À la douane, il y a un comptoir pour les étrangers. Si vous venez par vos propres moyens (billet sec), prévoyez de payer une taxe de séjour de ou américains pour un séjour maximum de 45 jours. Payable par les adultes et les enfants de moins de 16 ans. Pour des séjours plus longs il faudra demander une prolongation du visa de séjour auprès des autorités de l'immigration de l'île (à Moroni pour la Grande Comore/Ngazidja - à Mustamudu pour Anjouan/Ndzouani - à Fomboni pour Mohéli/Mwali). Il est possible d'obtenir le visa d'entrée à l'aéroport international Said Ibrahim de la Grande Comore (Hahaya - Moroni), à l'aéroport régional d'Anjouan de Ouani (Ouani - Mutsamudu) et à l'aéroport régional Bandar Es Salam de Mohéli (Fomboni).