Si vous comptez articuler votre séjour au Japon autour d'un long itinéraire, notez que le réseau à grande vitesse Shinkansen dessert principalement la côte Ouest de Kyūshū et la côte Sud-Est de l'île de Honshū. Par conséquent, voyager en dehors de ces axes (comme sur la côte de la mer du Japon dans les régions de Chūgoku, du Kansai et du Tōhoku) demandera des trajets plus longs (et donc des journées plus éprouvantes).