Scrivi una continuazione per questo paragrafo - L'indipendenza è stata dichiarata il 25 giugno 1991. In seguito Adria si trovò di fronte a circostanze completamente nuove. 28 giugno 1991
, l'Aeronautica federale jugoslava ha attaccato l'hangar di Adria, causando gravi danni a quattro aerei, all'edificio e ai veicoli. Un Airbus A320, vecchio di meno di un anno, fu gravemente danneggiato e fu portato a Toulouse più tardi quell'anno per quasi un anno di riparazioni. Inoltre, due Dash-7 e 1 DC-9-30 sono stati danneggiati, mentre altri aerei sono sopravvissuti dopo essere stati trasportati poche ore prima all'aeroporto più vicino di Klagenfurt. Adria era molto disabile quell'anno a causa dei problemi di assicurazione e registrazione.