Analisis asam amino dalam sampel diawali preparasi sampel yang tujuan utamanya untuk menghidrolisis pepetida sederhana yang membebaskan asam amino, sehingga data asam amino yang terdeteksi pada HPLC adalah asam amino total (asam amino bebas yang sudah ada sebelum hidrolisis ditambah asam amino yang dibebaskan dari proses hidrolisis).