L'attuazione della costituzione della Federazione Malaya basata sulle proposte costituzionali rivedute il 1° febbraio 1948 e la decisione dell'MCP di lanciare una ribellione armata segnò l'inizio della fine per la coalizione PUTERA-AMCJA e AMCJA nel suo complesso. Con la dichiarazione di emergenza nazionale
, le organizzazioni costituenti si sono ritirate dalla coalizione, sono andate in clandestinità o, nel caso della MDU, si sono sciolte volontariamente e l'AMCJA ha cessato di esistere come organismo.