L'origine de Pregny , certainement occupée par les Romains puis par les Burgondes, n'est attestée que depuis le . Pourtant, le Moyen Âge n'y a laissé aucune trace, si ce n'est les voies dites historiques, les douves de l'Île Calvin et les fondements des châteaux de Tournay et de Penthes.