Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Quando la notizia della Guerra Civile raggiunse il Minnesota, Bloomer e i suoi cugini si unirono alle guardie di Stillwater, un gruppo di milizie locali. Le Guardie furono arruolate nel Primo Reggimento di Fanteria Volontaria del Minnesota a Fort Snelling il 29 aprile 1861, formando il nucleo della Compagnia B. Bloomer ricevette inizialmente il grado di caporale e partecipò a tutti i principali scontri del reggimento fino alla battaglia di Antietam. Fu ferito leggermente alla testa nella battaglia di Bull Run. Durante la battaglia di Savage's Station
Il 29 giugno 1862, durante la Campagna della Penisola, Bloomer fu promosso a sergente. Nel bel mezzo del combattimento il portabandiera fu ucciso. Bloomer ha preso i colori, ed è stato separato dal reggimento per cinque ore. Ha restituito i colori al reggimento ed è stato promosso per il suo coraggio.