Dopo la Seconda Guerra Mondiale la capacità del Genoa di terminare nei ranghi superiori della Serie A è diminuita in modo significativo; per tutto il resto degli anni '40 il club è stato un intermedio. La stagione 1948/49
Tre risultati molto significativi: il Genoa batte l'Inter 4 a 1, il famoso "Grande Torino" 3 a 0 e il Padova 7 a 1. Gli anni '50 iniziarono male per il club, che aveva acquistato l'argentino Mario Boyé dal Boca Juniors, ma rimase solo una stagione e il club fu relegato dopo aver finito in fondo alla classifica, ma dopo due stagioni ottenne il suo ritorno dopo aver vinto la Serie B, davanti a Legnano. Ragnar Nikolay Larsen è stato un giocatore di spicco per il club durante questo periodo e hanno mantenuto i risultati a metà classifica per il resto del decennio.