La prima partita di Bartra dopo il suo ritorno si è svolta il 20 maggio 2017 e ha giocato l'intera vittoria a casa 4-3 contro il SV Werder Bremen, essendo stato anche un sostituto non utilizzato nella partita precedente contro l'FC Augsburg. Una settimana dopo, ha contribuito alla conquista della DFB-Pokal dopo aver iniziato nella sconfitta 2<unk>1
di Eintracht Frankfurt a Berlino.