Sistem zonasi ini dikecualikan bagi SMK pasal 17 , sekolah Indonesia di luar negeri, sekolah berasrama, satuan pendidikan Kerja Sama, sekolah di daerah yang jumlah penduduk usia sekolah tak dapat memenuhi ketentuan jumlah siswa dalam 1 satu rombongan belajar yang diatur di Pasal 20, sekolah di daerah Tertinggal, Terdepan, dan Terluar 3T , dan sekolah layanan khusus Pasal 34 .