Rehabilitasi dan Rekonstruksi dilaksanakan dengan mengindahkan prinsip-prinsip kepemerintahan yang baik good governance yakni asas transparansi, akuntabilitas, partisipatif, dan independensi dengan mempertimbangkan aspirasi dan kebutuhan masyarakat Provinsi Nanggroe Aceh Darussalam dan Kepulauan Nias Provinsi Sumatera Utara.