Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Un lungo periodo di addestramento seguì sulle Atherton Tablelands, poiché la politica interalleata portò a limitate opportunità per l'impiego di truppe australiane durante il 1944 e nel 1945. Di conseguenza, fu solo a metà del 1945 che il 2/32nd entrò nuovamente in battaglia. La campagna del Borneo alla fine si rivelò essere il loro coinvolgimento finale nella guerra. Durante le operazioni iniziali per catturare Labuan
, il battaglione rimase in riserva e arrivò a terra solo il 12 giugno. Il battaglione fu trasportato da Labuan a Padas Bay per quattro giorni, il 16 giugno, tramite imbarcazioni da sbarco, e successivamente prese parte alla cattura di Weston il giorno successivo. Il 2/32nd successivamente pattugliò verso Beaufort, portando avanti un attacco alla città in concerto con il 2/43rd Battalion il 26 giugno, per proteggere la linea ferroviaria Weston-Beaufort. Durante l'inizio di luglio il battaglione avanzò verso Papar. L'avanzata principale è stata effettuata lungo la linea ferroviaria con un movimento di fianco fornito da una compagnia che ha condotto un sbarco anfibio a sud; dopo queste mosse, la città è stata successivamente presa il 12 luglio 1945.