Les seules méthode de prévention générale sont soit la réduction des sites de ponte du vecteur en asséchant les fossés, en protégeant les réserves d'eau par une moustiquaire ou un couvercle, en éliminant de la nature tout objet pouvant récolter l'eau de pluie comme les vieilles casseroles ou les vieux pneus, soit de lâcher dans la nature des mâles rendus stériles grâce à une infection provoquée par une bactérie du genre "" où encore de lâcher des moustiques mâles génétiquement modifiés et incapables de se reproduire. C'est cette dernière méthode, maintenant controversée, qui fut utilisée en 2015 au Brésil du Nord-Est, c'est-à-dire là où l'épidémie de 2015 à démarré et où furent décelés les premiers cas de microcéphalie.