Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Il 1 novembre 1864, José Luís fu nominato comandante della 2a Divisione nell'esercito brasiliano principale, che allora era chiamato "Esercito del Sud" e guidato da suo zio il feldmaresciallo João Propício Mena Barreto (in seguito barone di São Gabriel). L'esercito del Sud invase l'Uruguay il 1° dicembre. José Luís partecipò all'assedio
della città uruguaiana di Paysandú, caduta il 2 gennaio 1865. L'esercito brasiliano e la forza alleata dei Colorados assediarono poi la capitale uruguaiana, Montevideo. Prima che potesse essere lanciato un attacco alla città, i Blancos capitularono, ponendo fine al conflitto.