Le transport par avion à l'intérieur du pays n'est pas très réputé. L'intégralité des compagnies certifiées par les autorités gabonaises sont sur la liste noire européenne et de nombreux autres pays. Mais cela reste un moyen rapide de voyager entre les principaux secteurs du pays : entre Franceville (Mvengue), Port-Gentil, Oyem et Libreville. Les compagnies sont principalement Afric aviation, Allegiance et Nationale Régionale Transport.