Per risolvere le crisi economiche internazionali, tutte le nazioni si sono unite in un'unica entità, il Governo di Coalizione Mondiale. Il governo è totalitario, dicendo alla popolazione che ciò che sono in realtà regioni pericolosamente tossiche sono riserve selvagge, e usa le sue forze di polizia, la Task Force Crimini Tecnologici (TCTF), per sopprimere l'opposizione. Il personaggio del giocatore, con nome in codice Konoko (vocato da Amanda Winn-Lee), nome completo più tardi dato come Mai Hasegawa, inizia il gioco lavorando per il TCTF. Presto, scopre che i suoi datori di lavoro hanno tenuto segreti sul suo passato. Lei si rivolge contro di loro mentre si imbarca in una ricerca di auto-scoperta.
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