Bayonne bénéficie d’un climat océanique de type aquitain, avec un micro climat dû à la proximité du piémont pyrénéen, qui favorise une pluviométrie relativement importante (moyenne de par an contre à Arcachon, ville située à une centaine de kilomètres plus au nord) mais aussi une température douce toute l’année. Les étés y sont tempérés par les brises marines et les hivers plus tièdes que dans le reste du pays (sinon sur la Côte d'Azur et en Corse) par « effet de Foehn » et sous l’influence des courants océaniques. L'ensoleillement reste assez important : près de par an.