Scrivi una continuazione per questo paragrafo - All'inizio del 1863, il 6° Missouri fu trasferito a Grand Gulf, Mississippi, dove il reggimento aiutò a costruire fortificazioni. Il reggimento fu presente alla battaglia di Grand Gulf.
Il 29 aprile. Insieme a molti degli altri uomini della First Missouri Brigade, il 6th Missouri fu spostato a Port Gibson, Mississippi il 1o maggio per contrastare un sbarco dell'Unione. Nella battaglia di Port Gibson, avvenuta il 1o maggio, il 6th Missouri fu utilizzato per sostenere l'ala destra della linea confederata. Quando le truppe dell'Unione minacciarono di tagliare la rotta di ritirata confederata, il 6th Missouri contrattaccò. L'attacco penetrò profondamente nella linea dell'Unione, ma fu costretto a ritirarsi a una certa distanza quando incontrò rinforzi dell'Unione. Il 6th Missouri divenne isolato dal resto della forza confederata, iniziò a rimanere senza munizioni e fu costretto a fare una ritirata di combattimento per riunirsi alla forza principale confederata mentre si ritirava.