Le lac Majeur se caractérise par des hivers froids, mais plus doux que l'intérieur des terres, et modérément enneigés (avec des accumulations moyennes de 10 cm pour chaque chute de neige et parfois même supérieures à 30 cm jusqu'à un maximum de 50 cm), des étés modérément chauds, humides et orageux , la température moyenne en janvier est d'environ 2 degrés Celsius, avec des pics de 3 degrés sur le versant nord du golfe Borromée (en raison de la large exposition au soleil), les températures nocturnes peuvent descendre en dessous de 0, jusqu'à - 10, mais descendent très rarement en dessous de cette valeur. En été, les températures moyennes tournent autour de 22 degrés Celsius, avec des pics diurnes qui dépassent rarement 32 degrés. En avançant vers les vallées internes, les températures deviennent progressivement plus rigides. La région est très pluvieuse et parfois, surtout pendant les saisons intermédiaires, des inondations peuvent se produire. Les températures de l'eau de surface (jusqu'à 2 mètres de profondeur) du lac atteignent des pics hivernaux de 5-6 degrés, tandis qu'en été, elles atteignent une moyenne de 22-24 degrés.