L'île abrite environ sauvages protégés de toute influence humaine depuis plusieurs décennies, mis à part quelques parachutages de foin pendant certains mois d'hiver, mais ces actions ont été arrêtées afin de laisser la population se stabiliser naturellement. L'origine de ces animaux n'est pas connue. Ces chevaux sont l'emblème de la Nouvelle-Écosse depuis 2008. L'île comprend également plusieurs colonies d'oiseaux, des sternes arctiques et une sous-espèce de bruant des prés endémique de l'île. Des phoques communs et des phoques gris s'y reproduisent. Une espèce d'éponge d'eau douce est endogène aux mares de l'île. En 1977, l'île a été reconnue comme refuge d'oiseaux migrateurs. En 2011, un accord a été signé entre le gouvernement fédéral et le gouvernement de la Nouvelle-Écosse pour transformer l'île en réserve de parc national. D'ailleurs, la station de l'Île-de-Sable, gérée par Parcs Canada et Environnement Canada, est la seule installation de l'île ayant des employés.