Iqaluit a un climat arctique typique même si la communauté est située bien au-dessous du cercle arctique. Les températures moyennes sont sous le point de congélation huit mois par année. La saison pendant laquelle vous visitez Iqaluit influencera grandement les activités que vous y ferez. Le meilleur moment de l'année pour visiter la ville est durant le court été. La glace de la baie de Frobisher ne commence à fondre qu'en juin ne permettant la circulation pour les brises-glaces qu'à partir de fin juin. La circulation de bateaux dans la baie est possible jusqu'en novembre.