La gare d'Ambérieu, située à la jonction de la ligne Mâcon - Ambérieu avec la ligne Lyon - Genève, est desservie par de nombreux TER à partir de Lyon, de Bourg-en-Bresse, de Mâcon, de Dijon, de Besançon, de Strasbourg, de Culoz, de Genève, d'Aix-les-Bains et de Chambéry.