Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Quando l'unità fu originariamente ritirata dal servizio, i termini di arruolamento di 90 giorni erano scaduti, Nugent accettò una commissione come capitano nell'esercito regolare. Fu immediatamente assegnato al 13° reggimento di fanteria, il cui comandante, il colonnello William Tecumseh Sherman, lo chiese personalmente. Prendendo un congedo per tornare a New York, assistette Thomas Francis Meagher nell'organizzazione della Brigata irlandese. Il 69o reggimento di fanteria fu la prima unità assegnata alla brigata irlandese e, con Nugent come colonnello, guidò il "Fighting 69th" nelle battaglie di Fair Oaks, Gaines Mill, Savage Station
, White Oak Swamp, Glendale, e Malvern Hill.