Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Pettus ha servito nel teatro occidentale della guerra civile americana. Durante la Campagna di Stones River, fu catturato dai soldati dell'Unione il 29 dicembre 1862 e scambiato poco dopo con i soldati dell'Unione. Pettus fu catturata di nuovo il 1° maggio 1863, mentre parte della guarnigione che si era arresa e che difendeva Port Gibson
nel Mississippi. E' riuscito a fuggire e tornare alle sue linee. Pettus fu promosso colonnello il 28 maggio e gli fu dato il comando del 20° Alabama.