Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Rui Jorge ha allenato i portoghesi al torneo olimpico del 2016 in Brasile, dove hanno perso 4 a 0 contro la Germania nei quarti di finale. È stato anche responsabile dell'edizione 2017
del torneo continentale under-21, che si è concluso con l'uscita dalla fase a gironi. Il 10 ottobre 2017, sei anni dopo l'ultima sconfitta per quella fase della competizione, era in panchina mentre la squadra perdeva 1<unk>3 in Bosnia ed Erzegovina per le qualifiche del Campionato Europeo 2019.