Le voyage en train est sûrement au Japon le moyen le plus efficace de se déplacer à travers le pays. Son réseau extensif de plus de de voies couvrant les quatre îles principales est principalement desservi par la Japan Railways (JR) mais aussi par des compagnies privées et municipales plus petites. Comme les gares se trouvent généralement dans le centre-ville et que les trains sont ponctuels à la seconde près, se déplacer en train peut être significativement plus rapide qu'en avion. Pas étonnant que plus de 7 milliards ont pris le train en 2013 et 2014, ce qui montre bien l'importance primordiale de ce moyen de transport pour les Japonais.