Considérant que le territoire de la MRC La Côte-de-Beaupré couvre jusqu'au milieu du fleuve, le territoire de Sault-au-Cochon inclut des récifs fluviaux, des bancs de sables (banc du Cap Brûlé, banc des Îlets), des brisants (brisants du Cap Brûlé) et des cayes (caye du Père-Édouard, caye de la Prairie, caye du Cap Brûlé). Ces hauts-fonds et ces îlots de sable ou de roches s'avèrent des obstacles à la navigation.