Les compagnies JR régionales proposent aussi des passes ne couvrant que leur réseau. Ils représentent "généralement" une moins bonne affaire et vous devrez vraiment planifier avec attention pour qu'ils soient rentables: en particulier, aucun n'est valide pour voyager entre Tokyo et Kyōto/Osaka. Contrairement au Rail Pass national, ils ne peuvent être acheté que dans le pays (à n'importe quelle gare JR importante), mais ils restent pour la plupart réservés aux visiteurs. Du nord au sud: