La reintroduzione di questo programma di coscrizione ha visto i numeri della CMF aumentare sostanzialmente ma la sua gestione e amministrazione ha richiesto l'assegnazione di un gran numero di risorse e personale dall'esercito regolare in un momento in cui l'esercito regolare era già pesantemente impegnato in Corea e Malesia
e così il programma fu sospeso nel 1959. Questo fu un duro colpo per la CMF e la sua forza diminuì di oltre la metà in quell'anno a 20.000 uomini. Ulteriori cambiamenti avvennero con l'introduzione della divisione pentropic (cinque gruppi di battaglia) nell'esercito australiano nel 1960. Questo si rivelò un disastro per la CMF, poiché furono effettuati cambiamenti di massa e le unità rimosse dall'ordine di battaglia. Sette reggimenti di artiglieria furono sciolti da un totale originale di 17, mentre 31 battaglioni di fanteria furono ridotti a 17. Questo escludeva i reggimenti universitari e i fucilieri volontari della Papua Nuova Guinea che rimasero invariati. I battaglioni rimanenti furono successivamente fusi in soli nove battaglioni. Nel frattempo, le unità corazzate della CMF erano già state razionalizzate nel 1957 e di conseguenza il cambiamento della struttura pentropica ha comportato principalmente un cambiamento di ruolo, come il 4th/19th Prince of Wales's Light Horse, che è passato da un'unità corazzata a un reggimento di ricognizione. Anche i due quartieri generali delle brigate corazzate della CMF sono stati sciolti.