Quando il III Corpo fu abolito, la batteria di Clark fu trasferita all'artiglieria di riserva nella brigata del maggiore John A. Tompkins. In quella formazione, la batteria di Clark servì nelle prime battaglie della campagna di Overland. Al momento della battaglia di Cold Harbor, la batteria di Clark era stata trasferita alla brigata di artiglieria del II Corpo sotto il colonnello John C. Tidball. Nell'assedio di Petersburg, la batteria di Clark rimase nel II Corpo sotto Tidball e poi sotto il colonnello John G. Hazard. Clark fu ferito in seconda battaglia di Ream's Station.
Nel 1864. In seguito accompagnò le truppe della sua batteria, le cui iscrizioni erano scadute, a Trenton, nel New Jersey, prima di tornare al fronte di Petersburg. Tornato a Petersburg, Clark era responsabile dell'artiglieria sulle linee del fronte del II Corpo nel dicembre 1864.