Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Gilbert si arruolò nell'esercito volontario più tardi di molti dei suoi contemporanei, arruolandosi nell'ottobre del 1862. Tuttavia, fu nominato colonnello del 27° Reggimento di fanteria volontaria dell'Iowa il 3 ottobre 1862. Il reggimento di Gilbert partecipò alla spedizione di Little Rock di Frederick Steele
Ma non era coinvolto in combattimenti. Fu inviato in servizio di guarnigione in Arkansas e poi trasferito in Mississippi, dove il suo reggimento fu assegnato alla divisione di Andrew J. Smith nel XVI Corpo durante la spedizione Meridian.