Le climat d'Eilat est très sec. En effet, comme dans le désert du Neguev tout proche, l'humidité est inférieure à 10 % et les températures sont très élevées. En été, elles peuvent dépasser régulièrement les , atteignant parfois les à l'ombre. Durant l'été, Eilat est la station balnéaire du Golfe d'Eilat où les températures maximales sont les plus élevées. En effet, à Eilat, on peut relever parfois des températures maximales de 3 à supérieures à celles de Sharm el Sheikh en Égypte, ville pourtant située plus au Sud sur le Golfe d'Eilat. Le phénomène inverse se produit en hiver, mais dans une moindre mesure (1 à en moyenne de plus à Sharm el Sheikh).