Nel 1805 divenne professore di medicina a Kiel (allora in Danimarca e parte del Ducato di Holstein) con il titolo di Consigliere di Giustizia e, in seguito, Consigliere di Stato. Questi furono anni difficili per la Danimarca che si era schierata con la Francia nelle guerre napoleoniche.
contro l'Inghilterra (e i suoi alleati) per preservare il suo impero marittimo. Il denaro era un problema e Wiedemann usò le proprie risorse per istituire la clinica di ostetricia proposta come uno dei suoi doveri di professore.