Il debole sistema politico della Seconda Repubblica spagnola e l'ascesa del nazionalismo portarono allo scoppio della guerra civile spagnola nel luglio del 1936. Poco dopo il conflitto, Puerta de Hierro fu occupata dalle Juventudes Socialistas Unificadas, che usarono il terreno per ospitare se stessi. Più tardi quell'anno il club fu occupato dalla Colonna Rosal, che stabilirono il loro quartier generale nella casa club e scavarono diverse trincee e nidi di mitragliatrici in tutta la proprietà, compresi i campi da golf. Il club, che si trovava nel centro del fronte di Madrid
, era, per la maggior parte, territorio repubblicano, mentre la Casa de Campo segnò l'inizio dell'area nazionalista. Fu solo durante questo periodo che il club non ebbe un presidente (1936-1939).