Challes-les-Eaux dispose d’un aérodrome pour les petits avions de loisirs. Pour les avions de ligne, il est nécessaire de se rendre à l’aéroport de niveau international de Chambéry, baptisé « Chambéry Savoie », qui se situe à environ au nord. En voiture il faut compter environ depuis le centre-ville. Géré par la société Vinci depuis 2004, il rayonne sur le département de la Savoie. Son trafic annuel (environ passagers) en fait le 32ème aéroport français en termes de fréquentation. L’aéroport de Chambéry est complété par les aéroports de Grenoble et Lyon situées tous deux à environ de route par les autoroutes et .