Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Nel 2002, Williams divenne manager degli Houston Astros. Mentre prestava servizio come allenatore della National League al 2004 All-Star Game a Houston <unk> in un momento in cui gli Astros stavano lottando al.500 <unk> la folla al Minute Maid Park di Houston ha risposto all'introduzione di Williams con una reazione decisamente mista, in contrasto con le ovazioni generalmente date ai membri della squadra di casa che vengono presentati a un All-Star game. Il giorno dopo, gli Astros licenziarono Williams e due allenatori principali, avendo probabilmente aspettato fino alla fine delle festività per evitare un imbarazzo pubblico. Williams è stato sostituito da Phil Garner, che ha portato gli Astros alla National League Championship Series del 2004
Ma mancava una partita per andare alla prima World Series di Houston. (L'anno successivo, Garner guidò gli Astros alle World Series.) Williams ha concluso con un record di 215 vittorie e 197 sconfitte.