Un certain nombre de lignes privées de banlieue rayonnent depuis la boucle de la Yamanote vers les quartiers et les banlieues périphériques et presque toutes sont reliées directement aux lignes de métro à l'intérieur de la boucle. Les lignes privées sont utiles pour les excursions d'une journée en dehors de la ville et sont légèrement moins chères que la JR. Parmi celles-ci, la plus importante pour les visiteurs est sans doute la Yurikamome qui offre de superbes vues sur le trajet vers l'île d'Odaiba.