Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Il collegio ha subito gravi perdite umane e di capitale durante l'invasione svedese del 1656
E la peste del 1710, ma si e' ripresa. Dopo la soppressione dei gesuiti nel 1773, l'amministrazione del college fu rilevata dalla Commissione per l'educazione nazionale. Dopo la terza spartizione della Confederazione polacco-lituana, i carmelitani di Kolainiai amministrarono la scuola dal 1797 al 1817. Nel 1817, le autorità zariste secolarizzarono la scuola, cambiarono il suo nome in ginnasio, introdussero le classi di istruzione primaria e trasferirono la sua amministrazione all'Università di Vilnius. Così il numero degli studenti crebbe e superò i 400.