تتلمذ على يد "مهذب الدين عبد الرحيم على" الملقب "بالذاخور" وذلك بالبيمارستان النوري في "دمشق"، (الذي أسسه "نور الدين محمود بن الزنكي"، وقد حكم "سورية" بين عامي 1146- 1174 م)، وكانت "دمشق" قد ورثت مجد "بغداد" الطبي وازدهر العلم فيها بفضل حكامها "الأيوبيين" الذين كانوا يعيرون العلم عامة والطب خاصة اهتماماً كبيراً حتى أنهم جعلوا من عاصمتهم مركزاً رائداً للعلوم والفنون وحققوا فيها نهضة كبيرة، لقد ظلت "دمشق" واحة هادئة وسط عالم ساده الاضطراب، تحفظ فلول العلم والعلماء في الشرق، وكان من مظاهر هذه النهضة المكتبة التي أنشأها "نور الدين زنكي" واستودعها عدداً من نفائس الكتب، و"البيمارستان" الذي جذب أمهر أطباء عصره، وكانوا قد لجأوا إلى "دمشق" من بغداد حاملين معهم أشهر المؤلفات كقانون "ابن سينا" الذي دأب على دراسته والتعليق عليه جهابذة العلماء من بعده، لم يعرف شيئاً عن والدي"ابن النفيس" أو سلالته، وكان "الناصر صلاح الدين" قد أسس بيمارستاناً سمي بالناصري نسبة إليه (أو بالعتيق) حيث عمل "ابن النفيس" فترة من حياته إلى أن أنشأ "قلاوون" "البيمارستان المنصوري" (أو الجديد) فرأى السلطان أن يسند إدارته إلى هذا النطاسي الكبير ليفيد من خبرته الطبية وتوجيهه الغني المستنير، وربما يفسر ذلك سر إهداء "ابن النفيس" مكتبته لهذا المستشفى الناشئ، كما أنه أوصى ببيته عند موته، وهذا سلوك إنساني ريادي قل نظيره عبر العصور.