Pada penelitian ini terdapat beberapa keterbatasan seperti instrumen penelitian yang dikembangkan oleh peneliti sendiri yang kurang pengalaman, KPSP yang kurang seimbang dalam membagi penilaian perkembangan, jumlah sampel yang kurang memadai karena dibagi tiga kelompok umur balita, proses pengumpulan data karena banyak anak balita yang tidak mau dilakukan pemeriksaan (malu atau takut), dan hasil penelitian yang hanya dapat digeneralisir di wilayah kerja sebuah Puskesmas rawat inap di Pekanbaru.