En 1863, une autre bataille poussa Shimonoseki sur la scène mondiale. Alimentée par le dégoût pour les termes du traité ayant ouvert les ports japonais aux pays occidentaux, les guerriers du domaine Chōshū se rebellèrent, expulsant les étrangers et bloquant le passage aux navires commerciaux à travers le détroit de Kanmon. Le bombardement de Shimonoseki continua pendant plus d'un an, jusqu'à ce qu'une flotte de navires de guerre venus d'Angleterre, des Pays-Bas, de France et des États-Unis (en plein milieu de leur propre guerre civile) contraint le Chōshū-han à se rendre. Leur défiance ouverte fragilisa cependant le shogunat Tokugawa, qui tomba seulement trois ans plus tard.