La meilleure période pour visiter Popenguine comme pour le Sénégal est la période de novembre à mai. Cette période est caractérisée par une faible pluviométrie, une humidité relative moindre et des températures basses. Pendant cette période les oiseaux migrateurs arrivent pour hiverner au Sénégal et offrent par conséquent des opportunités d'observations aux passionnés. La période allant de juin à octobre coïncide avec la période des pluies proposant des températures élevées en août et octobre.