Scrivi una continuazione per questo paragrafo - È comparso come testimone al processo di Slobodan Milošević presso il TPIY nel 2003. Questa apparizione ha rotto il suo silenzio di 12 anni; dopo quella testimonianza, ha dato un'intervista alla rivista di notizie "Globus" con sede a Zagabria. Nella sua testimonianza, ha dichiarato che Milošević stava ovviamente cercando di scolpire una Grande Serbia dalle rovine della Jugoslavia. Ha anche rivelato che sia Milošević che Tuđman gli hanno confermato che nel marzo 1991 a Karađorđevo hanno concluso un accordo per la spartizione della Bosnia-Erzegovina. Milošević rispose accusando Marković dell'intervento dell'esercito jugoslavo in Slovenia. Marković ha negato di ordinare l'intervento in Slovenia
, affermando che era al di fuori del suo mandato come primo ministro della Jugoslavia.