Les routes US 101 et California 1 traversent la ville du Nord au Sud. En venant du nord, on entre dans la ville par le Golden Gate Bridge, pont supportant à la fois la US 101 et la California 1. Le coût du péage est de dans ce sens. Au sud, les deux routes se séparent, la US 101 suivant les rues Lombard et Van Ness, et ensuite le littoral de la Baie de San Francisco en direction de l'aéroport international SFO, la Silicon Valley et la ville de San Jose. La route California 1 quant à elle est plus près de l'Océan Pacifique et permet de se rendre dans la région de Los Angeles en suivant la côte en passant par Santa Cruz, Monterrey et San Luis Obispo.