Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Tuttavia, come spesso accadeva con la monarchia elettorale polacca, il risultato fu fortemente contestato dai "perdenti" e dalla avida e testarda nobiltà polacca che sosteneva Massimiliano III, arciduca d'Austria. Dopo aver saputo della sua elezione, re Sigismondo sfuggì alle grinfie dei protestanti in Svezia e sbarcò in Polonia il 7 ottobre. Acconsentì immediatamente a rinunciare a diversi privilegi reali al "Sejm" (parlamento) del Commonwealth nella speranza di vincere alcuni dei suoi nemici e risolvere le elezioni controverse. Il tesoriere prussiano Jan Dulski lo proclamò re per conto del maresciallo della corona Andrzej Opaliński. Il 27 dicembre fu incoronato nella cattedrale di Wawel a Cracovia. Sembrava che la questione di chi sarebbe stato re di Polonia fosse stata risolta quando Massimiliano III invase a capo del suo esercito per rivendicare la sua corona. Le ostilità non durarono a lungo, poiché l'etmano Jan Zamoyski alla testa di un esercito polacco fedele al re Sigismondo incontrò e sconfisse con successo le truppe austriache nella battaglia di Byczyna.
e prese Massimiliano III come prigioniero di guerra. Tuttavia, su richiesta di Papa Sisto V, re Sigismondo III liberò Massimiliano che rinunciò alla sua pretesa al Commonwealth polacco nel 1589. Anche il re Sigismondo cercò di mantenere la pace con il suo potente vicino sposando l'arciduchessa Anna d'Austria nel 1592. Era sempre stata sua intenzione allearsi con l'Austria cattolica contro le forze protestanti che stavano dividendo la cristianità.