Durante la sua seconda stagione al Michigan, Hughes fu selezionato per competere al
Campionato Mondiale Junior 2019 di Hockey su Ghiaccio, al fianco di suo fratello Jack. Sono diventati solo la terza coppia di fratelli a competere per il Team USA in un torneo World Juniors, con la coppia più recente di Joey e Michael Anderson nel 2017. Il 24 dicembre 2018, Hughes, insieme al compagno di squadra del Michigan Josh Norris, è stato nominato capitano alternativo per il Team USA. I due giocatori erano due dei cinque concorrenti di ritorno dalla squadra dei Campionati del Mondo Junior 2018. Hughes ha aiutato a condurre la squadra USA al turno per la medaglia d'oro del torneo, dove hanno perso 3 a 2 contro la Finlandia.