Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Pinckney ha aiutato a formare e poi a guidare i St James Mounted Riflemen il cui scopo era difendere le varie piantagioni sul delta del fiume Santee dalle incursioni del Nord. Inoltre usò la sua terra alla piantagione di Echaw per costruire la Batteria Warren per proteggere un ponte ferroviario confederato sul fiume Santee. Nel corso del tempo lui e i suoi uomini furono riorganizzati sotto il comando dell'allora maggiore Arthur Middleton Manigualt a McClellanville e poi, più tardi, sotto il generale M. C. Butler furono inviati in Virginia. Alla battaglia di Haw's Shop
Pinckney e' stato catturato. Come prigioniero di guerra, fu quasi affamato a morte e tenuto in linea di fuoco a Morris Island dai soldati dell'Unione in rappresaglia per il trattamento dei soldati dell'Unione detenuti dalla Confederazione. Lui e gli altri così trattati divennero noti nella Confederazione come gli Immortali Seicento per il loro rifiuto di prestare giuramento di fedeltà agli Stati Uniti. Alla fine, Pinckney fu scambiato con soldati dell'Unione e rilasciato in libertà condizionata.