Wouda è stato per due anni allenatore del nuoto giovanile olandese, prima di essere nominato assistente allenatore del Verhaeren di Eindhoven, nell'ottobre del 2006. Ha guidato Maarten van der Weijden al suo titolo mondiale nei 25 km e al titolo olimpico nei 10 km. È anche l'allenatore di Hinkelien Schreuder, che faceva parte della squadra olandese d'oro 4 × 100 m stile libero e ha raggiunto il 7 ° posto individuale nei 50 m stile libero.
alle Olimpiadi di Pechino nel 2008.