Au la ville d'Èvora est choisie comme lieu de résidence royale, un collège y est fondé en 1551, deux ans plus tard celui-ci se transforme en université. Malheuresement, sous la domination espagnole de 1580 à 1640, Évora perd de son importance. Le , premier ministre en 1759 expulse les jésuites du pays obligeant à la fermeture de L'université, et aggravant ainsi le lent déclin de la ville.