La grande baie de Venise s'avance sur trois kilomètres vers le nord dans les terres. Cette baie est barrée du côté ouest par la Pointe Fontaine et du côté est par la Pointe Jameson. Venise-en-Québec comporte de rive sur la baie Missisquoi. Les principales plages sont (est en ouest): Missisquoi, Saint-Pierre, Venise, Kirkland et Champlain. Ce territoire municipal comporte une zone de marais La Swamp, ainsi que l'Étang John qui chevauche Clarenceville et Venise-en-Québec.