L'avion est le principal moyen de transport utilisé et chaque communauté du Nunavut dispose d'un aéroport. La majorité des visiteurs arrivent à Cambridge Bay, Iqaluit ou Rankin Inlet à partir de l'un des aéroports suivants : Ottawa, Montréal, Winnipeg, Churchill, Edmonton et Yellowknife. Les villes de Calgary et d'Edmonton sont reliées avec une correspondance à Yellowknife.