Radicalizzati dai recenti eventi, i riformatori polacchi (sia in esilio che ancora residenti nell'area ridotta rimasta al Commonwealth) stavano presto lavorando ai preparativi per un'insurrezione nazionale. Tadeusz Kościuszko, un generale popolare e veterano della Rivoluzione Americana, fu scelto come suo leader. Tornò dall'estero e emise la proclamazione di Kościuszko a Cracovia il 24 marzo 1794. Chiamava a una rivolta nazionale.
sotto il suo comando supremo. Kościuszko emancipò molti contadini per arruolarli come "kosynierzy" nel suo esercito, ma l'insurrezione duramente combattuta, nonostante il sostegno nazionale diffuso, si dimostrò incapace di generare l'assistenza straniera necessaria per il suo successo. Alla fine, fu soppressa dalle forze combinate di Russia e Prussia, con Varsavia catturata nel novembre 1794 dopo la battaglia di Praga.