Le parc fut constitué en 1886 suite à la construction du premier chemin de fer transcontinental au Canada, le Canadien Pacifique. On y aménagea des sentiers et un hôtel afin d'y attirer les touristes venus admirer la chaîne Selkirk et le glacier Illecillewaet. Cependant, la construciton du tunnel Connaught en 1916 provoqua le déclin du tourisme et de la fermeture de la plupart des infrastructures du parc. La construction de la route Transcanadienne, inaugurée en 1962, traversant le parc, y réintroduisit le tourisme de masse. Le parc national des Glaciers est le deuxième plus vieux parc national du Canada, après celui de Banff.