La circulation à Bayonne est généralement assez fluide, en dehors des heures de sorties des bureaux et de la période estivale — notamment pendant les « Fêtes de Bayonne » — où les encombrements sont souvent très importants. De nombreuses aires de stationnement sont implantées aux abords immédiats du centre-ville (qui est piétonnier) et sont le plus souvent payantes et soumises à une tarification qui diffère selon qu'on habite, travaille ou soit simplement de passage à Bayonne. En 2014, les prix varient ainsi de à /mois pour les résidents, à /mois pour les personnes travaillant dans la commune et de /heure à /heure pour les visiteurs. Des forfaits à /mois sont également proposés. Les parkings sont parfois en surface, parfois couverts. Les plus importants sont : Vauban, Pedros, Charles-de-Gaulle, Glacis, Paulmy, Champ-de-Foire, Lautrec, Porte d'Espagne, Les Tennis, Tour de Sault, Owen Roe, Baignade, Glain, Sainte-Claire, Boufflers, Gare et Belfort. Sur la voirie, le tarif des horodateurs va de pour une demi-heure à pour .