La plus grande partie d'Okinawa a un climat subtropical, les extrémités sud (Yaéyama et les îles périphériques) étant entièrement tropicales. Même en janvier et février, la température maximale moyenne est d'environ (), faisant de la région une escapade hivernale populaire, mais le ciel est souvent nuageux et généralement un peu trop froid pour prendre le soleil à cause de la mousson d'hiver. Le printemps, vers la fin de mars et avril, est un excellent moment pour visiter si vous prenez soin d'éviter la Golden Week (une succession de jours fériés à partir de la fin de avril); toutefois, ​​les petites îles ne sont pas du tout bondées, même pendant la Golden Week. La saison des pluies commence au début de mai et se poursuit jusqu'en juin. Contrairement à la saison des pluies dans la partie continentale du Japon, il ne pleut pas tous les jours ni toute la journée pendant la saison des pluies à Okinawa. L'été à Okinawa est chaud et humide, mais reste l'une des périodes les plus fréquentées, tandis que septembre apporte une succession de typhons violents. Octobre et novembre sont également de bons moments pour visiter.