L'emplacement de Skopje sur le Vardar et de ses affluents dont à proximité des montagnes imposantes, en fait un lieu d'une grande beauté. Le plus haut sommet, le mont Vodno, à , surmonté de la croix du millénaire, est visible de toute la ville et constitue une destination de loisirs majeure. La rivière Treska traverse les montagnes du sud-ouest de Skopje, formant le magnifique paysage du Canyon de Matka.