Le premier virus du genre "Zikavirus" a été identifié en 1947 sur un utilisé comme sentinelle lors d'une étude de la fièvre jaune dans la petite forêt de Zika proche de la localité de Kisubi située entre Kampala et Entebbe en Ouganda. En 1948, le virus est isolé, toujours à Kisubi, chez une femelle d’' et la transmission par un moustique du genre ' est prouvée, en 1956, dans un laboratoire de Barcelone. Entre 1954 et 1981, des preuves d'infection humaine sont détectées en Afrique subsaharienne, sur le Sous-continent indien et en Asie du Sud-Est, cependant, il faut attendre 1964 pour la première réelle description d'un cas humain.