Durante la sua seconda stagione al Michigan, Hughes è stato selezionato per competere ai Campionati Mondiali di Hockey su Ghiaccio Junior 2019
, accanto a suo fratello Jack. Sono diventati solo la terza coppia di fratelli a competere per il Team USA in un torneo World Juniors, con la coppia più recente di Joey e Michael Anderson nel 2017. Il 24 dicembre 2018, Hughes, insieme al compagno di squadra del Michigan Josh Norris, è stato nominato capitano alternativo per il Team USA. I due giocatori erano due dei cinque concorrenti di ritorno dalla squadra dei Campionati del Mondo Junior 2018. Hughes ha aiutato a condurre la squadra USA al turno per la medaglia d'oro del torneo, dove hanno perso 3 a 2 contro la Finlandia.