Près de 40% du territoire de Pointe-Fortune est couvert de ses milieux naturels qui font partie du corridor vert de Vaudreuil-Soulanges, soit entre Pointe-Fortune jusqu'à l'Île-Perrot. Son territoire compte 17 espèces fauniques considérées en précarité. La municipalité compte plusieurs boisés. La municipalité applique une politique de plantation d'arbres, ainsi que de protection des arbres et des boisés.