En raison de leur isolement, les îles Yaeyama sont rêve pour les linguistes. Alors que le japonais standard est parlé partout et que la langue principale d'Okinawa est également bien comprise, il y a également une langue yaeyama ("yaimamunii") bien particulière. Ishigaki, Iriomote et Taketomi ont chacune leurs propres dialectes de celle-ci, et celui d'Yonaguni est tellement différent qu'il est habituellement considéré comme une langue distincte.