نظرًا لرؤية المسيحية تهديداً لسلطته المركزية، قمع هيديوشي بشكل منهجي النشاط المسيحي؛ في عام 1597، صُلب ستة مبعوثين وعشرون من المتحولين اليابانيين في ناغازاكي.
اعتبر هيديوشي المسيحية مشكلة للحفاظ على سلطته، وبالتالي قمعهم بالإعدام.