À la fin du , durant le règne du raja Dodda Vira Rajendra, l'histoire du Coorg se corse et devient rapidement une part sombre que les Kodavas se remémorent jusqu'à aujourd'hui. En effet, c'est à cette époque que le royaume voisin de Mysore, alors sous le contrôle du sultan Tipu Sahib, envahit la région une première fois mais est rapidement chassé en 1783, la seconde tentative se veut une victoire et le sultan marche sur Mercara en 1785. Durant l'occupation, l'envahisseur fanatique, tue en masse, dépeuple le pays et y installe des colons musulmans. Tipu fait même déporter une partie de la population avec la famille royale jusqu'à Srirangapatna, où ils seront emprisonnés et torturés jusqu'en 1792, où ils réussiront à s'échapper avec l'aide des Britanniques. La même année, le roi réussit à obtenir l'indépendance de son territoire grâce aux accords entre Tipu et les divers belligérants.