تأسست إنجاكوجي في عام 1282، وأصبحت الثانية الأكثر أهمية في مجموعة من الأديرة تسمى غوزان (الجبال الخمسة) ، وهي تسلسل هرمي أنشئ في القرن الرابع عشر لمعابد زين تحت الرعاية الرسمية للشوغونات.
إنغاكوجي كان ديرًا تأسس في عام 1282.