Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Dopo essersi trasferito a Giacarta, Latuharhary ha anche iniziato a lavorare per i giapponesi sotto il Dipartimento degli Affari Interni per gestire i moluccani a Java, e ha assunto la responsabilità delle loro azioni. Nel 1944, un gruppo di abitanti di Ambonese, tra cui Latuharhary, furono arrestati dal Kenpeitai e portati a Bogor in quanto erano sospettati di spionaggio per le forze alleate, e a causa del fatto che Latuharhary aveva in parte usato la sua posizione all'interno dell'amministrazione giapponese per scopi politici. Tuttavia, sua moglie e altri due riuscirono di nuovo a convincere un comandante della Marina giapponese a provvedere alla loro liberazione. Verso la fine del 1944, fu nuovamente arrestato dopo che un prigioniero moluccano era fuggito da una prigione. Le autorità giapponesi all'epoca erano particolarmente sospettose di Ambonese dopo la battaglia di Morotai.
e il bombardamento strategico di Ambon nel 1944, ulteriormente alimentato da operazioni di spionaggio alleate nelle Molucche guidate da Ambonese Julius Tahija.