Ada beberapa hal sebagai kendala dalam bekerjanya komponen sub-sub sistem selaku penyelenggara pelaksanaan peradilan pidana (criminal justice system) seperti tidak adanya tujuan yang sama diantara subsub komponen, kurangnya sarana prasarana penunjang untuk bekerjanya sebuah sistem, tidak dimilikinya keahlian karena kurangnya pelatihan (training) yang dilakukan kepada para administrator peradilan, dan yang terakhir lemahnya pengawasan (kontrol) baik intern-ekstern maupun vertikal-horizontal kepada institusi, personal setiap administrator yang terlibat dalam lingkup kerja sistem peradilan pidana (criminal justice system) sehingga semua ini membawa lemahnya penegakan hukum yang diharapkan dan kacaunya sistem peradilan pidana yang semestinya menjadi harapan setiap pencari keadilan dan semua pihak yang mendambakan keadilan.