De nombreux trains circulent entre Bratislava et Košice. Plusieurs liaisons depuis Prague sont assurées quotidiennement par train de nuit et de jour. Il faut compter environ . 2 trains quotidiens pour Budapest, de trajet. 1 train en soirée par jour pour Lviv (1 nuit), Kiev (1 nuit et un jour) et Moscou (2 nuits). En été, un train par semaine pour Bourgas en Bulgarie.