D’une superficie totale de , soit 7,7% de la surface totale du Gabon, la province de l’Estuaire est bordée au nord par la Guinée Equatoriale, à l’est par le Woleu-Ntem, au sud par le Moyen-Ogooué et l’Ogooué-Maritime, et à l’ouest par l’Océan Atlantique.