Il existe deux types de trains circulant à travers la préfecture: les trains JR et les lignes privées. La ligne JR traverse du nord au sud (en venant de Kyoto/Osaka au sud et de Kanazawa au nord) et la plupart des trains s'arrêtent à Tsuruga, à Takefu (ville d'Echizen), à la ville de Fukui et à Awara. Il y a quelques lignes de train privées avec un petit nombre de gares dédiées qui valent surtout le coup pour les courtes distances, mais qui sont plus chères que les trains locaux JR. Une passe par la ville d'Echizen, par Sabae, et par la ville de Fukui (transfert à pied avec la gare JR à Takefu/Echizentakefu, Sabae/Nishisabae ou Fukui/Fukuiekimae). Une autre ligne passe au nord de la gare de Fukui. Il y a aussi une ligne à l'est vers Ōno.