Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Nystrom ha sviluppato uno stile di lavoro duro simile a quello di suo padre, che lo ha aiutato a guadagnare un invito a giocare con il National Development Program (USDP) degli Stati Uniti. Ha giocato 55 partite per l'USDP nella North American Hockey League nel 1999-2000, segnando sette gol e 23 punti. Ha diviso la stagione 2000-01 con il programma nazionale under-18 e la squadra junior della United States Hockey League, rappresentando anche gli Stati Uniti ai Campionati del Mondo U18 dell'IIHF del 2001. In seguito ha rappresentato gli Stati Uniti al 2002
e il Campionato Mondiale Junior di Hockey su Ghiaccio del 2003.