Cependant, aucun test clinique ne permettant de préciser avec certitude quelle salmonelle est responsable de l'infection, le médecin prescrira un antibiotique à prendre pendant 10 à 15 jours. En première intention, chez l'adulte, un fluoroquinolone ou de la ceftriaxone sera le plus souvent utilisé tandis que chez les enfants de moins de quinze ans, l'association co-trimoxazole ou de l'ampicilline sera souvent préférée.