Mentre era di stanza alla Fortezza Monroe, il generale Benjamin Butler comandò una spedizione congiunta dell'esercito e della marina per catturare i Forti confederati di Hatteras e Clark. Nella successiva battaglia di Hatteras Inlet Batteries
, una forza anfibia mista guidata dal comandante del 20° New York, il colonnello Max Weber, accettò la resa dei due forti. Lo sbarco fu un fallimento, in cui l'alto mare impedì alla maggior parte delle forze d'invasione di sbarcare e lasciò solo 318 uomini bloccati a terra con provviste inadeguate. Il conseguente bombardamento navale dell'Unione, tuttavia, costrinse le guarnigioni confederate a arrendersi. La parte del 20° che aveva preso parte all'invasione rimase nelle vicinanze dei Forti Hatteras e Clark per diverse settimane, fino a quando non arrivarono le notizie al maggiore generale John Ellis Wool che i soldati del reggimento avevano commesso "depredanti e vari oltraggi" sugli abitanti. Altre fonti suggeriscono che il colonnello del 9° New York abbia incolpato per il saccheggio gli uomini del 20° per proteggere la reputazione del suo stesso reggimento, che aveva anche partecipato.