة للتغيير؛ إذ تستند نظرية داروين على إطار احتمالي، يحتمل عدة افتراضات، وهناك خلافات حول أفكاره الأساسية، وإن الفكرة الشائعة بأن التطور يقوض وجود الإله هي فكرة خاطئة، فالعلم يتعامل فقط مع الظواهر التي يمكن ملاحظتها، والإله بطبيعته لا يمكن ملاحظته [بذاته]، إن فهم الأسس الفلسفية للعلم مهم جدًا لأنه يرسم لنا صورة أوضح لما يمكن للعلم فعله حقًا ولما يعجز عنه.