وفي العصر البيزنطي أقيم في الموقع كنيسة، تظهر بعض حجارتها القديمة متناثرة، كتيجان الأعمدة، وبقايا الأعمدة، والحجارة المصنوعة من الحجر الرملي المحلي التي تعرف به أريحا، وهي واحدة من معالم النهضة في أريحا البيزنطية، حيث أصبحت مدينة القمر مدينة مسيحية مهمة، تحوي العديد من الأديرة، والقصور كما يظهر في تلول أبو العلايق.