En 1474, le nom de Mostar apparaît pour la première fois dans un document en référence au gardiens du pont, les mostari. Ce pont antique qui se trouvait sur la route commerciale entre l’Adriatique et les riches régions minières du centre de la Bosnie, permit à la bourgade de s'étendre sur la rive droite de la Neretva et de devenir la première ville de l’Herzégovine, avant d'être le centre du gouvernement turc à l'arrivée des Ottomans. Durant la domination ottomane, un quartier musulman se développe avec ses mosquées et bains. En 1878, Mostar, ainsi que le reste de la Bosnie-Herzégovine, passe sous administration austro-hongroise, puis fait partie, après 1918, du nouveau Royaume des Serbes, des Croates et des Slovènes, la future Yougoslavie.