Il y a des aéroports à Zagreb, Zadar, Split, Osijek, Pula et Dubrovnik. Les lignes intérieures ne sont pas très chères si réservées longtemps a l'avance. Le trajet Zagreb - Dubrovnik peut-être intéressant à faire en avion car il est très long par la route en été. Il existe une liaison Pula-Zadar a peu de frais avec la compagnie Croatia Airlines.