Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Schumacher ha continuato a Toyota ed è stato di nuovo partner di Trulli per il 2006. Era ambizioso per la prossima stagione: "Stiamo cercando di vincere alcune gare. Questo dovrebbe essere il nostro obiettivo e speriamo che sia realistico". Ha iniziato la stagione senza punti in Bahrain.
Entrambe le Toyota erano fuori passo, ma riuscì a segnare i primi punti della stagione per lui e la Toyota con l'ottavo posto in Malesia. E' riuscito ad assicurarsi il suo e l'unico podio della Toyota della stagione in Australia.