Durante la Guerra Fredda, 13 AF rimasero nelle Filippine, fornendo la difesa aerea della nazione e diventando una delle Forze Aeree Numerate delle Forze Aeree del Pacifico (PACAF). Durante la guerra di Corea, le sue unità fornirono aree di sosta per le persone e le attrezzature destinate alla zona di guerra. Mentre la guerra del Vietnam si intensificava durante la fine degli anni '60 e l'inizio degli anni '70, la 13th AF forniva comando e controllo per le unità USAF di stanza in Thailandia, le sue unità conducevano missioni di combattimento in tutta l'Indocina fino all'agosto 1973. 13 unità AF impegnate in combattimento durante l'incidente di SS Mayaguez
Nel maggio del 1975.