Garni est riche en histoire. La zone a été occupée au 3ème millénaire avant JC. Le site forme un terrain facilement défendable dans l'un des méandres de la rivière Azat. Au avant J.-C. la région a été conquise par le roi d'Ourartou Argishti I. Les fortifications de Garni ont probablement été érigées dans le courant du avant J.-C. et servait de résidence d'été pour les dynasties royales arméniennes Orontid et Artaxiad. Plus tard, autour du avant J.-C., la forteresse de Garni est devenu le dernier refuge du roi d'Arménie Mithridate, où lui et sa famille ont été assassinés par son fils adoptif et neveu Rhadamiste. Finalement, la forteresse a été saccagée en 1386 par Timur Lenk. En 1679, un tremblement de terre a dévasté la région et a détruit le temple.