La région, qui s’est engagée dans une politique de développement durable, compte 4 Parcs Naturels Régionaux (soit près de 20% de la superficie du territoire régional), 10 Réserves Naturelles Régionales, plus de Zones Naturelles d’Intérêt Ecologique, Floristique et Faunistique (les ZNIEFF). S’y ajoutent le Parc National des Pyrénées, la Réserve Naturelle nationale du Néouvielle ainsi que près de 100 sites Natura 2 000 classés à l’inventaire national du patrimoine naturel.