Dopo aver raggiunto i loro obiettivi iniziali, i leader dell'UMNO hanno deciso di essere più coinvolti nel processo politico e di stabilire la loro organizzazione come partito politico per lottare per l'indipendenza. Allo stesso tempo, il Partito comunista malese (MCP) decise di lanciare un'insurrezione armata contro quello che consideravano uno stato fantoccio dei britannici, culminando nell'emergenza malese
che sarebbe durato fino a dopo l'indipendenza. L'insurrezione fu caratterizzata da una chiara divisione razziale; l'opposizione all'insurrezione era quasi interamente malese, mentre quelli visti combattere nei ranghi comunisti erano quasi sempre cinesi. Ciò ha esacerbato le tensioni razziali, portando gli inglesi a consigliare Onn Ja'afar di lavorare insieme ad altri leader della comunità malese a beneficio della politica malese. Alla fine, dopo alcuni incontri informali tra Onn, Tan Cheng Lock e l'E.E.C. Thuraisingham, fu istituito il Comitato di collegamento delle comunità (CLC). Il CLC divenne un punto focale per l'alto livello dei politici malesi nei prossimi anni, elaborando proposte e compromessi su una serie di questioni, tra cui cittadinanza, istruzione, democrazia e risoluzione dell'impasse su "ketuanan Melayu". Alla fine si decise che un "affare" sarebbe stato forgiato tra i malesi e i non malesi; in cambio di rinunciare al "ketuanan Melayu" (denominato la posizione speciale dei malesi), i malesi avrebbero ricevuto assistenza dai non malesi nel colmare il divario economico tra i malesi impoveriti e in gran parte rurali con i non malesi urbani sostanzialmente più ricchi. Thuraisingham disse in seguito: "È vero. Io e altri credevamo che i malesi arretrati avrebbero dovuto avere una situazione migliore. I malesi dovrebbero essere aiutati a raggiungere la parità con i non malesi per forgiare una nazione malese unita di uguali".