Le territoire et les vallées de la ville sont traversés par des ruisseaux avec des bassins d'importance différente. Le plus grand écoulement le long des vallées homonymes et sont le Polcevera, à l'ouest du centre, avec un bassin élargi et un chemin droit vers la mer et, à l'est, le Bisagno avec un bassin plus étroit et un parcours plus tortueux. La ville s'est développée urbanistiquement dans ces deux vallées avec des quartiers résidentiels, des établissements productifs et des infrastructures.