L'Amou-Daria et le Syr-Daria sont les fleuves les plus importants d'Ouzbékistan et d'Asie centrale et se jettent dans la Mer d'Aral. La longueur totale de l'Amou-Daria est de km, celle du Syr-Daria est de km. Au nord-est et au sud s'étendent les chaînes de Tian Shan et de Hissar-Alaï. Le sommet le plus élevé du pays est l'Adelunga Toghi qui culmine à . 