Le parc national de Biscayne protège la partie sud de la baie de Biscayne. Les portions terrestres du parc incluent une partie continentale et plusieurs îles. La partie maritime du parc comprend quatre écosystèmes : la forêt de mangrove, la baie, les "Keys", et les récifs de coraux. Le parc comprend une diversité faunique incluant des espèces menacées tels que le Lamantin des Caraïbes, le Crocodile américain, des tortues marines et le Faucon pèlerin.