Le climat est tropical toute l'année. Il y a deux saisons, la saison sèche ('verano', été) qui dure de décembre à avril, et la saison humide ('invierno', l'hiver). Cependant, le pays a beaucoup de micro climat dépendamment de l'élévation, le niveau de pluie, la topographie et par la géographie de chaque région particulière. Durant l'hiver, il pleut quasiment tous les jours dans certaines régions du pays. Septembre et octobre sont les mois les plus pluvieux et voient le moins de touristes. Ces deux mois sont appelés la "saison verte" par les acteurs locaux du tourisme, parce que la pluie constante entraîne une croissance luxuriante des forêts tropicales. À noter également que les jours de pluie commencent rarement avant 14h, et que ces jours restent chauds.