ونظم المئات من السلفيين عدة مظاهرات للمطالبة بعزله من منصبه، شارك فيها شباب "الإخوان" ردا على موقف المفتي من ثورة 25 جانفي، في الوقت الذي اضطربت فيه العلاقة بين جمعة وتلاميذه من شباب "الجماعة" بعد رفضهم طلبه الخروج في مظاهرة، ضد إحدى سياسات الجامعة، ما جعله يعلن غضبه عليهم صراحة، متهما إياهم بالعمل لمصالح "الجماعة" فقط، وما تمليه عليهم إرادتها.