I leoni nel Kenya orientale sono geneticamente molto più vicini ai leoni dell'Africa meridionale che ai leoni del Parco nazionale di Aberdare nel Kenya occidentale. In uno studio successivo, sono stati utilizzati campioni di tessuti e ossa di 32 esemplari di leoni nei musei. I risultati hanno indicato che i leoni formano tre gruppi filogeografici: uno ciascuno in Asia e Nord Africa, in Africa centrale e in Africa meridionale. Fino a 480 campioni di leoni provenienti da fino a 22 paesi sono stati analizzati in studi filogenetici successivi, con risultati che indicano due principali gruppi evolutivi.
a est del Rift dell'Africa orientale