Awajishima a quelques arguments pour prétendre être une des plus anciennes zones habitées du Japon. Le Kojiki (ancien recueil de mythes) la mentionne sous le nom d'« "Onokoroshima" » et des tumulus ("kofun") remontant à plusieurs milliers d'années ont été découverts sur l'île. Le théâtre de marionnettes "ningyō jōruri", qui a évolué pour devenir le "bunraku", semble venir d'Awajishima.