Completa la seguente frase: Nel marzo 1861, Ferguson fu nominato capitano nella milizia della Carolina del Sud, successivamente nominato tenente e aiutante di campo del generale di brigata dell'esercito P. G. T. Beauregard. Fu uno degli ufficiali che ricevette la resa formale del maggiore dell'esercito statunitense Robert Anderson a Fort Sumter, innalzò la prima bandiera degli Stati Confederati e inviò le prime guardie a Fort Sumter. Dopo l'assedio, fu inviato a presentare la prima bandiera confederata colpita da un colpo nemico al Congresso provvisorio degli Stati confederati. Era tenente colonnello e aiutante del generale Beauregard durante la
Battaglia di Shiloh. Durante la battaglia di Farmington, era nel 28° Reggimento di Cavalleria del Mississippi. Ha comandato l'unità mentre difendeva Vicksburg, e ha aiutato a fermare gli attacchi effettuati dal maggiore generale statunitense William T. Sherman e dal commodoro statunitense David Porter.