Dibalik kemudahan dan manfaat yang ditawarkan dari fasilitas internet banking juga memiliki risikoyang tinggi apabila sistem teknologi informasi yang dibangun memiliki banyak kelemahan seperti konektivitas yang lambat, sering terjadi gangguan (error) bahkan jika terdapat celah keamanan oleh gangguan para peretas, sehingga sering menjadi pertanyaan bagi para nasabah sebelum mereka memutuskan menggunakan internet banking khususnya mengenai kerahasiaan data pribadi, keamanan transaksi dan gagal transaksi.