Les lignes JR ont un code couleur et la Yamanote est en vert clair. Même si elle n'est pas une ligne de métro, son importance fait qu'elle figure généralement sur les plans de métros. La ligne Chūō (orange, "Chūō-sen") et la ligne Chūō-Sōbu (jaune, "Chūō-Sōbu-sen") circulent parallèlement dans Tokyo, croisant la boucle de la Yamanote à Shinjuku à l'ouest et à la gare de Tokyo à l'est. Les lignes de banlieue JR Saikyō et Keihin-Tōhoku circulent sur un axe nord-sud, longeant la Yamanote respectivement coté Ouest et Est. JR East dispose d'une bonne ligne d'information en anglais aux et .