Il peut venir des mots de swahili, «kilima» (petite montagne) et «njaro» (le démon du froid); ou bien de l'expression «njaro» (caravanes), en référence aux convois d'esclaves des marchands arabes de Zanzibar, qui faisaient jadis halte dans les parages. Certains évoquent le mot «njare», la source de l'eau. Les Masaï l'appellent simplement «Ngage Ngai», c'est-à-dire la «maison de Dieu».