لكن فترة ولايتها الثانية كانت محاطة بمشاكل الاضطرابات الإقليمية، أبرزها في آسام في المنطقة الشمالية الشرقية من البلاد، حيث خلفت المذابح المحلية 3000 قتيل، وفي البنجاب، حيث نظم المسلحون السيخ مظاهرات عنيفة لمزيد من الحكم الذاتي وحتى الاستقلال.
كانت فترة ولايتها الثانية مليئة بالمشاكل، بدءاً من المجازر إلى المظاهرات العنيفة.