Le centre de Tokyo, jadis réservée au shogun et à ses samouraïs, était traditionnellement nommé "Yamanote", et est grossièrement défini par la ligne de train JR Yamanote circulaire (voir Circuler), qui peut servir de point de repère. Le centre-ville populaire de l'ère Edo ("Shitamachi", 下町) se trouve au nord et à l'est. S'étendant dans toutes les directions, Tokyo ne présente aucune frontière apparente avec les villes de banlieue que sont Yokohama, Kawasaki et Chiba.