La région de Duplessis est reconnue pour l'observation de la faune. En effet, elle comprend d'impressionnantes hardes de caribous qui sont particulièrement admirables en hiver lorsqu'ils migrent dans le secteur de Fermont. De plus, l'île d'Anticosti abrite une population de cerfs de Virginie dont le nombre dépasse . Il est aussi possible d'observer les mammifères marins dans les eaux du golfe Saint-Laurent qui comprennent des baleines, des dauphins et des phoques. La région de Duplessis est une destination idéale pour les amateurs d'observation d'oiseaux puisqu'elle comprend neuf refuges d'oiseaux migrateurs. Sur le littoral, des , des , des , des viennent nicher en colonies tandis que les peuvent être vus sur l'île d'Anticosti.