Selain persoalan di atas, persoalan lain yang berkaitan dengan proses implementasinya juga lebih didominasi pencapaian kemampuan kognitif serta Kurang mengakomodasikan kebutuhan afektif dan psikomotorik, di samping itu kendala lain adalah kurangnya keikutsertaan guru mata pelajaran lain dalam memberi motivasi kepada siswa untuk mempraktekkan nilai-nilai Fiqh dalam kehidupan sehari hari.