Scrivi una continuazione per questo paragrafo - Pablo Morillo finalmente catturato
Santafé il 6 maggio 1816. Come gli altri leader del movimento indipendentista, Caldas fuggì dalla città, originariamente con l'obiettivo di arrivare a Buenaventura per fuggire all'estero. Lungo la strada, tuttavia, il futuro viceré Sámano vince le truppe repubblicane nella battaglia di la Cuchilla de El Tambo, e riconquista Popayán, e Caldas è costretto a nascondersi nella fattoria Paisbamba a Sotará, dove viene presto arrestato dai monarchici spagnoli nel 1816. Venne poi rimandato a Santafé, e fu giustiziato da un plotone di fucilazione il 29 ottobre 1816, nella piazza di San Francisco per ordine di Morillo, conte di Cartagena. Quando Caldas stava per essere giustiziato e le persone presenti al luogo fecero appello per la vita dello scienziato, Morillo rispose: "La Spagna non ha bisogno di sapienti" (in spagnolo: "España no necesita sabios"). Prima di morire Caldas scrisse sul muro una grande lettera greca θ, che è stata interpretata come un'esortazione: "Oh lunga e oscura partenza!" (Spagnolo: "¡Oh larga y negra partida!". Nell'Atene classica, Theta era usato come abbreviazione del greco θάνατος (thanatos, <unk>morte<unk>).