يجب أن تتناول ممارسات ضمان الجودة داخل مختبر علم السموم المائي جميع الأنشطة التي تؤثر على جودة بيانات السمية النهائية للنفايات، مثل (1) أخذ عينات النفايات ومعاملتها؛ (2) مصدر وحالة الكائنات الحية المختبرة؛ (3) حالة وتشغيل المعدات؛ (4) ظروف الاختبار؛ (5) معايرة الأجهزة؛ (6) تكرار.
الأنشطة تؤثر على جودة البيانات النهائية.